Protein–RNA interactions for Protein: Q86SZ2

TRAPPC6B, Trafficking protein particle complex subunit 6B, humanhuman

Predictions only

Length 158 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC6BQ86SZ2 AC104985.1-201ENST00000587528 507 ntTSL 3 BASIC13.07□□□□□ -0.32
TRAPPC6BQ86SZ2 AC010336.3-201ENST00000597156 667 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
TRAPPC6BQ86SZ2 AC243773.2-203ENST00000612281 640 ntTSL 3 BASIC13.07□□□□□ -0.32
TRAPPC6BQ86SZ2 TEX28P1-201ENST00000613479 1221 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
TRAPPC6BQ86SZ2 TEX28P2-201ENST00000617764 1221 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
TRAPPC6BQ86SZ2 AC105277.1-203ENST00000635492 1293 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
TRAPPC6BQ86SZ2 PFDN4-201ENST00000371419 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
TRAPPC6BQ86SZ2 ZMYM3-204ENST00000373982 1867 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
TRAPPC6BQ86SZ2 ACSM1-201ENST00000307493 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
TRAPPC6BQ86SZ2 KDELR2-201ENST00000258739 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
TRAPPC6BQ86SZ2 PRSS30P-201ENST00000390681 2881 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
TRAPPC6BQ86SZ2 TFCP2-201ENST00000257915 3546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
TRAPPC6BQ86SZ2 ADAM15-203ENST00000356955 2949 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
TRAPPC6BQ86SZ2 ZNF576-203ENST00000525771 2327 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
TRAPPC6BQ86SZ2 GSKIP-201ENST00000438650 2140 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
TRAPPC6BQ86SZ2 SLC35D1-201ENST00000235345 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
TRAPPC6BQ86SZ2 ETV2-204ENST00000403402 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
TRAPPC6BQ86SZ2 ATP6AP2-233ENST00000638153 1303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
TRAPPC6BQ86SZ2 PTPN23-201ENST00000265562 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
TRAPPC6BQ86SZ2 USP9X-202ENST00000378308 8371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
TRAPPC6BQ86SZ2 TBXAS1-208ENST00000448866 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
TRAPPC6BQ86SZ2 RIC1-203ENST00000414202 6774 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
TRAPPC6BQ86SZ2 METTL13-202ENST00000362019 3022 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
TRAPPC6BQ86SZ2 ZNF76-202ENST00000339411 2447 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
TRAPPC6BQ86SZ2 SLC25A29-208ENST00000554912 5169 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
TRAPPC6BQ86SZ2 PLXNB1-201ENST00000296440 7143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
TRAPPC6BQ86SZ2 EIF2B4-205ENST00000445933 1608 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
TRAPPC6BQ86SZ2 BDKRB2-201ENST00000539359 1600 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
TRAPPC6BQ86SZ2 UBL7-AS1-203ENST00000564621 1612 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
TRAPPC6BQ86SZ2 CLEC16A-202ENST00000409552 3365 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
TRAPPC6BQ86SZ2 LIMS1-215ENST00000544547 4461 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
TRAPPC6BQ86SZ2 PPP1R27-202ENST00000570394 1443 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
TRAPPC6BQ86SZ2 ENO2-211ENST00000541477 2549 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
TRAPPC6BQ86SZ2 GOLGA8H-201ENST00000566740 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
TRAPPC6BQ86SZ2 GOLGA8J-201ENST00000567927 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
TRAPPC6BQ86SZ2 OLA1-202ENST00000344357 1656 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
TRAPPC6BQ86SZ2 CDYL-205ENST00000449732 2139 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
TRAPPC6BQ86SZ2 MAOB-201ENST00000378069 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
TRAPPC6BQ86SZ2 DNAJC27-207ENST00000534855 4831 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
TRAPPC6BQ86SZ2 PNPLA3-201ENST00000216180 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
TRAPPC6BQ86SZ2 EDEM2-202ENST00000374492 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
TRAPPC6BQ86SZ2 LHCGR-202ENST00000401907 1477 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
TRAPPC6BQ86SZ2 EPB41L1-202ENST00000338074 6266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
TRAPPC6BQ86SZ2 STRC-205ENST00000450892 5680 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
TRAPPC6BQ86SZ2 MOSPD3-201ENST00000223054 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
TRAPPC6BQ86SZ2 CLPP-201ENST00000245816 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
TRAPPC6BQ86SZ2 CIB3-202ENST00000379859 467 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
TRAPPC6BQ86SZ2 TAS2R41-201ENST00000408916 924 ntAPPRIS P1 BASIC13.06□□□□□ -0.32
TRAPPC6BQ86SZ2 NECAP2-203ENST00000457722 935 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
TRAPPC6BQ86SZ2 AC093904.3-201ENST00000492300 368 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
TRAPPC6BQ86SZ2 CNOT8-210ENST00000519404 945 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
TRAPPC6BQ86SZ2 RPL10P19-202ENST00000520582 722 ntTSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
TRAPPC6BQ86SZ2 CNOT8-214ENST00000520671 923 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
TRAPPC6BQ86SZ2 CNOT8-218ENST00000521583 1151 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
TRAPPC6BQ86SZ2 SLC1A4-205ENST00000531327 1217 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
TRAPPC6BQ86SZ2 AC051619.7-201ENST00000568314 623 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
TRAPPC6BQ86SZ2 AC015911.4-201ENST00000588022 1070 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
TRAPPC6BQ86SZ2 AL158211.3-201ENST00000607385 239 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
TRAPPC6BQ86SZ2 MRNIP-225ENST00000610475 810 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
TRAPPC6BQ86SZ2 RAB34-223ENST00000636154 730 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
TRAPPC6BQ86SZ2 TEKT4-201ENST00000295201 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
TRAPPC6BQ86SZ2 PTGES3-202ENST00000414274 1547 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
TRAPPC6BQ86SZ2 TEX28-203ENST00000617225 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
TRAPPC6BQ86SZ2 CROT-201ENST00000331536 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
TRAPPC6BQ86SZ2 THBD-201ENST00000377103 4109 ntAPPRIS P1 BASIC13.06□□□□□ -0.32
TRAPPC6BQ86SZ2 HEY1-202ENST00000354724 2293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
TRAPPC6BQ86SZ2 FAM107A-206ENST00000474531 2271 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
TRAPPC6BQ86SZ2 CDCA7-202ENST00000347703 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
TRAPPC6BQ86SZ2 OSBPL5-202ENST00000348039 2798 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
TRAPPC6BQ86SZ2 VILL-202ENST00000383759 2787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
TRAPPC6BQ86SZ2 NOP14-203ENST00000416614 3538 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
TRAPPC6BQ86SZ2 LINC02538-201ENST00000609107 4569 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
TRAPPC6BQ86SZ2 SEZ6L-203ENST00000360929 6307 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
TRAPPC6BQ86SZ2 TFR2-201ENST00000223051 2888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
TRAPPC6BQ86SZ2 TMEM212-201ENST00000334567 1881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
TRAPPC6BQ86SZ2 GABPB1-202ENST00000359031 1633 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
TRAPPC6BQ86SZ2 AC010327.3-201ENST00000591665 1643 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
TRAPPC6BQ86SZ2 HIF3A-218ENST00000600383 2101 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
TRAPPC6BQ86SZ2 CAND2-201ENST00000295989 4429 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
TRAPPC6BQ86SZ2 KCNH4-201ENST00000264661 3920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
TRAPPC6BQ86SZ2 ATRN-202ENST00000446916 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
TRAPPC6BQ86SZ2 PLAU-202ENST00000446342 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
TRAPPC6BQ86SZ2 MFF-204ENST00000353339 2186 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
TRAPPC6BQ86SZ2 SLC34A2-202ENST00000503434 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
TRAPPC6BQ86SZ2 GAP43-201ENST00000305124 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
TRAPPC6BQ86SZ2 ANKRD44-203ENST00000409153 2724 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
TRAPPC6BQ86SZ2 CPSF7-205ENST00000439958 3524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
TRAPPC6BQ86SZ2 PDRG1-201ENST00000202017 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
TRAPPC6BQ86SZ2 EFR3B-202ENST00000401432 5162 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
TRAPPC6BQ86SZ2 NDUFC2-201ENST00000281031 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
TRAPPC6BQ86SZ2 LTB4R-203ENST00000396789 4110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
TRAPPC6BQ86SZ2 FBXO21-202ENST00000427718 4138 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
TRAPPC6BQ86SZ2 RNF170-209ENST00000534961 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
TRAPPC6BQ86SZ2 LRRC20-204ENST00000373224 3095 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
TRAPPC6BQ86SZ2 SLC35G3-201ENST00000297307 2004 ntAPPRIS P1 BASIC13.05□□□□□ -0.32
TRAPPC6BQ86SZ2 WNT7B-201ENST00000339464 3919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
TRAPPC6BQ86SZ2 WIZ-203ENST00000545156 4466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
TRAPPC6BQ86SZ2 FOXD4L5-201ENST00000377420 3109 ntAPPRIS P1 BASIC13.05□□□□□ -0.32
TRAPPC6BQ86SZ2 TCOF1-202ENST00000377797 5095 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
TRAPPC6BQ86SZ2 MAGED4B-207ENST00000485287 2618 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.9 ms