Protein–RNA interactions for Protein: Q8N205

SYNE4, Nesprin-4, humanhuman

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Length 404 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNE4Q8N205 AC135178.1-201ENST00000458568 537 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SYNE4Q8N205 FBXO24-204ENST00000465843 957 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SYNE4Q8N205 HOXA10-AS-202ENST00000519935 1161 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SYNE4Q8N205 NDUFC2-KCTD14-202ENST00000530054 656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SYNE4Q8N205 SNRPD2-206ENST00000588301 702 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SYNE4Q8N205 SMIM22-209ENST00000591870 355 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SYNE4Q8N205 AL157813.1-201ENST00000612996 587 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
SYNE4Q8N205 MUC1-226ENST00000614519 1093 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SYNE4Q8N205 COX6A1P2-201ENST00000620597 330 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
SYNE4Q8N205 MBP-202ENST00000355994 2772 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SYNE4Q8N205 BAIAP2-201ENST00000321280 1939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SYNE4Q8N205 PCDHGB2-202ENST00000622527 2588 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SYNE4Q8N205 XPO5-201ENST00000265351 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SYNE4Q8N205 ARHGAP45-212ENST00000590577 3218 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SYNE4Q8N205 MKS1-202ENST00000393119 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SYNE4Q8N205 CHIA-204ENST00000369740 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SYNE4Q8N205 LONRF1-201ENST00000398246 3594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SYNE4Q8N205 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SYNE4Q8N205 KIAA1614-AS1-201ENST00000415647 1440 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SYNE4Q8N205 INHBE-201ENST00000266646 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SYNE4Q8N205 NRXN1-209ENST00000405581 5078 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SYNE4Q8N205 PPP1R26-202ENST00000401470 4769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SYNE4Q8N205 ASIC4-201ENST00000347842 2684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SYNE4Q8N205 CDH1-202ENST00000422392 2567 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SYNE4Q8N205 PCDH1-203ENST00000394536 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SYNE4Q8N205 LINC02495-201ENST00000508601 4167 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SYNE4Q8N205 SLC43A2-204ENST00000571650 3261 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SYNE4Q8N205 ZBED1P1-201ENST00000502364 1930 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
SYNE4Q8N205 CPSF7-205ENST00000439958 3524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SYNE4Q8N205 TRIM33-201ENST00000358465 8339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SYNE4Q8N205 MYZAP-202ENST00000380565 2181 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SYNE4Q8N205 CIAPIN1-201ENST00000394391 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SYNE4Q8N205 OR6A2-201ENST00000332601 1373 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SYNE4Q8N205 AGER-201ENST00000375055 1369 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SYNE4Q8N205 INPP5B-204ENST00000373026 3230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SYNE4Q8N205 PDE1C-202ENST00000396182 2420 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SYNE4Q8N205 TMEM117-201ENST00000266534 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SYNE4Q8N205 SMIM29-202ENST00000394990 792 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SYNE4Q8N205 BX284668.5-201ENST00000422124 406 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SYNE4Q8N205 TREML1-202ENST00000426005 981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SYNE4Q8N205 AP1B1P1-201ENST00000432373 827 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SYNE4Q8N205 RN7SL181P-201ENST00000462921 277 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
SYNE4Q8N205 AC006122.1-201ENST00000493323 440 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
SYNE4Q8N205 CFL1-206ENST00000527344 962 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SYNE4Q8N205 IFITM1-204ENST00000528780 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SYNE4Q8N205 UBE3B-206ENST00000536398 1120 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SYNE4Q8N205 NPM1P43-201ENST00000558669 786 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
SYNE4Q8N205 AL031282.1-201ENST00000577672 409 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SYNE4Q8N205 MIR4754-201ENST00000582477 89 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
SYNE4Q8N205 NAP1L6-202ENST00000641404 1222 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
SYNE4Q8N205 MAGEB2-201ENST00000378988 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SYNE4Q8N205 LINC01101-201ENST00000622953 1884 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
SYNE4Q8N205 ASGR1-201ENST00000269299 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SYNE4Q8N205 PPP1R37-201ENST00000221462 3163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SYNE4Q8N205 RALGPS1-203ENST00000373434 2466 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SYNE4Q8N205 BAG1-210ENST00000634734 3786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SYNE4Q8N205 PDP1-203ENST00000517764 2140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SYNE4Q8N205 ASNS-201ENST00000175506 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SYNE4Q8N205 VWCE-205ENST00000535710 1437 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SYNE4Q8N205 SLC6A2-204ENST00000561820 2268 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SYNE4Q8N205 NFATC4-218ENST00000554966 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SYNE4Q8N205 NFATC4-225ENST00000556169 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SYNE4Q8N205 DIABLO-201ENST00000267169 1316 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SYNE4Q8N205 UBE2O-201ENST00000319380 5436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SYNE4Q8N205 PLPP3-201ENST00000371250 3292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SYNE4Q8N205 SF1-209ENST00000433274 2317 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SYNE4Q8N205 DDX39A-201ENST00000242776 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SYNE4Q8N205 MC1R-202ENST00000555147 3099 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SYNE4Q8N205 ING5-201ENST00000313552 5196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SYNE4Q8N205 FAS-202ENST00000352159 1722 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SYNE4Q8N205 RFX1-201ENST00000254325 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SYNE4Q8N205 SERTM1-201ENST00000315190 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SYNE4Q8N205 PLAG1-203ENST00000429357 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SYNE4Q8N205 AP2A2-201ENST00000332231 4656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SYNE4Q8N205 POLR3H-202ENST00000355209 4416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SYNE4Q8N205 POLL-204ENST00000370168 1536 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SYNE4Q8N205 KDSR-201ENST00000326575 1024 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SYNE4Q8N205 EVA1A-204ENST00000410071 777 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SYNE4Q8N205 AC078875.1-201ENST00000431907 724 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
SYNE4Q8N205 RN7SL818P-201ENST00000485099 259 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
SYNE4Q8N205 AC008406.1-201ENST00000509530 541 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SYNE4Q8N205 AC090857.1-201ENST00000527400 390 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
SYNE4Q8N205 NEU3-205ENST00000531619 582 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SYNE4Q8N205 VPS18-202ENST00000558474 873 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SYNE4Q8N205 AC011466.3-201ENST00000596563 852 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SYNE4Q8N205 AC009884.2-201ENST00000603110 324 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
SYNE4Q8N205 RN7SL725P-201ENST00000606439 259 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
SYNE4Q8N205 NUMBL-201ENST00000252891 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SYNE4Q8N205 SLA2-202ENST00000360672 2171 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SYNE4Q8N205 AP000552.1-203ENST00000416615 1930 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SYNE4Q8N205 FOXE1-201ENST00000375123 3462 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SYNE4Q8N205 ARHGEF28-212ENST00000513042 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SYNE4Q8N205 TMEM198B-203ENST00000482378 2230 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SYNE4Q8N205 HID1-202ENST00000425042 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SYNE4Q8N205 CCDC51-201ENST00000395694 1560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SYNE4Q8N205 GATA4-206ENST00000528712 2614 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SYNE4Q8N205 SHROOM1-201ENST00000319854 3190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SYNE4Q8N205 ZCCHC17-204ENST00000546109 1705 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SYNE4Q8N205 HSD17B6-207ENST00000555805 1722 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SYNE4Q8N205 LDLRAD4-205ENST00000585931 2118 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
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