Protein–RNA interactions for Protein: Q6UWD8

C16orf54, Transmembrane protein C16orf54, humanhuman

Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C16orf54Q6UWD8 SRD5A3P1-201ENST00000603021 949 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
C16orf54Q6UWD8 REXO1L4P-201ENST00000605109 1937 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
C16orf54Q6UWD8 RDM1-220ENST00000616596 1032 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
C16orf54Q6UWD8 AC093512.1-201ENST00000617969 520 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
C16orf54Q6UWD8 RDM1-228ENST00000620284 1177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
C16orf54Q6UWD8 RBM10-206ENST00000628161 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
C16orf54Q6UWD8 LINC01002-214ENST00000632102 561 ntTSL 4 BASIC11.73□□□□□ -0.53
C16orf54Q6UWD8 AHCYL2-202ENST00000446544 5026 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
C16orf54Q6UWD8 AGTPBP1-208ENST00000628899 4222 ntTSL 2 BASIC11.73□□□□□ -0.53
C16orf54Q6UWD8 ELF4-201ENST00000308167 4165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
C16orf54Q6UWD8 CEP170B-203ENST00000453495 6813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
C16orf54Q6UWD8 YTHDF3-201ENST00000517371 3122 ntTSL 3 BASIC11.73□□□□□ -0.53
C16orf54Q6UWD8 LRRC41-201ENST00000343304 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
C16orf54Q6UWD8 AC009961.1-203ENST00000607836 2520 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
C16orf54Q6UWD8 UBE4B-201ENST00000253251 4772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
C16orf54Q6UWD8 HERC2P10-201ENST00000570209 2393 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
C16orf54Q6UWD8 MAPT-206ENST00000415613 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
C16orf54Q6UWD8 UCK1-203ENST00000372211 2114 ntTSL 3 BASIC11.72□□□□□ -0.53
C16orf54Q6UWD8 TPM3-208ENST00000341485 2063 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
C16orf54Q6UWD8 GPR153-201ENST00000377893 4082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
C16orf54Q6UWD8 MED4-201ENST00000258648 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
C16orf54Q6UWD8 PNPLA5-202ENST00000381198 2000 ntTSL 2 BASIC11.72□□□□□ -0.53
C16orf54Q6UWD8 DRC3-203ENST00000399187 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
C16orf54Q6UWD8 PPL-205ENST00000590782 5845 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
C16orf54Q6UWD8 CASQ1-201ENST00000368078 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
C16orf54Q6UWD8 ZMYM3-204ENST00000373982 1867 ntTSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
C16orf54Q6UWD8 MAGEA9-201ENST00000243314 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
C16orf54Q6UWD8 CEP170B-202ENST00000414716 6705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
C16orf54Q6UWD8 ILF2-201ENST00000361891 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
C16orf54Q6UWD8 TRIM13-201ENST00000356017 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
C16orf54Q6UWD8 AFF4-201ENST00000265343 9552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
C16orf54Q6UWD8 MANBAL-204ENST00000397151 1503 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.72□□□□□ -0.53
C16orf54Q6UWD8 MANBAL-205ENST00000397152 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
C16orf54Q6UWD8 CNOT3-201ENST00000221232 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
C16orf54Q6UWD8 ATP6V0E1-203ENST00000519374 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
C16orf54Q6UWD8 WARS2-202ENST00000369426 2811 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
C16orf54Q6UWD8 CASC3-201ENST00000264645 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
C16orf54Q6UWD8 NACC2-201ENST00000277554 6899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
C16orf54Q6UWD8 NCAPH2-202ENST00000395698 1388 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
C16orf54Q6UWD8 VARS2-201ENST00000321897 4073 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
C16orf54Q6UWD8 LINC01301-205ENST00000531654 1347 ntTSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
C16orf54Q6UWD8 SNHG20-204ENST00000566583 1338 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
C16orf54Q6UWD8 CBX2-201ENST00000269399 1061 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
C16orf54Q6UWD8 PSMB6-201ENST00000270586 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
C16orf54Q6UWD8 EFHD1-202ENST00000409613 1156 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
C16orf54Q6UWD8 AC018685.2-201ENST00000414065 547 ntTSL 4 BASIC11.72□□□□□ -0.53
C16orf54Q6UWD8 AL161638.1-201ENST00000420354 481 ntTSL 3 BASIC11.72□□□□□ -0.53
C16orf54Q6UWD8 LINC01067-201ENST00000432575 664 ntTSL 3 BASIC11.72□□□□□ -0.53
C16orf54Q6UWD8 KCNQ1DN-201ENST00000441418 1093 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
C16orf54Q6UWD8 RCHY1-210ENST00000513257 759 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
C16orf54Q6UWD8 AC113383.1-201ENST00000514696 582 ntTSL 4 BASIC11.72□□□□□ -0.53
C16orf54Q6UWD8 C8orf88-201ENST00000517562 894 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.72□□□□□ -0.53
C16orf54Q6UWD8 AC067930.5-201ENST00000531730 1173 ntTSL 2 BASIC11.72□□□□□ -0.53
C16orf54Q6UWD8 STOM-203ENST00000538954 1257 ntTSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
C16orf54Q6UWD8 TAPBPL-205ENST00000544021 772 ntTSL 3 BASIC11.72□□□□□ -0.53
C16orf54Q6UWD8 SAMD11P1-201ENST00000571429 661 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
C16orf54Q6UWD8 ZNF667-AS1-202ENST00000586091 678 ntTSL 2 BASIC11.72□□□□□ -0.53
C16orf54Q6UWD8 AC008738.7-201ENST00000609744 511 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
C16orf54Q6UWD8 PSMB6-205ENST00000614486 871 ntTSL 2 BASIC11.72□□□□□ -0.53
C16orf54Q6UWD8 AC004840.1-201ENST00000636359 365 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
C16orf54Q6UWD8 CYP1A1-210ENST00000617691 2521 ntTSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
C16orf54Q6UWD8 UBA1-202ENST00000377269 2497 ntTSL 2 BASIC11.72□□□□□ -0.53
C16orf54Q6UWD8 CRB2-201ENST00000359999 3659 ntTSL 2 BASIC11.72□□□□□ -0.53
C16orf54Q6UWD8 DDHD2-205ENST00000520272 4532 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.72□□□□□ -0.53
C16orf54Q6UWD8 TRIM3-215ENST00000639856 2137 ntTSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
C16orf54Q6UWD8 SLC52A3-202ENST00000381944 3060 ntTSL 2 BASIC11.72□□□□□ -0.53
C16orf54Q6UWD8 ZNF586-202ENST00000396150 1977 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
C16orf54Q6UWD8 CLEC16A-203ENST00000409790 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
C16orf54Q6UWD8 IL1RN-203ENST00000361779 1922 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
C16orf54Q6UWD8 PIMREG-205ENST00000572447 1948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
C16orf54Q6UWD8 PMP22-201ENST00000312280 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
C16orf54Q6UWD8 ZNF663P-201ENST00000400371 2722 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
C16orf54Q6UWD8 ARRB2-204ENST00000412477 1779 ntTSL 2 BASIC11.72□□□□□ -0.53
C16orf54Q6UWD8 NFATC1-204ENST00000397790 3453 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
C16orf54Q6UWD8 CES1P1-201ENST00000421606 1704 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
C16orf54Q6UWD8 MUC20-205ENST00000447234 2589 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
C16orf54Q6UWD8 TK2-221ENST00000620035 5060 ntTSL 2 BASIC11.71□□□□□ -0.53
C16orf54Q6UWD8 AC012485.1-201ENST00000456601 2509 ntTSL 2 BASIC11.71□□□□□ -0.53
C16orf54Q6UWD8 CLN3-201ENST00000333496 1608 ntTSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
C16orf54Q6UWD8 TAB1-201ENST00000216160 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
C16orf54Q6UWD8 TPGS2-201ENST00000334295 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
C16orf54Q6UWD8 AC009227.1-201ENST00000434635 2362 ntTSL 2 BASIC11.71□□□□□ -0.53
C16orf54Q6UWD8 TDRD5-204ENST00000444136 3946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
C16orf54Q6UWD8 TPO-201ENST00000329066 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
C16orf54Q6UWD8 PPM1B-204ENST00000378551 3877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
C16orf54Q6UWD8 AP001972.5-201ENST00000624624 2338 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
C16orf54Q6UWD8 TEX28-203ENST00000617225 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
C16orf54Q6UWD8 RCAN1-214ENST00000620920 2257 ntTSL 4 BASIC11.71□□□□□ -0.53
C16orf54Q6UWD8 UVSSA-208ENST00000511563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.71□□□□□ -0.53
C16orf54Q6UWD8 WNT3A-201ENST00000284523 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
C16orf54Q6UWD8 DENND5B-202ENST00000389082 9470 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
C16orf54Q6UWD8 C20orf203-202ENST00000608990 5076 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
C16orf54Q6UWD8 COL9A2-202ENST00000372748 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
C16orf54Q6UWD8 AMHR2-202ENST00000379791 1437 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
C16orf54Q6UWD8 C5orf38-207ENST00000515640 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.71□□□□□ -0.53
C16orf54Q6UWD8 IBA57-201ENST00000366711 7817 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.71□□□□□ -0.53
C16orf54Q6UWD8 CAMSAP3-202ENST00000446248 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
C16orf54Q6UWD8 IRF9-203ENST00000557894 1391 ntTSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
C16orf54Q6UWD8 HDAC2-206ENST00000519108 2000 ntTSL 2 BASIC11.71□□□□□ -0.53
C16orf54Q6UWD8 PTPA-205ENST00000357197 2653 ntTSL 2 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.4 ms