Protein–RNA interactions for Protein: Q99536

VAT1, Synaptic vesicle membrane protein VAT-1 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 393 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAT1Q99536 MSTO2P-201ENST00000314835 1709 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
VAT1Q99536 TMEM258-207ENST00000543510 1692 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
VAT1Q99536 CRISPLD2-203ENST00000564567 1651 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
VAT1Q99536 AL138709.1-201ENST00000614840 1693 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
VAT1Q99536 APAF1-203ENST00000359972 7029 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
VAT1Q99536 USP25-201ENST00000285679 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
VAT1Q99536 ARFIP1-202ENST00000356064 1302 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
VAT1Q99536 AURKC-203ENST00000448930 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
VAT1Q99536 SCYL1-201ENST00000270176 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
VAT1Q99536 FAM219A-206ENST00000379087 3573 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC15.26■□□□□ 0.03
VAT1Q99536 AC006262.1-203ENST00000598170 1634 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
VAT1Q99536 PXDNL-201ENST00000356297 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
VAT1Q99536 BX640514.1-201ENST00000583223 1918 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
VAT1Q99536 SS18L2-201ENST00000011691 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
VAT1Q99536 MGST3-203ENST00000367885 680 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
VAT1Q99536 AC005229.1-201ENST00000392885 409 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
VAT1Q99536 AL355864.2-201ENST00000447420 863 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
VAT1Q99536 RAD51D-205ENST00000460118 1064 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
VAT1Q99536 AC093904.1-201ENST00000474561 455 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
VAT1Q99536 SEPT7P9-202ENST00000489259 743 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
VAT1Q99536 SPDYE16-201ENST00000515340 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
VAT1Q99536 AC022447.6-201ENST00000515522 438 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
VAT1Q99536 AC131206.1-201ENST00000538078 1211 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
VAT1Q99536 VPS18-202ENST00000558474 873 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
VAT1Q99536 AC011489.1-202ENST00000586556 618 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
VAT1Q99536 IFI27-210ENST00000616764 716 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
VAT1Q99536 AC010507.1-202ENST00000633286 381 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
VAT1Q99536 SGCZ-201ENST00000382080 2234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
VAT1Q99536 ALDH8A1-204ENST00000367847 1587 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
VAT1Q99536 RPARP-AS1-202ENST00000492465 1556 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
VAT1Q99536 TRAF7-201ENST00000326181 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
VAT1Q99536 ELOA-204ENST00000613537 4924 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
VAT1Q99536 PPP2R1B-203ENST00000393055 1525 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
VAT1Q99536 JKAMP-207ENST00000554271 2137 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
VAT1Q99536 DMTN-206ENST00000443491 2415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
VAT1Q99536 FOXB1-201ENST00000396057 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
VAT1Q99536 SPHK2-210ENST00000599748 2683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
VAT1Q99536 DMRT2-202ENST00000302441 1495 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
VAT1Q99536 VARS2-201ENST00000321897 4073 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
VAT1Q99536 MAPT-206ENST00000415613 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
VAT1Q99536 ZSWIM8-221ENST00000604729 6075 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
VAT1Q99536 SEPT9-244ENST00000592420 2588 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
VAT1Q99536 KCTD7-206ENST00000639828 5951 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
VAT1Q99536 CRB2-201ENST00000359999 3659 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
VAT1Q99536 BARHL2-201ENST00000370445 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
VAT1Q99536 CDC25B-203ENST00000344256 3071 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
VAT1Q99536 AKAP2-203ENST00000434623 4400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
VAT1Q99536 FBLN7-203ENST00000409450 1394 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
VAT1Q99536 TSFM-207ENST00000540550 1935 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
VAT1Q99536 OR4D1-202ENST00000641449 4925 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
VAT1Q99536 MYH6-201ENST00000356287 5871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
VAT1Q99536 A1BG-AS1-204ENST00000595302 2130 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
VAT1Q99536 VGLL4-202ENST00000413604 1554 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
VAT1Q99536 VWA7-201ENST00000375688 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
VAT1Q99536 AC092135.3-201ENST00000624151 1846 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
VAT1Q99536 HNRNPU-201ENST00000283179 3120 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
VAT1Q99536 LARGE1-201ENST00000354992 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
VAT1Q99536 SLC35E2-202ENST00000355439 2078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
VAT1Q99536 CUX1-214ENST00000550008 4350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
VAT1Q99536 GAL-201ENST00000265643 818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
VAT1Q99536 FIBP-201ENST00000338369 1261 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
VAT1Q99536 SFT2D1-201ENST00000361731 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
VAT1Q99536 GNG5-201ENST00000370641 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
VAT1Q99536 KRTAP10-1-201ENST00000400375 1215 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
VAT1Q99536 POM121L8P-201ENST00000417732 1281 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
VAT1Q99536 ABHD11-AS1-201ENST00000427153 662 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
VAT1Q99536 POM121L9P-203ENST00000441984 1285 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
VAT1Q99536 LINC00473-201ENST00000444465 798 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
VAT1Q99536 HHEX-203ENST00000492654 808 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
VAT1Q99536 SLC25A30-AS1-201ENST00000506633 701 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
VAT1Q99536 LINC02242-201ENST00000507298 641 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
VAT1Q99536 AP001889.1-201ENST00000525414 633 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
VAT1Q99536 ZNF710-AS1-201ENST00000558334 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
VAT1Q99536 ANAPC11-215ENST00000578550 599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
VAT1Q99536 AC027575.2-201ENST00000585258 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
VAT1Q99536 TRAPPC6A-204ENST00000588062 695 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
VAT1Q99536 EGLN2-209ENST00000594140 991 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
VAT1Q99536 AC004466.1-201ENST00000599515 1080 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
VAT1Q99536 AC138696.2-201ENST00000607376 223 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
VAT1Q99536 STUM-202ENST00000366789 4093 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
VAT1Q99536 NEURL1-201ENST00000369780 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
VAT1Q99536 CTCFL-210ENST00000481655 1512 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
VAT1Q99536 COL17A1-201ENST00000353479 5734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
VAT1Q99536 MYLK2-202ENST00000375994 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
VAT1Q99536 COL25A1-203ENST00000399132 2724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
VAT1Q99536 HCK-209ENST00000538448 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
VAT1Q99536 AC004754.1-201ENST00000600536 2242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
VAT1Q99536 SLC5A10-202ENST00000395643 1982 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
VAT1Q99536 HNF4G-201ENST00000354370 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
VAT1Q99536 RTEL1-201ENST00000318100 4676 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
VAT1Q99536 PTPN5-204ENST00000396170 3871 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
VAT1Q99536 C4A-259ENST00000498271 5269 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
VAT1Q99536 SYTL3-205ENST00000611299 2896 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
VAT1Q99536 ECHDC1-220ENST00000528402 1449 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
VAT1Q99536 SIGLEC5-201ENST00000534261 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
VAT1Q99536 ME2-201ENST00000321341 9415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
VAT1Q99536 NBEA-208ENST00000629018 10791 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
VAT1Q99536 PMM2-201ENST00000268261 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
VAT1Q99536 TIFA-201ENST00000361717 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
VAT1Q99536 LINC01285-201ENST00000412422 2289 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.6 ms