Protein–RNA interactions for Protein: Q96DM3

C18orf8, Uncharacterized protein C18orf8, humanhuman

Predictions only

Length 657 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C18orf8Q96DM3 KIF22-208ENST00000569382 2020 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
C18orf8Q96DM3 TRAF3-202ENST00000351691 2239 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
C18orf8Q96DM3 WSB2-202ENST00000441406 1353 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
C18orf8Q96DM3 RDX-218ENST00000544551 4117 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
C18orf8Q96DM3 SLC38A10-202ENST00000374759 4300 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
C18orf8Q96DM3 SUMO3-203ENST00000397898 1779 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
C18orf8Q96DM3 CYB561-201ENST00000360793 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
C18orf8Q96DM3 TGOLN2-203ENST00000398263 6138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
C18orf8Q96DM3 COQ7-209ENST00000569127 2575 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
C18orf8Q96DM3 SOGA3-201ENST00000465909 3756 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
C18orf8Q96DM3 CEP170B-203ENST00000453495 6813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
C18orf8Q96DM3 DDX19A-202ENST00000417604 1703 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
C18orf8Q96DM3 SEPT8-212ENST00000458488 1726 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
C18orf8Q96DM3 POLD3-208ENST00000532497 1700 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
C18orf8Q96DM3 AC113367.3-201ENST00000508316 1912 ntBASIC16■□□□□ 0.15
C18orf8Q96DM3 BBS1-225ENST00000630659 1934 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
C18orf8Q96DM3 SLC7A4-202ENST00000403586 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
C18orf8Q96DM3 RUSC1-202ENST00000368347 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
C18orf8Q96DM3 TTLL10-AS1-201ENST00000379317 3532 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
C18orf8Q96DM3 RNF122-201ENST00000256257 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
C18orf8Q96DM3 TLX1NB-202ENST00000445873 1862 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
C18orf8Q96DM3 VAPA-201ENST00000340541 1227 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
C18orf8Q96DM3 PGGT1BP2-201ENST00000398621 1028 ntBASIC16■□□□□ 0.15
C18orf8Q96DM3 FAM104B-207ENST00000489298 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
C18orf8Q96DM3 HHEX-203ENST00000492654 808 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
C18orf8Q96DM3 LINC01585-201ENST00000500496 1295 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
C18orf8Q96DM3 KRT18P25-201ENST00000508931 1278 ntBASIC16■□□□□ 0.15
C18orf8Q96DM3 AC012640.1-201ENST00000509915 688 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
C18orf8Q96DM3 CCDC25-209ENST00000522915 785 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
C18orf8Q96DM3 EEF1D-207ENST00000524624 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
C18orf8Q96DM3 GABARAPL2-202ENST00000563744 791 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
C18orf8Q96DM3 AC009486.1-201ENST00000569860 813 ntBASIC16■□□□□ 0.15
C18orf8Q96DM3 MIR3197-201ENST00000582241 73 ntBASIC16■□□□□ 0.15
C18orf8Q96DM3 ZNF180-204ENST00000586637 1023 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
C18orf8Q96DM3 RBP1-207ENST00000619087 516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
C18orf8Q96DM3 AC025048.6-201ENST00000634326 1161 ntBASIC16■□□□□ 0.15
C18orf8Q96DM3 KIAA0930-203ENST00000391627 2623 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
C18orf8Q96DM3 SHTN1-204ENST00000392903 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
C18orf8Q96DM3 ZMYND15-204ENST00000573751 2409 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
C18orf8Q96DM3 RTP1-201ENST00000312295 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
C18orf8Q96DM3 TUBB4B-201ENST00000340384 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
C18orf8Q96DM3 MIF4GD-208ENST00000579297 1419 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
C18orf8Q96DM3 TRMT1-201ENST00000221504 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
C18orf8Q96DM3 PREP-201ENST00000369110 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
C18orf8Q96DM3 RIMS3-202ENST00000372684 7235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
C18orf8Q96DM3 KRTAP10-7-201ENST00000609664 1578 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
C18orf8Q96DM3 KCND3-201ENST00000302127 2659 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
C18orf8Q96DM3 MAP3K11-208ENST00000530153 2830 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
C18orf8Q96DM3 SLC29A1-204ENST00000371731 2258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
C18orf8Q96DM3 GINS3-203ENST00000426538 1728 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
C18orf8Q96DM3 PUS1-202ENST00000376649 4094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
C18orf8Q96DM3 CCHCR1-201ENST00000376266 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
C18orf8Q96DM3 AC018442.1-201ENST00000421439 2061 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
C18orf8Q96DM3 IGSF1-204ENST00000370903 4594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
C18orf8Q96DM3 ZNF789-201ENST00000331410 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
C18orf8Q96DM3 FGR-203ENST00000374005 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
C18orf8Q96DM3 RUNX1-202ENST00000344691 7274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
C18orf8Q96DM3 SLC22A12-203ENST00000377572 2887 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
C18orf8Q96DM3 UBAP1-202ENST00000359544 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
C18orf8Q96DM3 UNQ6494-202ENST00000617436 2163 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
C18orf8Q96DM3 NR1H3-203ENST00000405853 1480 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
C18orf8Q96DM3 CATSPER2P1-203ENST00000429276 1466 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
C18orf8Q96DM3 ABCG1-201ENST00000343687 3037 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
C18orf8Q96DM3 ASPH-202ENST00000379449 1603 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
C18orf8Q96DM3 ADAMTSL1-208ENST00000380570 931 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
C18orf8Q96DM3 AL929472.3-201ENST00000433474 700 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
C18orf8Q96DM3 CR589904.1-201ENST00000437830 732 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
C18orf8Q96DM3 AC022137.2-201ENST00000503482 481 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
C18orf8Q96DM3 ZNF710-AS1-201ENST00000558334 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
C18orf8Q96DM3 AC027575.2-201ENST00000585258 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
C18orf8Q96DM3 AC111170.2-201ENST00000585369 768 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
C18orf8Q96DM3 AC008805.2-201ENST00000590069 435 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
C18orf8Q96DM3 NDUFB1-207ENST00000617122 417 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
C18orf8Q96DM3 OPA1-208ENST00000392438 6340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
C18orf8Q96DM3 ZFYVE28-201ENST00000290974 4131 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
C18orf8Q96DM3 PRPS1-204ENST00000372435 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
C18orf8Q96DM3 TNIP1-214ENST00000522226 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
C18orf8Q96DM3 OGDH-204ENST00000443864 1744 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
C18orf8Q96DM3 SRSF8-201ENST00000587424 4028 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
C18orf8Q96DM3 KIF17-201ENST00000247986 3969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
C18orf8Q96DM3 SLC6A20-204ENST00000456124 2662 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
C18orf8Q96DM3 LRRC59-203ENST00000576448 1531 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
C18orf8Q96DM3 RTN4IP1-201ENST00000369063 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
C18orf8Q96DM3 ZNF74-209ENST00000611540 3714 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
C18orf8Q96DM3 PES1-201ENST00000335214 1988 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
C18orf8Q96DM3 LDLRAD4-205ENST00000585931 2118 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
C18orf8Q96DM3 EGOT-201ENST00000414938 1464 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
C18orf8Q96DM3 DTX3-202ENST00000548198 3199 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
C18orf8Q96DM3 AL365205.1-204ENST00000359201 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
C18orf8Q96DM3 OS9-204ENST00000389146 2091 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
C18orf8Q96DM3 SLC35C2-204ENST00000372230 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
C18orf8Q96DM3 RSPH9-201ENST00000372163 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
C18orf8Q96DM3 POLR2E-213ENST00000615234 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
C18orf8Q96DM3 GPRC5C-202ENST00000392627 2988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
C18orf8Q96DM3 PCDHB13-201ENST00000341948 5061 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
C18orf8Q96DM3 SS18L2-201ENST00000011691 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
C18orf8Q96DM3 CHST5-201ENST00000336257 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
C18orf8Q96DM3 FIBP-201ENST00000338369 1261 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
C18orf8Q96DM3 FAM163A-201ENST00000341785 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
C18orf8Q96DM3 PFDN6-202ENST00000374607 598 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.1 ms