Protein–RNA interactions for Protein: Q53GQ0

HSD17B12, Very-long-chain 3-oxoacyl-CoA reductase, humanhuman

Predictions only

Length 312 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HSD17B12Q53GQ0 RPL18-214ENST00000552588 559 ntTSL 3 BASIC13.33□□□□□ -0.28
HSD17B12Q53GQ0 AC025162.1-201ENST00000554022 565 ntTSL 4 BASIC13.33□□□□□ -0.28
HSD17B12Q53GQ0 TGIF2-C20orf24-201ENST00000558530 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.33□□□□□ -0.28
HSD17B12Q53GQ0 LINC00473-203ENST00000581850 929 ntTSL 3 BASIC13.33□□□□□ -0.28
HSD17B12Q53GQ0 AC018529.1-201ENST00000613063 361 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
HSD17B12Q53GQ0 HNRNPH1-250ENST00000630639 123 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
HSD17B12Q53GQ0 LINC00466-208ENST00000635218 1217 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
HSD17B12Q53GQ0 MARVELD3-201ENST00000268485 2912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
HSD17B12Q53GQ0 DNAJC3-AS1-201ENST00000499499 2908 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
HSD17B12Q53GQ0 MIRLET7BHG-201ENST00000360737 4560 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
HSD17B12Q53GQ0 GUF1-201ENST00000281543 4449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
HSD17B12Q53GQ0 C7orf49-201ENST00000393114 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
HSD17B12Q53GQ0 PIGT-202ENST00000279036 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
HSD17B12Q53GQ0 AC089987.1-201ENST00000551654 2209 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
HSD17B12Q53GQ0 FRMD8-201ENST00000317568 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
HSD17B12Q53GQ0 CDH16-202ENST00000394055 2821 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
HSD17B12Q53GQ0 ITPK1-207ENST00000555495 3035 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
HSD17B12Q53GQ0 AC092506.1-201ENST00000634580 2275 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
HSD17B12Q53GQ0 ANO10-205ENST00000414522 2450 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
HSD17B12Q53GQ0 IFNA6-202ENST00000380210 1544 ntAPPRIS P1 BASIC13.33□□□□□ -0.28
HSD17B12Q53GQ0 AC015818.8-201ENST00000587907 1519 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
HSD17B12Q53GQ0 NAXD-201ENST00000309957 2659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
HSD17B12Q53GQ0 PIK3R5-216ENST00000584803 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
HSD17B12Q53GQ0 SLC1A6-201ENST00000221742 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
HSD17B12Q53GQ0 PLTP-203ENST00000372431 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
HSD17B12Q53GQ0 RBPMS2-202ENST00000560606 1746 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
HSD17B12Q53GQ0 ESS2-201ENST00000252137 5392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
HSD17B12Q53GQ0 ABAT-203ENST00000425191 1923 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
HSD17B12Q53GQ0 SP8-203ENST00000617581 3496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
HSD17B12Q53GQ0 TMEM231-207ENST00000568377 2920 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
HSD17B12Q53GQ0 CCDC88A-204ENST00000413716 9586 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
HSD17B12Q53GQ0 CORO7-201ENST00000251166 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
HSD17B12Q53GQ0 SCUBE2-201ENST00000309263 3727 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
HSD17B12Q53GQ0 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
HSD17B12Q53GQ0 KLK5-203ENST00000593428 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
HSD17B12Q53GQ0 DDX55-203ENST00000421670 1574 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
HSD17B12Q53GQ0 CDKL3-206ENST00000521118 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
HSD17B12Q53GQ0 MGLL-201ENST00000265052 4642 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
HSD17B12Q53GQ0 TRIM65-201ENST00000269383 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
HSD17B12Q53GQ0 SFMBT2-203ENST00000379713 2402 ntTSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
HSD17B12Q53GQ0 ZNF846-201ENST00000397902 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
HSD17B12Q53GQ0 NR4A1-213ENST00000550082 2029 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
HSD17B12Q53GQ0 DCHS1-201ENST00000299441 10765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
HSD17B12Q53GQ0 WNT9B-202ENST00000393461 2654 ntTSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
HSD17B12Q53GQ0 TFAM-204ENST00000487519 5414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
HSD17B12Q53GQ0 C10orf71-201ENST00000374144 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
HSD17B12Q53GQ0 LARP4-201ENST00000293618 6296 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
HSD17B12Q53GQ0 ENDOV-206ENST00000518901 2549 ntTSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
HSD17B12Q53GQ0 TMEM230-201ENST00000202834 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
HSD17B12Q53GQ0 AC104758.3-201ENST00000563349 1453 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
HSD17B12Q53GQ0 NEDD4L-238ENST00000635997 4402 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
HSD17B12Q53GQ0 CCL25-201ENST00000253451 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
HSD17B12Q53GQ0 LCE1B-201ENST00000360090 1139 ntAPPRIS P1 BASIC13.32□□□□□ -0.28
HSD17B12Q53GQ0 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
HSD17B12Q53GQ0 MAD1L1-204ENST00000406869 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
HSD17B12Q53GQ0 MED15P5-201ENST00000423150 992 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
HSD17B12Q53GQ0 MNX1-AS2-201ENST00000429228 374 ntTSL 3 BASIC13.32□□□□□ -0.28
HSD17B12Q53GQ0 AC022201.2-201ENST00000445084 287 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
HSD17B12Q53GQ0 DDIT4-AS1-201ENST00000491934 847 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
HSD17B12Q53GQ0 AC106872.10-201ENST00000503778 747 ntTSL 3 BASIC13.32□□□□□ -0.28
HSD17B12Q53GQ0 ZNF331-217ENST00000512387 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
HSD17B12Q53GQ0 LINC02055-207ENST00000524346 706 ntTSL 3 BASIC13.32□□□□□ -0.28
HSD17B12Q53GQ0 AC067930.5-201ENST00000531730 1173 ntTSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
HSD17B12Q53GQ0 RPL13-214ENST00000567815 712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.32□□□□□ -0.28
HSD17B12Q53GQ0 LITAF-210ENST00000571976 548 ntTSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
HSD17B12Q53GQ0 LITAF-214ENST00000574703 486 ntTSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
HSD17B12Q53GQ0 CUEDC1-207ENST00000577840 875 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
HSD17B12Q53GQ0 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC13.32□□□□□ -0.28
HSD17B12Q53GQ0 IZUMO4-213ENST00000620263 947 ntTSL 3 BASIC13.32□□□□□ -0.28
HSD17B12Q53GQ0 AC023090.2-201ENST00000625182 2110 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
HSD17B12Q53GQ0 WDR66-201ENST00000288912 4467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
HSD17B12Q53GQ0 TMPRSS3-203ENST00000398405 2754 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
HSD17B12Q53GQ0 MAPRE2-201ENST00000300249 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
HSD17B12Q53GQ0 CDCA3-207ENST00000538862 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
HSD17B12Q53GQ0 SFSWAP-201ENST00000261674 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
HSD17B12Q53GQ0 PRKD1-209ENST00000616995 3498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
HSD17B12Q53GQ0 DNER-201ENST00000341772 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
HSD17B12Q53GQ0 PLXNB2-207ENST00000449103 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
HSD17B12Q53GQ0 PRELP-201ENST00000343110 5747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
HSD17B12Q53GQ0 LGR5-201ENST00000266674 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
HSD17B12Q53GQ0 RNASE1-202ENST00000397967 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
HSD17B12Q53GQ0 PSMC1-201ENST00000261303 4448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
HSD17B12Q53GQ0 FAM219B-201ENST00000357635 3550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
HSD17B12Q53GQ0 AC093668.2-201ENST00000481893 3569 ntTSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
HSD17B12Q53GQ0 AC105052.1-201ENST00000519541 3569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
HSD17B12Q53GQ0 SLC19A1-201ENST00000311124 3811 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
HSD17B12Q53GQ0 METTL17-202ENST00000382985 1586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
HSD17B12Q53GQ0 EFR3B-202ENST00000401432 5162 ntTSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
HSD17B12Q53GQ0 AC104407.1-201ENST00000511017 1568 ntTSL 3 BASIC13.32□□□□□ -0.28
HSD17B12Q53GQ0 PCK2-216ENST00000561286 2012 ntTSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
HSD17B12Q53GQ0 ALDOA-209ENST00000563060 1550 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
HSD17B12Q53GQ0 TMEM87B-201ENST00000283206 5212 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
HSD17B12Q53GQ0 TGFB1I1-202ENST00000394858 1803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
HSD17B12Q53GQ0 ZW10-201ENST00000200135 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
HSD17B12Q53GQ0 PRR22-202ENST00000419421 1392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
HSD17B12Q53GQ0 CASC2-202ENST00000426021 3232 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
HSD17B12Q53GQ0 NCOR2-202ENST00000404121 7175 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
HSD17B12Q53GQ0 PIKFYVE-202ENST00000308862 1640 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
HSD17B12Q53GQ0 NRXN1-222ENST00000625672 8113 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
HSD17B12Q53GQ0 ASAH1-258ENST00000637790 3042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.6 ms