Protein–RNA interactions for Protein: Q5VWN6

FAM208B, Protein FAM208B, humanhuman

Predictions only

Length 2,430 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM208BQ5VWN6 ZNF697-201ENST00000421812 5041 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.29□□□□□ -0.28
FAM208BQ5VWN6 ZAP70-201ENST00000264972 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
FAM208BQ5VWN6 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
FAM208BQ5VWN6 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
FAM208BQ5VWN6 NFE2L3-201ENST00000056233 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
FAM208BQ5VWN6 ASIC1-201ENST00000228468 4072 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
FAM208BQ5VWN6 SPC25-201ENST00000282074 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
FAM208BQ5VWN6 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
FAM208BQ5VWN6 LY6K-205ENST00000522591 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
FAM208BQ5VWN6 PCDHA3-201ENST00000522353 5260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
FAM208BQ5VWN6 AP2M1-207ENST00000439647 1950 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
FAM208BQ5VWN6 CFAP36-204ENST00000406691 1575 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
FAM208BQ5VWN6 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
FAM208BQ5VWN6 LINC00595-204ENST00000434974 2692 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
FAM208BQ5VWN6 AJ239322.1-201ENST00000419362 2209 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
FAM208BQ5VWN6 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
FAM208BQ5VWN6 RIMS4-201ENST00000372851 5203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
FAM208BQ5VWN6 DUSP13-210ENST00000491677 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
FAM208BQ5VWN6 SPINK2-201ENST00000248701 613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
FAM208BQ5VWN6 RNVU1-8-201ENST00000364272 125 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
FAM208BQ5VWN6 CELP-201ENST00000411440 1249 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
FAM208BQ5VWN6 PDCD2-205ENST00000537445 1114 ntTSL 3 BASIC13.29□□□□□ -0.28
FAM208BQ5VWN6 BLOC1S1-203ENST00000548925 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
FAM208BQ5VWN6 AC010183.1-201ENST00000552413 559 ntTSL 4 BASIC13.29□□□□□ -0.28
FAM208BQ5VWN6 MIAT_exon5_3.1-201ENST00000613656 377 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
FAM208BQ5VWN6 C12orf45-205ENST00000622317 1078 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
FAM208BQ5VWN6 IGFBP3-203ENST00000381086 2322 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
FAM208BQ5VWN6 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
FAM208BQ5VWN6 GPS1-202ENST00000320548 1949 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
FAM208BQ5VWN6 AL136172.1-201ENST00000598590 1394 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
FAM208BQ5VWN6 HOXB3-205ENST00000470495 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
FAM208BQ5VWN6 CD72-211ENST00000612238 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
FAM208BQ5VWN6 PIGT-207ENST00000543458 2037 ntTSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
FAM208BQ5VWN6 GALNT11-205ENST00000430044 2727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
FAM208BQ5VWN6 ITSN2-203ENST00000406921 4563 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
FAM208BQ5VWN6 TCAIM-201ENST00000342649 3687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
FAM208BQ5VWN6 IPPK-201ENST00000287996 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
FAM208BQ5VWN6 DDX19B-203ENST00000393657 1717 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
FAM208BQ5VWN6 ISPD-202ENST00000407010 5524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
FAM208BQ5VWN6 AC020910.5-201ENST00000623668 1865 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
FAM208BQ5VWN6 ADGRB2-212ENST00000527361 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
FAM208BQ5VWN6 ZNF691-201ENST00000372502 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
FAM208BQ5VWN6 PDE9A-208ENST00000398225 1963 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
FAM208BQ5VWN6 CMPK1-203ENST00000371873 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
FAM208BQ5VWN6 ASS1P1-201ENST00000402854 1237 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
FAM208BQ5VWN6 AC112721.1-201ENST00000409162 588 ntTSL 3 BASIC13.28□□□□□ -0.28
FAM208BQ5VWN6 AC004923.3-201ENST00000527532 355 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
FAM208BQ5VWN6 AC008555.6-201ENST00000605047 458 ntTSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
FAM208BQ5VWN6 AL080250.1-203ENST00000607799 747 ntTSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
FAM208BQ5VWN6 MIR6720-201ENST00000611664 98 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
FAM208BQ5VWN6 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
FAM208BQ5VWN6 ARRDC4-201ENST00000268042 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
FAM208BQ5VWN6 MRPL55-205ENST00000366731 1423 ntTSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
FAM208BQ5VWN6 CADPS2-204ENST00000412584 4308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
FAM208BQ5VWN6 APAF1-201ENST00000333991 4539 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
FAM208BQ5VWN6 VPS13B-201ENST00000355155 2822 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
FAM208BQ5VWN6 IL1RN-202ENST00000354115 1747 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
FAM208BQ5VWN6 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
FAM208BQ5VWN6 PEX6-202ENST00000304611 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
FAM208BQ5VWN6 DDX28-201ENST00000332395 2169 ntAPPRIS P1 BASIC13.28□□□□□ -0.28
FAM208BQ5VWN6 EFR3B-203ENST00000402191 3685 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
FAM208BQ5VWN6 CUX1-211ENST00000546411 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
FAM208BQ5VWN6 ABLIM3-206ENST00000506113 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
FAM208BQ5VWN6 PACS2-202ENST00000430725 2944 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
FAM208BQ5VWN6 FCHO1-201ENST00000252771 3118 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
FAM208BQ5VWN6 METTL9-201ENST00000358154 3256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
FAM208BQ5VWN6 KRTAP10-9-201ENST00000397911 1171 ntAPPRIS P2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
FAM208BQ5VWN6 WDR54-202ENST00000409791 854 ntTSL 3 BASIC13.28□□□□□ -0.28
FAM208BQ5VWN6 AL139125.1-201ENST00000420395 557 ntTSL 3 BASIC13.28□□□□□ -0.28
FAM208BQ5VWN6 AL359092.2-201ENST00000423330 585 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
FAM208BQ5VWN6 HLA-K-203ENST00000430151 1046 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
FAM208BQ5VWN6 RN7SL523P-201ENST00000484401 298 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
FAM208BQ5VWN6 AC099548.2-201ENST00000491047 571 ntTSL 4 BASIC13.28□□□□□ -0.28
FAM208BQ5VWN6 AC246817.2-204ENST00000517984 562 ntTSL 4 BASIC13.28□□□□□ -0.28
FAM208BQ5VWN6 RN7SL665P-201ENST00000578793 300 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
FAM208BQ5VWN6 AC012370.2-204ENST00000601940 1320 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
FAM208BQ5VWN6 LINC01118-203ENST00000479311 1588 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
FAM208BQ5VWN6 MEG3-205ENST00000412736 1615 ntTSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
FAM208BQ5VWN6 LDHAL6B-201ENST00000307144 1693 ntAPPRIS P1 BASIC13.28□□□□□ -0.28
FAM208BQ5VWN6 AC010096.1-201ENST00000443897 1709 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
FAM208BQ5VWN6 AL035460.1-201ENST00000380593 1866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.28
FAM208BQ5VWN6 ACSM2B-211ENST00000567001 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
FAM208BQ5VWN6 APBB1-219ENST00000608704 2095 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.28
FAM208BQ5VWN6 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
FAM208BQ5VWN6 PRPF3-201ENST00000324862 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
FAM208BQ5VWN6 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
FAM208BQ5VWN6 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
FAM208BQ5VWN6 NF2-210ENST00000413209 4733 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
FAM208BQ5VWN6 ACTN2-207ENST00000546208 5103 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
FAM208BQ5VWN6 DDHD2-205ENST00000520272 4532 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.28
FAM208BQ5VWN6 AMFR-201ENST00000290649 3600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
FAM208BQ5VWN6 ABHD15-201ENST00000307201 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
FAM208BQ5VWN6 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
FAM208BQ5VWN6 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC13.27□□□□□ -0.28
FAM208BQ5VWN6 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
FAM208BQ5VWN6 LINC00921-202ENST00000573951 2468 ntTSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.28
FAM208BQ5VWN6 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
FAM208BQ5VWN6 PHF1-202ENST00000374516 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
FAM208BQ5VWN6 ACSF2-202ENST00000427954 2251 ntTSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.28
FAM208BQ5VWN6 POTEI-202ENST00000615053 1926 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39 ms