Protein–RNA interactions for Protein: Q8TAP4

LMO3, LIM domain only protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 145 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMO3Q8TAP4 STRA6-205ENST00000432245 1889 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LMO3Q8TAP4 LINC02076-201ENST00000577684 1871 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LMO3Q8TAP4 NDUFC2-201ENST00000281031 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LMO3Q8TAP4 CYP4F11-203ENST00000402119 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LMO3Q8TAP4 ZC3HAV1-204ENST00000471652 3182 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LMO3Q8TAP4 CYTH1-201ENST00000361101 3311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LMO3Q8TAP4 CYTH1-202ENST00000446868 3311 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
LMO3Q8TAP4 RFTN1-203ENST00000432519 2695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LMO3Q8TAP4 ZNF846-201ENST00000397902 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LMO3Q8TAP4 ZNF239-203ENST00000426961 2027 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
LMO3Q8TAP4 CLDND1-215ENST00000507874 1380 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
LMO3Q8TAP4 SEPT9-228ENST00000590294 2816 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
LMO3Q8TAP4 UCKL1-AS1-201ENST00000623569 3602 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
LMO3Q8TAP4 ARHGAP11A-201ENST00000361627 5898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LMO3Q8TAP4 KLHL26-201ENST00000300976 4407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LMO3Q8TAP4 BBS2-201ENST00000245157 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LMO3Q8TAP4 LINC01648-201ENST00000445180 1519 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LMO3Q8TAP4 UBE3B-212ENST00000540230 1541 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LMO3Q8TAP4 MAP2K6-209ENST00000613873 1509 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LMO3Q8TAP4 NAA60-203ENST00000414063 2619 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
LMO3Q8TAP4 AC090505.1-201ENST00000430515 1834 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
LMO3Q8TAP4 BRAT1-201ENST00000340611 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
LMO3Q8TAP4 CASC2-202ENST00000426021 3232 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
LMO3Q8TAP4 MYO1D-201ENST00000318217 5563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
LMO3Q8TAP4 TXNDC5-204ENST00000473453 1301 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
LMO3Q8TAP4 HCN1-201ENST00000303230 9885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
LMO3Q8TAP4 CAPN3-207ENST00000397200 1643 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
LMO3Q8TAP4 ANKRD30BP2-201ENST00000435744 1610 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
LMO3Q8TAP4 RNF182-208ENST00000544682 3495 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.98■□□□□ 0.15
LMO3Q8TAP4 KHSRPP1-201ENST00000427983 1768 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
LMO3Q8TAP4 CARD10-201ENST00000251973 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
LMO3Q8TAP4 SYT1-201ENST00000261205 4808 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
LMO3Q8TAP4 ARSE-206ENST00000545496 2506 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
LMO3Q8TAP4 WSCD1-202ENST00000539421 2665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
LMO3Q8TAP4 PMS1-221ENST00000624204 3417 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
LMO3Q8TAP4 AC015656.1-201ENST00000624209 3578 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
LMO3Q8TAP4 WASHC2C-202ENST00000359860 4471 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
LMO3Q8TAP4 C9orf24-201ENST00000297623 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
LMO3Q8TAP4 SOX7-201ENST00000304501 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
LMO3Q8TAP4 TAF8-202ENST00000372978 794 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
LMO3Q8TAP4 FAM27C-201ENST00000377542 616 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
LMO3Q8TAP4 C9orf24-205ENST00000379133 712 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
LMO3Q8TAP4 IGLV4-69-201ENST00000390282 419 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
LMO3Q8TAP4 MXI1-205ENST00000393134 889 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
LMO3Q8TAP4 AL583835.2-202ENST00000421363 1104 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
LMO3Q8TAP4 AC020915.1-202ENST00000427361 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
LMO3Q8TAP4 FAM8A4P-201ENST00000435433 1213 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
LMO3Q8TAP4 GS1-24F4.2-201ENST00000500823 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
LMO3Q8TAP4 KCNK16-205ENST00000507712 889 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
LMO3Q8TAP4 RMDN1-212ENST00000519966 1164 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
LMO3Q8TAP4 RPL8-205ENST00000527914 551 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
LMO3Q8TAP4 APOC4-201ENST00000591600 348 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
LMO3Q8TAP4 YIF1B-216ENST00000592694 1181 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
LMO3Q8TAP4 OR10B1P-201ENST00000601666 907 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
LMO3Q8TAP4 C12orf76-209ENST00000615315 1580 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
LMO3Q8TAP4 FP565260.6-205ENST00000624120 898 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
LMO3Q8TAP4 PRKD2-202ENST00000433867 3321 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
LMO3Q8TAP4 GSN-209ENST00000449733 2702 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
LMO3Q8TAP4 HS3ST3B1-201ENST00000360954 5367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
LMO3Q8TAP4 PML-215ENST00000565898 5393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
LMO3Q8TAP4 SLCO2B1-217ENST00000532236 2593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
LMO3Q8TAP4 KIAA1257-204ENST00000511438 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
LMO3Q8TAP4 UBA6-202ENST00000420827 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
LMO3Q8TAP4 ATXN2-201ENST00000377617 4702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
LMO3Q8TAP4 HTR7-202ENST00000336152 3126 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
LMO3Q8TAP4 SUMO1-203ENST00000392246 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
LMO3Q8TAP4 LINC01184-204ENST00000501702 2977 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
LMO3Q8TAP4 FSIP1-201ENST00000350221 2805 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
LMO3Q8TAP4 BOLL-203ENST00000392296 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
LMO3Q8TAP4 SLC44A2-201ENST00000335757 3671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
LMO3Q8TAP4 PITPNM1-202ENST00000436757 4216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
LMO3Q8TAP4 SLC9A6-203ENST00000370701 4755 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
LMO3Q8TAP4 KCTD20-202ENST00000373731 5619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
LMO3Q8TAP4 JPH4-205ENST00000622501 3489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
LMO3Q8TAP4 AC015688.4-201ENST00000580780 1647 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
LMO3Q8TAP4 ASPM-201ENST00000294732 6132 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LMO3Q8TAP4 CCT3-201ENST00000295688 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LMO3Q8TAP4 RHOH-218ENST00000613272 1865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
LMO3Q8TAP4 SLIT3-201ENST00000332966 4895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LMO3Q8TAP4 BCAR1-202ENST00000393420 2667 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
LMO3Q8TAP4 ARMCX1-201ENST00000372829 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LMO3Q8TAP4 PRAMEF8-202ENST00000614831 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
LMO3Q8TAP4 PRAMEF7-202ENST00000616979 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
LMO3Q8TAP4 ADCY9-201ENST00000294016 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LMO3Q8TAP4 SERP1-201ENST00000239944 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LMO3Q8TAP4 ADAMTS13-206ENST00000371929 4934 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LMO3Q8TAP4 TNIP1-214ENST00000522226 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
LMO3Q8TAP4 BCR-201ENST00000305877 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LMO3Q8TAP4 SLC30A5-202ENST00000396591 4360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LMO3Q8TAP4 ANGPTL8-201ENST00000252453 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LMO3Q8TAP4 AC011450.1-202ENST00000358234 573 ntTSL 4 BASIC15.97■□□□□ 0.15
LMO3Q8TAP4 AP000317.2-201ENST00000362077 641 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
LMO3Q8TAP4 TSPAN32-204ENST00000381121 999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
LMO3Q8TAP4 MPV17-205ENST00000402310 906 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
LMO3Q8TAP4 PGF-202ENST00000405431 666 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
LMO3Q8TAP4 RPUSD3-204ENST00000424438 1005 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
LMO3Q8TAP4 AL606534.2-205ENST00000437691 346 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
LMO3Q8TAP4 CROCCP4-201ENST00000457096 498 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
LMO3Q8TAP4 AC116456.1-201ENST00000526646 815 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
LMO3Q8TAP4 TPD52L1-208ENST00000528193 789 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
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