Protein–RNA interactions for Protein: Q8IXW0

LMNTD2, Lamin tail domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 634 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMNTD2Q8IXW0 PTPN9-201ENST00000306726 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LMNTD2Q8IXW0 AFAP1L1-205ENST00000515000 2319 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LMNTD2Q8IXW0 NDUFA11-202ENST00000418389 2406 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LMNTD2Q8IXW0 TCAF2-202ENST00000411935 2906 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LMNTD2Q8IXW0 CUEDC1-206ENST00000577830 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LMNTD2Q8IXW0 B3GNT7-201ENST00000287590 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LMNTD2Q8IXW0 AC073349.1-201ENST00000340779 1062 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LMNTD2Q8IXW0 HSD17B10-203ENST00000375304 916 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LMNTD2Q8IXW0 AC091729.2-201ENST00000415656 302 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LMNTD2Q8IXW0 RCAN3-204ENST00000425530 997 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LMNTD2Q8IXW0 AC009477.1-201ENST00000452936 217 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
LMNTD2Q8IXW0 NSUN5P1-208ENST00000473960 500 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LMNTD2Q8IXW0 TSC22D3-213ENST00000506081 956 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LMNTD2Q8IXW0 PNOC-204ENST00000522209 1007 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LMNTD2Q8IXW0 C14orf178-204ENST00000557011 474 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LMNTD2Q8IXW0 AC018558.2-201ENST00000566562 480 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LMNTD2Q8IXW0 AC004408.1-201ENST00000579256 573 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LMNTD2Q8IXW0 PCDHGC3-204ENST00000617222 731 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LMNTD2Q8IXW0 AC244153.1-202ENST00000617855 482 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LMNTD2Q8IXW0 CKMT1A-208ENST00000626814 1073 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LMNTD2Q8IXW0 RCAN3-211ENST00000630217 658 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LMNTD2Q8IXW0 GPR84-201ENST00000267015 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LMNTD2Q8IXW0 MGMT-201ENST00000306010 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LMNTD2Q8IXW0 USP37-202ENST00000338465 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LMNTD2Q8IXW0 MBD1-217ENST00000588937 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LMNTD2Q8IXW0 AC136759.1-202ENST00000530858 2194 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
LMNTD2Q8IXW0 KCNJ18-201ENST00000567955 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LMNTD2Q8IXW0 GRM1-204ENST00000492807 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LMNTD2Q8IXW0 TIGD4-201ENST00000304337 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LMNTD2Q8IXW0 IRS1-201ENST00000305123 9705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LMNTD2Q8IXW0 POM121-205ENST00000627934 5480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LMNTD2Q8IXW0 ANKHD1-203ENST00000360839 8221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LMNTD2Q8IXW0 CLCN6-201ENST00000312413 5631 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LMNTD2Q8IXW0 C21orf58-202ENST00000397679 2900 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LMNTD2Q8IXW0 WARS2-202ENST00000369426 2811 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LMNTD2Q8IXW0 DHCR7-202ENST00000407721 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LMNTD2Q8IXW0 CAMK2D-207ENST00000505990 1802 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LMNTD2Q8IXW0 ACP5-202ENST00000412435 1527 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LMNTD2Q8IXW0 TOM1-201ENST00000382034 1300 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LMNTD2Q8IXW0 PAG1-201ENST00000220597 10744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LMNTD2Q8IXW0 LRRFIP1-204ENST00000392000 3365 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LMNTD2Q8IXW0 PCDHB16-201ENST00000609684 5001 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LMNTD2Q8IXW0 PCDHGB5-202ENST00000621169 2670 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LMNTD2Q8IXW0 NOTCH1-201ENST00000277541 9371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LMNTD2Q8IXW0 LINC00987-201ENST00000427111 2472 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LMNTD2Q8IXW0 PDE8A-203ENST00000394553 3912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LMNTD2Q8IXW0 FBXL19-204ENST00000471231 3641 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LMNTD2Q8IXW0 KIF1A-213ENST00000498729 9221 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LMNTD2Q8IXW0 TNFSF13-201ENST00000338784 1971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LMNTD2Q8IXW0 ADCY3-202ENST00000405392 4397 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LMNTD2Q8IXW0 AGFG1-202ENST00000373671 1669 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LMNTD2Q8IXW0 ZSWIM8-221ENST00000604729 6075 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LMNTD2Q8IXW0 ADAMTSL1-207ENST00000380566 2321 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LMNTD2Q8IXW0 DSN1-203ENST00000373750 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LMNTD2Q8IXW0 PSMB6-201ENST00000270586 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LMNTD2Q8IXW0 JTB-201ENST00000271843 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LMNTD2Q8IXW0 FCN1-201ENST00000371806 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LMNTD2Q8IXW0 CXCL12-206ENST00000395795 404 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LMNTD2Q8IXW0 MIR943-201ENST00000401286 94 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
LMNTD2Q8IXW0 SUN1-204ENST00000403868 978 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LMNTD2Q8IXW0 TMEM37-202ENST00000409826 794 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LMNTD2Q8IXW0 SMARCA4-202ENST00000413806 5512 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LMNTD2Q8IXW0 TSSK5P-201ENST00000423978 907 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
LMNTD2Q8IXW0 CARHSP1-203ENST00000561530 729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LMNTD2Q8IXW0 USP31-203ENST00000567975 2142 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LMNTD2Q8IXW0 AC129507.1-201ENST00000570711 1013 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LMNTD2Q8IXW0 CUEDC1-207ENST00000577840 875 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LMNTD2Q8IXW0 PSMB6-205ENST00000614486 871 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LMNTD2Q8IXW0 RET-201ENST00000340058 4149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LMNTD2Q8IXW0 CCR7-201ENST00000246657 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LMNTD2Q8IXW0 MBD1-211ENST00000585595 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LMNTD2Q8IXW0 TBX10-201ENST00000335385 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LMNTD2Q8IXW0 SCYL1-205ENST00000524944 2715 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LMNTD2Q8IXW0 MBD1-201ENST00000269468 3259 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LMNTD2Q8IXW0 ZNF397-201ENST00000261333 1419 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LMNTD2Q8IXW0 RNASE1-202ENST00000397967 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LMNTD2Q8IXW0 KRT18P28-201ENST00000453838 1332 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
LMNTD2Q8IXW0 LMX1B-204ENST00000561065 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LMNTD2Q8IXW0 TMEM200A-204ENST00000617887 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LMNTD2Q8IXW0 SATB2-201ENST00000260926 5318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LMNTD2Q8IXW0 COL6A4P2-202ENST00000504443 2753 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
LMNTD2Q8IXW0 GNAO1-202ENST00000262494 5767 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LMNTD2Q8IXW0 TCAF1P1-201ENST00000414990 2232 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
LMNTD2Q8IXW0 PEG13-201ENST00000631594 5667 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
LMNTD2Q8IXW0 SDC1-201ENST00000254351 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LMNTD2Q8IXW0 RHNO1-202ENST00000461997 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
LMNTD2Q8IXW0 WHRN-202ENST00000362057 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LMNTD2Q8IXW0 WDR77-201ENST00000235090 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LMNTD2Q8IXW0 CRCP-203ENST00000395326 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LMNTD2Q8IXW0 MBD6-201ENST00000355673 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LMNTD2Q8IXW0 USP19-208ENST00000453664 4719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
LMNTD2Q8IXW0 TNFRSF11A-205ENST00000616710 3809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LMNTD2Q8IXW0 CUL1-201ENST00000325222 3064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LMNTD2Q8IXW0 LATS1-207ENST00000543571 7517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LMNTD2Q8IXW0 CYP20A1-203ENST00000429815 1812 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
LMNTD2Q8IXW0 BTD-207ENST00000449107 1820 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
LMNTD2Q8IXW0 WDR61-201ENST00000267973 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LMNTD2Q8IXW0 SPPL2A-201ENST00000261854 7372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LMNTD2Q8IXW0 FEM1A-201ENST00000269856 9593 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
LMNTD2Q8IXW0 TMEM117-201ENST00000266534 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.3 ms