Protein–RNA interactions for Protein: Q96ST3

SIN3A, Paired amphipathic helix protein Sin3a, humanhuman

Predictions only

Length 1,273 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIN3AQ96ST3 AC099552.1-201ENST00000431083 744 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SIN3AQ96ST3 ANAPC15-208ENST00000538393 867 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SIN3AQ96ST3 AL583810.1-201ENST00000553344 1045 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
SIN3AQ96ST3 ACAP1-208ENST00000574499 412 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SIN3AQ96ST3 FBXL12-211ENST00000591009 1005 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SIN3AQ96ST3 SLC35E2-202ENST00000355439 2078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SIN3AQ96ST3 SIGLEC6-202ENST00000346477 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SIN3AQ96ST3 NSMCE3-201ENST00000332303 4838 ntAPPRIS P1 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SIN3AQ96ST3 SEPT9-244ENST00000592420 2588 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SIN3AQ96ST3 AP001627.1-201ENST00000437426 1754 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SIN3AQ96ST3 ACSL1-208ENST00000507295 2490 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SIN3AQ96ST3 AC006504.5-208ENST00000588784 2401 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
SIN3AQ96ST3 HCG27-201ENST00000383331 1720 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SIN3AQ96ST3 LRRC20-204ENST00000373224 3095 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SIN3AQ96ST3 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SIN3AQ96ST3 GPSM1-205ENST00000440944 3633 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SIN3AQ96ST3 SV2A-201ENST00000369145 2903 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SIN3AQ96ST3 NFE2L2-201ENST00000397062 2853 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SIN3AQ96ST3 PXN-207ENST00000536957 4112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SIN3AQ96ST3 RAVER2-202ENST00000371072 4362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SIN3AQ96ST3 FBXL19-202ENST00000380310 3796 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SIN3AQ96ST3 CLK4-201ENST00000316308 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SIN3AQ96ST3 TRAF6-201ENST00000348124 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SIN3AQ96ST3 AC108134.1-201ENST00000382225 3061 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SIN3AQ96ST3 ABCB8-201ENST00000297504 2487 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SIN3AQ96ST3 PIDD1-201ENST00000347755 2998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SIN3AQ96ST3 OPN4-202ENST00000372071 2401 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SIN3AQ96ST3 JPH4-205ENST00000622501 3489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SIN3AQ96ST3 AC099850.1-201ENST00000451775 1338 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SIN3AQ96ST3 CCDC22-201ENST00000376227 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SIN3AQ96ST3 SLC41A3-204ENST00000383598 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SIN3AQ96ST3 MAPK15-203ENST00000395108 765 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SIN3AQ96ST3 DRGX-202ENST00000434016 955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SIN3AQ96ST3 HIST2H2BB-201ENST00000449108 381 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
SIN3AQ96ST3 TMEM225B-203ENST00000453227 1041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SIN3AQ96ST3 ANAPC13-205ENST00000511751 896 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SIN3AQ96ST3 HDAC2-AS2-213ENST00000520891 603 ntTSL 4 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SIN3AQ96ST3 XRCC3-210ENST00000554974 575 ntTSL 4 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SIN3AQ96ST3 AC011510.1-201ENST00000598541 286 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SIN3AQ96ST3 AL121944.1-201ENST00000605945 686 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SIN3AQ96ST3 SH3RF1-201ENST00000284637 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SIN3AQ96ST3 MAN2A2-216ENST00000559717 6704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SIN3AQ96ST3 SCAP-206ENST00000428413 3749 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SIN3AQ96ST3 UBA1-201ENST00000335972 3559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SIN3AQ96ST3 BICD2-201ENST00000356884 6427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SIN3AQ96ST3 PRMT7-203ENST00000449359 2091 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SIN3AQ96ST3 IQCE-217ENST00000623361 6775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SIN3AQ96ST3 RBBP8-201ENST00000327155 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SIN3AQ96ST3 EDEM2-202ENST00000374492 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SIN3AQ96ST3 ABHD16A-202ENST00000440843 1906 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SIN3AQ96ST3 C1orf159-202ENST00000379320 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
SIN3AQ96ST3 KREMEN1-201ENST00000327813 2719 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
SIN3AQ96ST3 MLF1-217ENST00000619577 2290 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
SIN3AQ96ST3 ELAVL3-201ENST00000359227 4729 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.06
SIN3AQ96ST3 CCDC47-201ENST00000225726 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
SIN3AQ96ST3 CAP2-206ENST00000489374 1430 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
SIN3AQ96ST3 AC004754.1-201ENST00000600536 2242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
SIN3AQ96ST3 FOS-201ENST00000303562 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
SIN3AQ96ST3 PRG2-202ENST00000525955 1367 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
SIN3AQ96ST3 UPK3A-201ENST00000216211 1051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SIN3AQ96ST3 TMEM14B-210ENST00000473276 730 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
SIN3AQ96ST3 AC093525.1-201ENST00000569317 596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
SIN3AQ96ST3 AP002360.2-202ENST00000572035 738 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
SIN3AQ96ST3 Six3os1_5.1-201ENST00000611000 271 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
SIN3AQ96ST3 TMEM14B-220ENST00000612333 888 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
SIN3AQ96ST3 CA12-202ENST00000344366 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SIN3AQ96ST3 TMEM189-203ENST00000371656 1973 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
SIN3AQ96ST3 KCNQ4-201ENST00000347132 4099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SIN3AQ96ST3 RCC2-202ENST00000375436 4087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SIN3AQ96ST3 DNAI1-209ENST00000614641 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
SIN3AQ96ST3 CELF2-206ENST00000608830 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SIN3AQ96ST3 CDCA7-202ENST00000347703 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SIN3AQ96ST3 CLEC18A-201ENST00000288040 2155 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SIN3AQ96ST3 LPAR5-201ENST00000329858 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SIN3AQ96ST3 MICB-201ENST00000252229 2446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SIN3AQ96ST3 VAT1-201ENST00000355653 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SIN3AQ96ST3 KLK5-202ENST00000391809 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SIN3AQ96ST3 LINC00924-202ENST00000556053 2682 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SIN3AQ96ST3 TPGS2-202ENST00000383056 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SIN3AQ96ST3 AL023775.1-201ENST00000454907 1746 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
SIN3AQ96ST3 CDK16-211ENST00000518022 2022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SIN3AQ96ST3 ASB10-204ENST00000420175 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SIN3AQ96ST3 SLC1A7-206ENST00000620347 2873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SIN3AQ96ST3 C3orf62-201ENST00000343010 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SIN3AQ96ST3 PDE4DIP-201ENST00000313431 5676 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SIN3AQ96ST3 ZFP41-201ENST00000330701 4797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SIN3AQ96ST3 RPARP-AS1-202ENST00000492465 1556 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SIN3AQ96ST3 NEU2-201ENST00000233840 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SIN3AQ96ST3 TPM2-202ENST00000360958 1189 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SIN3AQ96ST3 PHACTR1-202ENST00000379329 707 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SIN3AQ96ST3 AL157392.1-201ENST00000412388 373 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SIN3AQ96ST3 ROPN1-207ENST00000484329 566 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SIN3AQ96ST3 ACR-203ENST00000529621 708 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SIN3AQ96ST3 RNF41-210ENST00000552244 716 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SIN3AQ96ST3 AC000032.1-201ENST00000562538 491 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SIN3AQ96ST3 LINC00621-201ENST00000577004 1177 ntTSL 4 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SIN3AQ96ST3 AC002472.3-201ENST00000640124 621 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
SIN3AQ96ST3 PRNP-201ENST00000379440 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SIN3AQ96ST3 PIANP-202ENST00000534837 2695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SIN3AQ96ST3 CTCFL-210ENST00000481655 1512 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.1 ms