Protein–RNA interactions for Protein: Q5VTT2

C9orf135, Protein C9orf135, humanhuman

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Length 229 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf135Q5VTT2 AP000552.1-208ENST00000452952 576 ntTSL 4 BASIC13.37□□□□□ -0.27
C9orf135Q5VTT2 AC022616.1-201ENST00000518688 554 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
C9orf135Q5VTT2 OMP-201ENST00000529803 492 ntAPPRIS P1 BASIC13.37□□□□□ -0.27
C9orf135Q5VTT2 GCHFR-203ENST00000558670 412 ntTSL 3 BASIC13.37□□□□□ -0.27
C9orf135Q5VTT2 HIRIP3-204ENST00000564026 988 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
C9orf135Q5VTT2 GNRHR2-203ENST00000581100 1187 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
C9orf135Q5VTT2 IFT20-216ENST00000588477 774 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
C9orf135Q5VTT2 C19orf53-206ENST00000593274 491 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
C9orf135Q5VTT2 SCGB1C2-201ENST00000595228 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
C9orf135Q5VTT2 Metazoa_SRP.80-201ENST00000619894 320 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
C9orf135Q5VTT2 FP236240.1-204ENST00000624932 712 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
C9orf135Q5VTT2 RAB34-222ENST00000625712 994 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
C9orf135Q5VTT2 SERF2-217ENST00000630046 862 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
C9orf135Q5VTT2 PRSS30P-206ENST00000641773 873 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
C9orf135Q5VTT2 CSF2RB-202ENST00000403662 4863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
C9orf135Q5VTT2 TJP2-208ENST00000535702 3984 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
C9orf135Q5VTT2 C17orf80-203ENST00000359042 3645 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
C9orf135Q5VTT2 TJAP1-207ENST00000436109 2572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
C9orf135Q5VTT2 RTP1-201ENST00000312295 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
C9orf135Q5VTT2 GSG1L-203ENST00000447459 4916 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
C9orf135Q5VTT2 HSD17B6-201ENST00000322165 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
C9orf135Q5VTT2 GRAMD2B-201ENST00000285689 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
C9orf135Q5VTT2 NAALADL1-203ENST00000356632 2118 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
C9orf135Q5VTT2 SUMO3-203ENST00000397898 1779 ntTSL 3 BASIC13.37□□□□□ -0.27
C9orf135Q5VTT2 TGFB1I1-214ENST00000567607 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
C9orf135Q5VTT2 OSBP2-209ENST00000438716 2747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
C9orf135Q5VTT2 CNOT8-204ENST00000517876 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
C9orf135Q5VTT2 PTPRH-201ENST00000263434 3343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
C9orf135Q5VTT2 GLUL-203ENST00000339526 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
C9orf135Q5VTT2 TRIM25-201ENST00000316881 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
C9orf135Q5VTT2 OAS1-202ENST00000445409 1684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
C9orf135Q5VTT2 GABARAPL1-218ENST00000546017 2294 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
C9orf135Q5VTT2 SERPINE2-202ENST00000409304 2161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
C9orf135Q5VTT2 MBD1-211ENST00000585595 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
C9orf135Q5VTT2 ARFIP1-204ENST00000429148 1599 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
C9orf135Q5VTT2 TDRKH-204ENST00000368825 2651 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
C9orf135Q5VTT2 GGACT-202ENST00000455100 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
C9orf135Q5VTT2 FOXRED1-213ENST00000532125 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
C9orf135Q5VTT2 SRRD-201ENST00000215917 4020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
C9orf135Q5VTT2 AC138028.2-202ENST00000567968 4528 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
C9orf135Q5VTT2 DUS2-207ENST00000565263 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
C9orf135Q5VTT2 TMEM170A-207ENST00000569540 2331 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
C9orf135Q5VTT2 CLEC18C-210ENST00000569347 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
C9orf135Q5VTT2 PIGT-202ENST00000279036 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
C9orf135Q5VTT2 LINC00691-201ENST00000432505 2232 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
C9orf135Q5VTT2 ANKRD44-203ENST00000409153 2724 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
C9orf135Q5VTT2 SOWAHA-201ENST00000378693 3211 ntAPPRIS P1 BASIC13.36□□□□□ -0.27
C9orf135Q5VTT2 CIC-207ENST00000575354 5473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
C9orf135Q5VTT2 KBTBD12-202ENST00000405109 5727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
C9orf135Q5VTT2 MPPE1-201ENST00000309976 1636 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
C9orf135Q5VTT2 MIER1-209ENST00000401042 1648 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
C9orf135Q5VTT2 LILRP1-201ENST00000444199 1370 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
C9orf135Q5VTT2 CREB3L3-204ENST00000602147 1382 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
C9orf135Q5VTT2 TLN1-201ENST00000314888 8823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
C9orf135Q5VTT2 SGCE-205ENST00000437425 1508 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
C9orf135Q5VTT2 SMYD3-214ENST00000490107 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
C9orf135Q5VTT2 CMA1-202ENST00000250378 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
C9orf135Q5VTT2 C10orf62-201ENST00000370640 1208 ntAPPRIS P1 BASIC13.36□□□□□ -0.27
C9orf135Q5VTT2 ZG16B-201ENST00000382280 831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
C9orf135Q5VTT2 NDUFC1-201ENST00000394223 598 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.36□□□□□ -0.27
C9orf135Q5VTT2 DSCR3-202ENST00000398998 988 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
C9orf135Q5VTT2 MIR1909-201ENST00000411312 80 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
C9orf135Q5VTT2 USB1-202ENST00000423271 1217 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
C9orf135Q5VTT2 AC233976.1-201ENST00000425150 451 ntTSL 3 BASIC13.36□□□□□ -0.27
C9orf135Q5VTT2 KCNQ1-AS1-201ENST00000440887 1084 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
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C9orf135Q5VTT2 RPL8-205ENST00000527914 551 ntTSL 3 BASIC13.36□□□□□ -0.27
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C9orf135Q5VTT2 CRTC1-202ENST00000338797 6929 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
C9orf135Q5VTT2 FKBP6-204ENST00000431982 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
C9orf135Q5VTT2 MAGEA8-205ENST00000542674 2084 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.36□□□□□ -0.27
C9orf135Q5VTT2 UROC1-202ENST00000383579 2735 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
C9orf135Q5VTT2 ATP8B3-201ENST00000310127 5095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
C9orf135Q5VTT2 NRAS-201ENST00000369535 4449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
C9orf135Q5VTT2 PAK4-205ENST00000593690 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
C9orf135Q5VTT2 PPP1CB-203ENST00000395366 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
C9orf135Q5VTT2 RUNDC1-201ENST00000361677 3828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
C9orf135Q5VTT2 MEGF10-206ENST00000508365 2365 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
C9orf135Q5VTT2 MED16-207ENST00000589119 2772 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
C9orf135Q5VTT2 SNRNP27-202ENST00000409116 1339 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
C9orf135Q5VTT2 POLD3-208ENST00000532497 1700 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
C9orf135Q5VTT2 HSPA1B-201ENST00000375650 2521 ntAPPRIS P1 BASIC13.36□□□□□ -0.27
C9orf135Q5VTT2 FKRP-201ENST00000318584 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
C9orf135Q5VTT2 ZBED1-203ENST00000381223 4510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
C9orf135Q5VTT2 AJUBA-201ENST00000262713 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
C9orf135Q5VTT2 JPH4-205ENST00000622501 3489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
C9orf135Q5VTT2 CES4A-203ENST00000535696 1472 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
C9orf135Q5VTT2 TOM1L2-202ENST00000379504 2418 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
C9orf135Q5VTT2 SETD1A-201ENST00000262519 6451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
C9orf135Q5VTT2 CAP1-205ENST00000372802 2964 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
C9orf135Q5VTT2 DBF4-201ENST00000265728 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
C9orf135Q5VTT2 ASPH-202ENST00000379449 1603 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
C9orf135Q5VTT2 CAB39-201ENST00000258418 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
C9orf135Q5VTT2 ZNF607-201ENST00000355202 4364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
C9orf135Q5VTT2 IL17RA-201ENST00000319363 8607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
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