Protein–RNA interactions for Protein: Q8TDD5

MCOLN3, Mucolipin-3, humanhuman

Predictions only

Length 553 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCOLN3Q8TDD5 ZMYND10-202ENST00000360165 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
MCOLN3Q8TDD5 B3GNTL1-211ENST00000576599 1787 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
MCOLN3Q8TDD5 AMT-202ENST00000395338 1831 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
MCOLN3Q8TDD5 PDE7A-203ENST00000401827 3673 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
MCOLN3Q8TDD5 PRR23C-201ENST00000413199 2791 ntAPPRIS P1 BASIC14.82□□□□□ -0.04
MCOLN3Q8TDD5 CCDC22-201ENST00000376227 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
MCOLN3Q8TDD5 GOLGA8M-201ENST00000563027 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
MCOLN3Q8TDD5 XRCC1-201ENST00000262887 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
MCOLN3Q8TDD5 C12orf73-207ENST00000549478 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
MCOLN3Q8TDD5 BANP-203ENST00000393207 2438 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
MCOLN3Q8TDD5 SLC16A1-207ENST00000538576 4374 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
MCOLN3Q8TDD5 KCTD3-201ENST00000259154 3931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
MCOLN3Q8TDD5 AC020915.1-201ENST00000413518 1469 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
MCOLN3Q8TDD5 TIGD4-201ENST00000304337 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
MCOLN3Q8TDD5 F2-201ENST00000311907 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
MCOLN3Q8TDD5 ANO10-213ENST00000451430 2019 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
MCOLN3Q8TDD5 SMYD3-214ENST00000490107 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
MCOLN3Q8TDD5 TAF4B-203ENST00000578121 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
MCOLN3Q8TDD5 JADE2-203ENST00000395003 6465 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
MCOLN3Q8TDD5 NEU3-206ENST00000532963 1643 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
MCOLN3Q8TDD5 ST3GAL3-209ENST00000361400 2195 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
MCOLN3Q8TDD5 KATNBL1-201ENST00000256544 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
MCOLN3Q8TDD5 LMBRD1-202ENST00000370577 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
MCOLN3Q8TDD5 SLC39A6-202ENST00000440549 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
MCOLN3Q8TDD5 CAPN5-202ENST00000456580 2805 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
MCOLN3Q8TDD5 ZBED1-202ENST00000381222 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
MCOLN3Q8TDD5 TBC1D8B-203ENST00000357242 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
MCOLN3Q8TDD5 MLST8-201ENST00000301724 1735 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
MCOLN3Q8TDD5 CYP4F3-203ENST00000586182 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
MCOLN3Q8TDD5 NAP1L1-202ENST00000393263 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
MCOLN3Q8TDD5 APOA1-201ENST00000236850 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
MCOLN3Q8TDD5 CACNG5-201ENST00000307139 926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
MCOLN3Q8TDD5 PHLDA2-201ENST00000314222 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
MCOLN3Q8TDD5 RNU1-114P-201ENST00000365297 166 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
MCOLN3Q8TDD5 C1orf43-205ENST00000368519 1163 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
MCOLN3Q8TDD5 PFDN6-202ENST00000374607 598 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
MCOLN3Q8TDD5 PFDN6-203ENST00000374610 521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
MCOLN3Q8TDD5 APOA1-205ENST00000375329 927 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
MCOLN3Q8TDD5 HOPX-203ENST00000381255 1164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
MCOLN3Q8TDD5 LSM5-207ENST00000410044 687 ntTSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
MCOLN3Q8TDD5 TEX26-AS1-201ENST00000411835 1203 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
MCOLN3Q8TDD5 AP006294.1-201ENST00000415407 339 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
MCOLN3Q8TDD5 KLF2P2-201ENST00000416807 1039 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
MCOLN3Q8TDD5 TGFA-205ENST00000444975 985 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
MCOLN3Q8TDD5 GNG4-205ENST00000484517 684 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
MCOLN3Q8TDD5 AC011495.1-201ENST00000498085 584 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
MCOLN3Q8TDD5 NME2-207ENST00000514264 850 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
MCOLN3Q8TDD5 CCKBR-204ENST00000531712 463 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
MCOLN3Q8TDD5 IFITM2-204ENST00000533141 588 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC14.81□□□□□ -0.04
MCOLN3Q8TDD5 HOPX-210ENST00000553379 1001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
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MCOLN3Q8TDD5 AP005482.2-201ENST00000587889 310 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
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MCOLN3Q8TDD5 AC025048.6-201ENST00000634326 1161 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
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MCOLN3Q8TDD5 RPH3AL-202ENST00000331302 2606 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
MCOLN3Q8TDD5 CDK5RAP2-202ENST00000360190 5985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
MCOLN3Q8TDD5 NUDT16-202ENST00000521288 6108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
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MCOLN3Q8TDD5 TEAD4-203ENST00000397122 1396 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
MCOLN3Q8TDD5 NATD1-201ENST00000611551 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
MCOLN3Q8TDD5 RTKN-202ENST00000272430 2142 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
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MCOLN3Q8TDD5 HVCN1-202ENST00000356742 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
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MCOLN3Q8TDD5 NR1H3-203ENST00000405853 1480 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
MCOLN3Q8TDD5 AC104758.3-201ENST00000563349 1453 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
MCOLN3Q8TDD5 BCS1L-203ENST00000392110 1525 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
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MCOLN3Q8TDD5 SPATA33-210ENST00000611218 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
MCOLN3Q8TDD5 POLR2B-205ENST00000441246 3839 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
MCOLN3Q8TDD5 DDX56-201ENST00000258772 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
MCOLN3Q8TDD5 ATXN10-202ENST00000381061 3135 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
MCOLN3Q8TDD5 COPS7B-224ENST00000620578 2500 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
MCOLN3Q8TDD5 GINS3-203ENST00000426538 1728 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
MCOLN3Q8TDD5 WSCD2-206ENST00000547525 4481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
MCOLN3Q8TDD5 DDX49-201ENST00000247003 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
MCOLN3Q8TDD5 ADPRHL1-201ENST00000356501 1877 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
MCOLN3Q8TDD5 KBTBD12-202ENST00000405109 5727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
MCOLN3Q8TDD5 SAPCD2-201ENST00000409687 3848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
MCOLN3Q8TDD5 LINC00667-206ENST00000582363 2935 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
MCOLN3Q8TDD5 SRSF8-201ENST00000587424 4028 ntAPPRIS P1 BASIC14.8□□□□□ -0.04
MCOLN3Q8TDD5 SLC43A2-201ENST00000301335 8136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
MCOLN3Q8TDD5 ETNPPL-201ENST00000296486 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
MCOLN3Q8TDD5 IL17RA-204ENST00000612619 8506 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
MCOLN3Q8TDD5 HEATR3-201ENST00000299192 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
MCOLN3Q8TDD5 UCKL1-AS1-201ENST00000623569 3602 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
MCOLN3Q8TDD5 BANF1-201ENST00000312175 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
MCOLN3Q8TDD5 C10orf62-201ENST00000370640 1208 ntAPPRIS P1 BASIC14.8□□□□□ -0.04
MCOLN3Q8TDD5 LDLRAD1-201ENST00000371360 785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
MCOLN3Q8TDD5 CRYAA-203ENST00000398133 600 ntTSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
MCOLN3Q8TDD5 PGGT1BP2-201ENST00000398621 1028 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
MCOLN3Q8TDD5 DGCR6-202ENST00000413981 1039 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
MCOLN3Q8TDD5 PRAP1-201ENST00000433452 971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
MCOLN3Q8TDD5 ZNF707-203ENST00000442058 562 ntTSL 4 BASIC14.8□□□□□ -0.04
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