Protein–RNA interactions for Protein: Q8NFU0

BEST4, Bestrophin-4, humanhuman

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Length 473 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BEST4Q8NFU0 CASQ1-201ENST00000368078 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
BEST4Q8NFU0 COX6B2-201ENST00000326529 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
BEST4Q8NFU0 C1orf228-219ENST00000535358 1685 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
BEST4Q8NFU0 UCK1-203ENST00000372211 2114 ntTSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
BEST4Q8NFU0 CD99L2-205ENST00000437787 3493 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
BEST4Q8NFU0 WSCD2-206ENST00000547525 4481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
BEST4Q8NFU0 KCNJ5-201ENST00000338350 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
BEST4Q8NFU0 GRM1-204ENST00000492807 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
BEST4Q8NFU0 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
BEST4Q8NFU0 NEK7-201ENST00000367383 586 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
BEST4Q8NFU0 DPM3-203ENST00000368400 409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
BEST4Q8NFU0 MRPL28-202ENST00000389675 865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
BEST4Q8NFU0 AL133481.1-201ENST00000438554 511 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
BEST4Q8NFU0 NME4-207ENST00000450036 985 ntTSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
BEST4Q8NFU0 PQLC2L-205ENST00000461040 563 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
BEST4Q8NFU0 AP000777.2-201ENST00000539897 501 ntTSL 4 BASIC13.06□□□□□ -0.32
BEST4Q8NFU0 PPP1R14B-203ENST00000542235 920 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
BEST4Q8NFU0 CSRP2-202ENST00000546966 754 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
BEST4Q8NFU0 RPL18-208ENST00000549920 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
BEST4Q8NFU0 LRRC28-210ENST00000558879 581 ntTSL 4 BASIC13.06□□□□□ -0.32
BEST4Q8NFU0 ARMC7-203ENST00000581078 1002 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
BEST4Q8NFU0 GPR42-202ENST00000597214 1182 ntAPPRIS P1 BASIC13.06□□□□□ -0.32
BEST4Q8NFU0 AC098484.3-202ENST00000603943 1011 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
BEST4Q8NFU0 PCDHGB7-201ENST00000398594 4765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
BEST4Q8NFU0 ORMDL3-202ENST00000394169 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
BEST4Q8NFU0 GALC-201ENST00000261304 3883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
BEST4Q8NFU0 DCAF10-202ENST00000377724 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
BEST4Q8NFU0 TUBG2-201ENST00000251412 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
BEST4Q8NFU0 NEDD4L-238ENST00000635997 4402 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
BEST4Q8NFU0 HEY1-202ENST00000354724 2293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
BEST4Q8NFU0 ZC3H18-201ENST00000301011 3729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
BEST4Q8NFU0 ELP5-201ENST00000354429 1304 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
BEST4Q8NFU0 GREB1-205ENST00000389825 1315 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
BEST4Q8NFU0 IGHG3-202ENST00000641136 2751 ntAPPRIS P1 BASIC13.06□□□□□ -0.32
BEST4Q8NFU0 GPR4-201ENST00000323040 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
BEST4Q8NFU0 PNLDC1-202ENST00000392167 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
BEST4Q8NFU0 SNCAIP-203ENST00000379538 2588 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
BEST4Q8NFU0 ERVK13-1-207ENST00000569465 3321 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
BEST4Q8NFU0 PLEKHG2-206ENST00000458508 3898 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
BEST4Q8NFU0 AC012349.1-201ENST00000518662 2643 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
BEST4Q8NFU0 KRT74-203ENST00000549343 2858 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
BEST4Q8NFU0 SLC12A6-206ENST00000558589 3866 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
BEST4Q8NFU0 GTPBP8-208ENST00000619116 1378 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
BEST4Q8NFU0 POM121-205ENST00000627934 5480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
BEST4Q8NFU0 FBXL18-201ENST00000382368 3498 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
BEST4Q8NFU0 EMC10-201ENST00000334976 9446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
BEST4Q8NFU0 ELL-201ENST00000262809 4027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
BEST4Q8NFU0 ZBED8-202ENST00000523213 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
BEST4Q8NFU0 SMARCA2-204ENST00000357248 5855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
BEST4Q8NFU0 EGFR-207ENST00000455089 3844 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
BEST4Q8NFU0 PLTP-203ENST00000372431 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
BEST4Q8NFU0 CRELD1-203ENST00000397170 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
BEST4Q8NFU0 SGMS1-203ENST00000429490 3634 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
BEST4Q8NFU0 SMARCA4-202ENST00000413806 5512 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
BEST4Q8NFU0 FAM171B-201ENST00000304698 5826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
BEST4Q8NFU0 SMOC2-202ENST00000356284 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
BEST4Q8NFU0 IGF2BP2-202ENST00000382199 3688 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
BEST4Q8NFU0 COL18A1-AS1-201ENST00000397787 3425 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
BEST4Q8NFU0 EDEM3-201ENST00000318130 6898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
BEST4Q8NFU0 SELENOF-208ENST00000616787 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
BEST4Q8NFU0 CELF4-201ENST00000334919 3542 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
BEST4Q8NFU0 FGFBP2-201ENST00000259989 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
BEST4Q8NFU0 MRPL55-201ENST00000295008 632 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
BEST4Q8NFU0 CRYBA2-201ENST00000295728 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
BEST4Q8NFU0 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
BEST4Q8NFU0 C11orf88-201ENST00000332814 795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
BEST4Q8NFU0 MRNIP-202ENST00000376931 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
BEST4Q8NFU0 HNRNPA1P28-201ENST00000424481 961 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
BEST4Q8NFU0 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
BEST4Q8NFU0 IGHV3-62-201ENST00000520057 340 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
BEST4Q8NFU0 NAALADL1-208ENST00000528884 973 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
BEST4Q8NFU0 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
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BEST4Q8NFU0 BEAN1-203ENST00000561796 1078 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
BEST4Q8NFU0 IGHV3OR16-6-201ENST00000568775 360 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
BEST4Q8NFU0 GNAO1-210ENST00000569295 930 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
BEST4Q8NFU0 MIEN1-205ENST00000577810 806 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
BEST4Q8NFU0 FIBCD1-202ENST00000372338 3253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
BEST4Q8NFU0 CLCN6-201ENST00000312413 5631 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
BEST4Q8NFU0 C7orf57-204ENST00000435376 1925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
BEST4Q8NFU0 ARMCX6-208ENST00000539247 1928 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.05□□□□□ -0.32
BEST4Q8NFU0 C7orf57-206ENST00000539619 1927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
BEST4Q8NFU0 AL356258.1-201ENST00000605929 2246 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
BEST4Q8NFU0 TMEM63B-202ENST00000323267 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
BEST4Q8NFU0 NTM-202ENST00000374786 3190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
BEST4Q8NFU0 AC113189.2-201ENST00000575310 1975 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
BEST4Q8NFU0 ILF2-201ENST00000361891 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
BEST4Q8NFU0 GLMP-213ENST00000612353 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
BEST4Q8NFU0 GLMP-215ENST00000622703 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
BEST4Q8NFU0 ATXN7-201ENST00000295900 7224 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
BEST4Q8NFU0 MAP3K12-203ENST00000547035 2944 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
BEST4Q8NFU0 PSD-202ENST00000406432 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
BEST4Q8NFU0 HPCAL4-201ENST00000372844 4856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
BEST4Q8NFU0 ZNF778-202ENST00000433976 3608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
BEST4Q8NFU0 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
BEST4Q8NFU0 SATB2-201ENST00000260926 5318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
BEST4Q8NFU0 KCNN2-206ENST00000512097 3076 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
BEST4Q8NFU0 COL22A1-201ENST00000303045 6346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
BEST4Q8NFU0 CALD1-206ENST00000424922 2124 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
BEST4Q8NFU0 PDP1-203ENST00000517764 2140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
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