Protein–RNA interactions for Protein: Q5PSV4

BRMS1L, Breast cancer metastasis-suppressor 1-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 323 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRMS1LQ5PSV4 INTS11-204ENST00000421495 1868 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
BRMS1LQ5PSV4 AC020910.5-201ENST00000623668 1865 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
BRMS1LQ5PSV4 ASIC4-201ENST00000347842 2684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
BRMS1LQ5PSV4 GRK5-202ENST00000392870 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
BRMS1LQ5PSV4 CERS3-202ENST00000394113 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
BRMS1LQ5PSV4 FARP1-214ENST00000595437 4926 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
BRMS1LQ5PSV4 DCBLD1-202ENST00000338728 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
BRMS1LQ5PSV4 KRT17-201ENST00000311208 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
BRMS1LQ5PSV4 MAGI3-204ENST00000369617 3911 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
BRMS1LQ5PSV4 BRCC3-201ENST00000330045 2496 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
BRMS1LQ5PSV4 TNS2-201ENST00000314250 5010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
BRMS1LQ5PSV4 MAGED4B-207ENST00000485287 2618 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
BRMS1LQ5PSV4 GPN1-212ENST00000616939 1832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
BRMS1LQ5PSV4 ME2-201ENST00000321341 9415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
BRMS1LQ5PSV4 DGKI-201ENST00000288490 3895 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
BRMS1LQ5PSV4 SYT13-201ENST00000020926 5144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
BRMS1LQ5PSV4 ZNF365-205ENST00000395254 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
BRMS1LQ5PSV4 SLC25A38-201ENST00000273158 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
BRMS1LQ5PSV4 BCAR3-210ENST00000539242 2114 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
BRMS1LQ5PSV4 GSK3B-201ENST00000264235 7711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
BRMS1LQ5PSV4 AC099063.4-201ENST00000641099 1602 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
BRMS1LQ5PSV4 FKBP9-201ENST00000242209 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
BRMS1LQ5PSV4 SH3KBP1-201ENST00000379697 1944 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
BRMS1LQ5PSV4 CLIC5-208ENST00000544153 2051 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
BRMS1LQ5PSV4 USP47-207ENST00000527733 4525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
BRMS1LQ5PSV4 LAT2-202ENST00000344995 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
BRMS1LQ5PSV4 LRP8-202ENST00000347547 2382 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
BRMS1LQ5PSV4 NFKB2-203ENST00000369966 3101 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
BRMS1LQ5PSV4 DIS3-202ENST00000377780 5232 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
BRMS1LQ5PSV4 LCN9-201ENST00000277526 531 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
BRMS1LQ5PSV4 GNAQ-201ENST00000286548 6539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
BRMS1LQ5PSV4 BATF-201ENST00000286639 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
BRMS1LQ5PSV4 TMEM141-201ENST00000290079 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
BRMS1LQ5PSV4 TIGD4-201ENST00000304337 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
BRMS1LQ5PSV4 SPAG11A-201ENST00000326558 612 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
BRMS1LQ5PSV4 NEK2-201ENST00000366998 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
BRMS1LQ5PSV4 FAM27C-201ENST00000377542 616 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
BRMS1LQ5PSV4 PHACTR1-202ENST00000379329 707 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
BRMS1LQ5PSV4 CRIP1-202ENST00000392531 485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
BRMS1LQ5PSV4 SELENOM-201ENST00000400299 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
BRMS1LQ5PSV4 FAM221A-203ENST00000409653 761 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
BRMS1LQ5PSV4 FAM221A-204ENST00000409994 1136 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
BRMS1LQ5PSV4 RGS5-214ENST00000429865 754 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
BRMS1LQ5PSV4 AL355994.2-201ENST00000447882 704 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
BRMS1LQ5PSV4 HOMER2P2-201ENST00000451621 847 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
BRMS1LQ5PSV4 STAG3L5P-205ENST00000473757 1255 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
BRMS1LQ5PSV4 RNF216P1-213ENST00000494947 946 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
BRMS1LQ5PSV4 MIR4259-201ENST00000584466 101 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
BRMS1LQ5PSV4 YIF1B-215ENST00000592246 936 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
BRMS1LQ5PSV4 AL359881.2-201ENST00000602973 570 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
BRMS1LQ5PSV4 NID2-208ENST00000617139 3827 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
BRMS1LQ5PSV4 LCN9-204ENST00000619315 528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
BRMS1LQ5PSV4 AL391650.2-201ENST00000640097 941 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
BRMS1LQ5PSV4 SH3BP2-207ENST00000503393 9158 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
BRMS1LQ5PSV4 FAM198B-203ENST00000585682 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
BRMS1LQ5PSV4 CALD1-206ENST00000424922 2124 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
BRMS1LQ5PSV4 PTGES3L-AARSD1-202ENST00000409103 1670 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
BRMS1LQ5PSV4 KCNJ2-202ENST00000535240 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
BRMS1LQ5PSV4 AL162231.1-201ENST00000421828 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
BRMS1LQ5PSV4 NFIX-208ENST00000587260 1537 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
BRMS1LQ5PSV4 CRCP-201ENST00000338592 1393 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
BRMS1LQ5PSV4 RGS3-201ENST00000317613 2542 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
BRMS1LQ5PSV4 KHK-201ENST00000260598 2397 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
BRMS1LQ5PSV4 TPBG-202ENST00000535040 3392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
BRMS1LQ5PSV4 MEGF10-202ENST00000418761 2238 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
BRMS1LQ5PSV4 TPO-203ENST00000346956 2923 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
BRMS1LQ5PSV4 DEPDC7-201ENST00000241051 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
BRMS1LQ5PSV4 DNAJC7-202ENST00000426588 1774 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
BRMS1LQ5PSV4 AP1S3-206ENST00000443700 1785 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
BRMS1LQ5PSV4 ACSL1-208ENST00000507295 2490 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
BRMS1LQ5PSV4 AC079336.5-201ENST00000581360 2480 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
BRMS1LQ5PSV4 RSPH6A-202ENST00000597055 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
BRMS1LQ5PSV4 CCDC121-202ENST00000394775 1472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
BRMS1LQ5PSV4 AL109910.1-201ENST00000452071 1330 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
BRMS1LQ5PSV4 SLC22A7-202ENST00000372585 2555 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
BRMS1LQ5PSV4 DIRAS2-201ENST00000375765 4386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
BRMS1LQ5PSV4 KAT5-216ENST00000534650 1875 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
BRMS1LQ5PSV4 DLGAP1-214ENST00000539435 2402 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
BRMS1LQ5PSV4 PRKX-201ENST00000262848 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
BRMS1LQ5PSV4 MEIOC-201ENST00000409122 4604 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
BRMS1LQ5PSV4 MKNK2-201ENST00000250896 3774 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
BRMS1LQ5PSV4 IDH2-201ENST00000330062 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
BRMS1LQ5PSV4 OTUD3-201ENST00000375120 6397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
BRMS1LQ5PSV4 FAM103A1-201ENST00000304191 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
BRMS1LQ5PSV4 TMEM230-202ENST00000342308 1562 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
BRMS1LQ5PSV4 SEPT8-206ENST00000378706 4168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
BRMS1LQ5PSV4 PRPF40B-201ENST00000261897 3602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
BRMS1LQ5PSV4 GRB7-203ENST00000394209 1955 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
BRMS1LQ5PSV4 RABL2B-202ENST00000395590 2380 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
BRMS1LQ5PSV4 SEC24D-202ENST00000419654 2786 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
BRMS1LQ5PSV4 RPS6KL1-201ENST00000354625 5195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
BRMS1LQ5PSV4 CD79A-201ENST00000221972 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
BRMS1LQ5PSV4 NOL4L-202ENST00000326071 701 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
BRMS1LQ5PSV4 AL162457.2-202ENST00000442888 679 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
BRMS1LQ5PSV4 SYNPR-202ENST00000450542 1004 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
BRMS1LQ5PSV4 RNA5SP412-201ENST00000516234 123 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
BRMS1LQ5PSV4 C8orf37-AS1-202ENST00000517655 562 ntTSL 4 BASIC15.46■□□□□ 0.07
BRMS1LQ5PSV4 NDUFC1-210ENST00000539387 725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
BRMS1LQ5PSV4 AF111167.2-202ENST00000558267 599 ntTSL 4 BASIC15.46■□□□□ 0.07
BRMS1LQ5PSV4 PIGH-209ENST00000559581 1049 ntTSL 4 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.7 ms