Protein–RNA interactions for Protein: Q96LT4

SAMD8, Sphingomyelin synthase-related protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 415 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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SAMD8Q96LT4 CLEC16A-202ENST00000409552 3365 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
SAMD8Q96LT4 GPR83-201ENST00000243673 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
SAMD8Q96LT4 ECSIT-201ENST00000252440 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
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