Protein–RNA interactions for Protein: Q9BPW8

NIPSNAP1, Protein NipSnap homolog 1, humanhuman

Predictions only

Length 284 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NIPSNAP1Q9BPW8 SCN3B-201ENST00000299333 5665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
NIPSNAP1Q9BPW8 TMEM40-204ENST00000435218 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
NIPSNAP1Q9BPW8 KRT8P24-201ENST00000560290 1559 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
NIPSNAP1Q9BPW8 CTD-2194D22.4-201ENST00000514569 1635 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
NIPSNAP1Q9BPW8 AL158070.2-201ENST00000623713 1621 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
NIPSNAP1Q9BPW8 DNMT3L-201ENST00000270172 1706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
NIPSNAP1Q9BPW8 DOK1-202ENST00000340004 1722 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
NIPSNAP1Q9BPW8 PKM-220ENST00000568459 1806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
NIPSNAP1Q9BPW8 EPHB4-210ENST00000616502 3737 ntTSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
NIPSNAP1Q9BPW8 CPSF6-203ENST00000456847 1915 ntTSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
NIPSNAP1Q9BPW8 FAM122A-201ENST00000394264 4575 ntAPPRIS P1 BASIC13.78□□□□□ -0.2
NIPSNAP1Q9BPW8 KRT75-201ENST00000252245 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
NIPSNAP1Q9BPW8 AXL-201ENST00000301178 4737 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
NIPSNAP1Q9BPW8 AGAP9-201ENST00000452145 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
NIPSNAP1Q9BPW8 PRNP-203ENST00000430350 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
NIPSNAP1Q9BPW8 MKNK1-204ENST00000371946 2719 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
NIPSNAP1Q9BPW8 HSD17B4-206ENST00000504811 2740 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.2
NIPSNAP1Q9BPW8 APLP2-203ENST00000338167 3270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
NIPSNAP1Q9BPW8 FAM120C-201ENST00000328235 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
NIPSNAP1Q9BPW8 GSPT1-202ENST00000434724 7105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
NIPSNAP1Q9BPW8 KIAA0141-201ENST00000194118 2203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
NIPSNAP1Q9BPW8 ATP6V1C2-201ENST00000272238 1565 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
NIPSNAP1Q9BPW8 PIP4K2A-201ENST00000323883 1319 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
NIPSNAP1Q9BPW8 TUBA8-202ENST00000330423 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
NIPSNAP1Q9BPW8 COL17A1-201ENST00000353479 5734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
NIPSNAP1Q9BPW8 TRIM13-201ENST00000356017 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
NIPSNAP1Q9BPW8 PKIG-203ENST00000372887 769 ntTSL 3 BASIC13.77□□□□□ -0.21
NIPSNAP1Q9BPW8 LRRC37A5P-201ENST00000374304 1103 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
NIPSNAP1Q9BPW8 NQO2-202ENST00000380430 1098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
NIPSNAP1Q9BPW8 ELN-210ENST00000380584 3214 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
NIPSNAP1Q9BPW8 RSPO1-202ENST00000401068 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
NIPSNAP1Q9BPW8 STAG3L2-201ENST00000426587 2130 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
NIPSNAP1Q9BPW8 LINC01264-201ENST00000431395 500 ntTSL 3 BASIC13.77□□□□□ -0.21
NIPSNAP1Q9BPW8 APOA1-AS-201ENST00000444200 563 ntTSL 4 BASIC13.77□□□□□ -0.21
NIPSNAP1Q9BPW8 DNAJB3-201ENST00000446806 729 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
NIPSNAP1Q9BPW8 BX322559.1-201ENST00000456613 319 ntTSL 3 BASIC13.77□□□□□ -0.21
NIPSNAP1Q9BPW8 NECAP2-203ENST00000457722 935 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
NIPSNAP1Q9BPW8 HFE2-205ENST00000497365 1419 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
NIPSNAP1Q9BPW8 INS-205ENST00000512523 297 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
NIPSNAP1Q9BPW8 HDAC2-AS2-213ENST00000520891 603 ntTSL 4 BASIC13.77□□□□□ -0.21
NIPSNAP1Q9BPW8 TAPBPL-205ENST00000544021 772 ntTSL 3 BASIC13.77□□□□□ -0.21
NIPSNAP1Q9BPW8 AL512356.2-201ENST00000546955 174 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
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NIPSNAP1Q9BPW8 AC068594.1-203ENST00000581153 695 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
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NIPSNAP1Q9BPW8 AL359644.1-202ENST00000637541 571 ntTSL 3 BASIC13.77□□□□□ -0.21
NIPSNAP1Q9BPW8 NTRK2-202ENST00000304053 8226 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
NIPSNAP1Q9BPW8 RIMS3-202ENST00000372684 7235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
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NIPSNAP1Q9BPW8 UHRF1BP1L-201ENST00000279907 5168 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
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NIPSNAP1Q9BPW8 HS1BP3-201ENST00000304031 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
NIPSNAP1Q9BPW8 CCNG1-202ENST00000393929 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
NIPSNAP1Q9BPW8 GRIN2C-201ENST00000293190 4261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
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NIPSNAP1Q9BPW8 ZNF674-AS1-201ENST00000421685 2078 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
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NIPSNAP1Q9BPW8 FGF12-207ENST00000454309 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
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NIPSNAP1Q9BPW8 TBC1D24-207ENST00000627285 4382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
NIPSNAP1Q9BPW8 FEM1B-201ENST00000306917 7122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
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NIPSNAP1Q9BPW8 DUSP26-203ENST00000523956 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
NIPSNAP1Q9BPW8 AL583722.1-201ENST00000540171 1307 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
NIPSNAP1Q9BPW8 CNDP2-201ENST00000324262 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
NIPSNAP1Q9BPW8 TM4SF19-201ENST00000273695 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
NIPSNAP1Q9BPW8 TNNT1-201ENST00000291901 967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
NIPSNAP1Q9BPW8 SPEM1-201ENST00000323675 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
NIPSNAP1Q9BPW8 ATP1A1-AS1-202ENST00000369492 1011 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
NIPSNAP1Q9BPW8 CYB561D1-202ENST00000369868 1085 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
NIPSNAP1Q9BPW8 LENEP-202ENST00000392487 555 ntAPPRIS P1 BASIC13.76□□□□□ -0.21
NIPSNAP1Q9BPW8 TAS2R41-201ENST00000408916 924 ntAPPRIS P1 BASIC13.76□□□□□ -0.21
NIPSNAP1Q9BPW8 AL121832.1-203ENST00000433121 475 ntTSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
NIPSNAP1Q9BPW8 C2orf88-205ENST00000443551 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
NIPSNAP1Q9BPW8 AC004865.2-202ENST00000444348 852 ntTSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
NIPSNAP1Q9BPW8 AC069262.1-201ENST00000539058 672 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
NIPSNAP1Q9BPW8 PYCR1-207ENST00000577756 1144 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
NIPSNAP1Q9BPW8 TGOLN2-203ENST00000398263 6138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
NIPSNAP1Q9BPW8 COL5A1-208ENST00000618395 8437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
NIPSNAP1Q9BPW8 CEP131-202ENST00000374782 3505 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
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