Protein–RNA interactions for Protein: Q9BUK0

CHCHD7, Coiled-coil-helix-coiled-coil-helix domain-containing protein 7, humanhuman

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Length 85 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHCHD7Q9BUK0 TFCP2-201ENST00000257915 3546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
CHCHD7Q9BUK0 RHD-202ENST00000342055 1557 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
CHCHD7Q9BUK0 METTL17-202ENST00000382985 1586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
CHCHD7Q9BUK0 ALDOA-209ENST00000563060 1550 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
CHCHD7Q9BUK0 APC2-201ENST00000233607 10151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
CHCHD7Q9BUK0 ATP6V0A1-203ENST00000393829 3028 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
CHCHD7Q9BUK0 CRCP-203ENST00000395326 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
CHCHD7Q9BUK0 NR3C1-203ENST00000394464 6795 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
CHCHD7Q9BUK0 CTBP1-AS2-206ENST00000581398 5652 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
CHCHD7Q9BUK0 NUP98-201ENST00000324932 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
CHCHD7Q9BUK0 FOSL2-201ENST00000264716 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
CHCHD7Q9BUK0 TFR2-201ENST00000223051 2888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
CHCHD7Q9BUK0 MST1P2-201ENST00000457982 2291 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
CHCHD7Q9BUK0 SEMA3F-202ENST00000413852 3212 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
CHCHD7Q9BUK0 CASC2-202ENST00000426021 3232 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
CHCHD7Q9BUK0 CHRNB4-201ENST00000261751 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
CHCHD7Q9BUK0 BLCAP-205ENST00000397137 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
CHCHD7Q9BUK0 ZNF846-201ENST00000397902 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
CHCHD7Q9BUK0 MFNG-202ENST00000416983 2034 ntTSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
CHCHD7Q9BUK0 GNAO1-201ENST00000262493 3337 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
CHCHD7Q9BUK0 RPUSD2-201ENST00000315616 2358 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
CHCHD7Q9BUK0 REPS1-221ENST00000626459 3665 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
CHCHD7Q9BUK0 SLC6A20-202ENST00000358525 5423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
CHCHD7Q9BUK0 NDUFV1-202ENST00000415352 1512 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
CHCHD7Q9BUK0 SPOCK3-210ENST00000506886 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
CHCHD7Q9BUK0 PPFIA3-203ENST00000602351 4341 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
CHCHD7Q9BUK0 B3GNT7-201ENST00000287590 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
CHCHD7Q9BUK0 MPDU1-201ENST00000250124 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
CHCHD7Q9BUK0 BDKRB2-201ENST00000539359 1600 ntTSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
CHCHD7Q9BUK0 JTB-201ENST00000271843 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
CHCHD7Q9BUK0 HIST2H3D-201ENST00000331491 411 ntAPPRIS P1 BASIC10.6□□□□□ -0.71
CHCHD7Q9BUK0 H3F3C-201ENST00000340398 1057 ntAPPRIS P1 BASIC10.6□□□□□ -0.71
CHCHD7Q9BUK0 MPV17-203ENST00000380044 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
CHCHD7Q9BUK0 HIST2H3PS2-201ENST00000392948 411 ntAPPRIS P1 BASIC10.6□□□□□ -0.71
CHCHD7Q9BUK0 MPV17-208ENST00000405076 603 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
CHCHD7Q9BUK0 CAMKMT-204ENST00000407131 652 ntTSL 3 BASIC10.6□□□□□ -0.71
CHCHD7Q9BUK0 AL161638.1-201ENST00000420354 481 ntTSL 3 BASIC10.6□□□□□ -0.71
CHCHD7Q9BUK0 VAT1-202ENST00000420567 1069 ntTSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
CHCHD7Q9BUK0 RFX3-AS1-201ENST00000423112 552 ntTSL 3 BASIC10.6□□□□□ -0.71
CHCHD7Q9BUK0 MOGAT3-203ENST00000440203 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
CHCHD7Q9BUK0 SLC35B4-204ENST00000470969 1033 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
CHCHD7Q9BUK0 SWI5-205ENST00000495313 466 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.6□□□□□ -0.71
CHCHD7Q9BUK0 AC113383.1-201ENST00000514696 582 ntTSL 4 BASIC10.6□□□□□ -0.71
CHCHD7Q9BUK0 IL32-211ENST00000525643 1272 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
CHCHD7Q9BUK0 IL32-213ENST00000528163 950 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
CHCHD7Q9BUK0 SCN4B-204ENST00000529878 566 ntTSL 4 BASIC10.6□□□□□ -0.71
CHCHD7Q9BUK0 AC009163.1-201ENST00000530512 573 ntTSL 4 BASIC10.6□□□□□ -0.71
CHCHD7Q9BUK0 IL32-231ENST00000551513 791 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.6□□□□□ -0.71
CHCHD7Q9BUK0 GCHFR-203ENST00000558670 412 ntTSL 3 BASIC10.6□□□□□ -0.71
CHCHD7Q9BUK0 AC010491.1-203ENST00000564167 638 ntTSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
CHCHD7Q9BUK0 AC243964.2-202ENST00000591312 752 ntTSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
CHCHD7Q9BUK0 BARD1-209ENST00000613192 703 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
CHCHD7Q9BUK0 AC243829.4-204ENST00000616926 1115 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
CHCHD7Q9BUK0 SLC35E2-202ENST00000355439 2078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
CHCHD7Q9BUK0 AXL-201ENST00000301178 4737 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
CHCHD7Q9BUK0 SLC4A7-210ENST00000440156 4120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
CHCHD7Q9BUK0 RERG-209ENST00000546331 1383 ntTSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
CHCHD7Q9BUK0 NRAS-201ENST00000369535 4449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
CHCHD7Q9BUK0 ZSWIM8-AS1-201ENST00000456638 1460 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
CHCHD7Q9BUK0 UVSSA-208ENST00000511563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
CHCHD7Q9BUK0 MUTYH-210ENST00000450313 1929 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
CHCHD7Q9BUK0 FBRS-201ENST00000287468 2811 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
CHCHD7Q9BUK0 SETD1B-203ENST00000604567 5969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
CHCHD7Q9BUK0 MARK3-205ENST00000429436 3371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
CHCHD7Q9BUK0 AFAP1-201ENST00000358461 7516 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
CHCHD7Q9BUK0 ABCG1-203ENST00000361802 3034 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
CHCHD7Q9BUK0 A1BG-AS1-204ENST00000595302 2130 ntTSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
CHCHD7Q9BUK0 MEGF11-204ENST00000422354 5914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
CHCHD7Q9BUK0 CHRDL1-204ENST00000444321 1658 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
CHCHD7Q9BUK0 OAS1-202ENST00000445409 1684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
CHCHD7Q9BUK0 MAGI1-201ENST00000330909 7415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
CHCHD7Q9BUK0 PTPN5-204ENST00000396170 3871 ntTSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
CHCHD7Q9BUK0 CNOT3-201ENST00000221232 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
CHCHD7Q9BUK0 PRSS30P-201ENST00000390681 2881 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
CHCHD7Q9BUK0 MAPT-215ENST00000574436 1326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
CHCHD7Q9BUK0 PDLIM5-202ENST00000318007 1960 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
CHCHD7Q9BUK0 CSAD-203ENST00000379846 1962 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
CHCHD7Q9BUK0 OXA1L-203ENST00000412791 1440 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
CHCHD7Q9BUK0 ECHDC1-220ENST00000528402 1449 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
CHCHD7Q9BUK0 SUSD5-201ENST00000309558 5008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
CHCHD7Q9BUK0 GSTCD-206ENST00000507281 2091 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
CHCHD7Q9BUK0 ECSIT-201ENST00000252440 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
CHCHD7Q9BUK0 TRIM13-201ENST00000356017 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
CHCHD7Q9BUK0 TPD52L2-206ENST00000358548 2275 ntTSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
CHCHD7Q9BUK0 MKS1-202ENST00000393119 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
CHCHD7Q9BUK0 DDX19A-202ENST00000417604 1703 ntTSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
CHCHD7Q9BUK0 PAX3-203ENST00000344493 3109 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
CHCHD7Q9BUK0 SMTN-202ENST00000347557 3130 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
CHCHD7Q9BUK0 GFRA1-201ENST00000355422 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
CHCHD7Q9BUK0 NAXD-201ENST00000309957 2659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
CHCHD7Q9BUK0 WSCD1-202ENST00000539421 2665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
CHCHD7Q9BUK0 ATP2B3-204ENST00000370186 6742 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
CHCHD7Q9BUK0 TMEM63C-201ENST00000298351 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
CHCHD7Q9BUK0 ARVCF-203ENST00000406259 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
CHCHD7Q9BUK0 POLR3GL-202ENST00000369314 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
CHCHD7Q9BUK0 FAM19A3-202ENST00000369630 1282 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
CHCHD7Q9BUK0 WFDC3-204ENST00000372632 704 ntTSL 3 BASIC10.59□□□□□ -0.71
CHCHD7Q9BUK0 PIR-201ENST00000380420 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
CHCHD7Q9BUK0 SPECC1-202ENST00000395522 2982 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
CHCHD7Q9BUK0 CALD1-206ENST00000424922 2124 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
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