Protein–RNA interactions for Protein: Q4LDR2

CTXN3, Cortexin-3, humanhuman

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Length 81 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTXN3Q4LDR2 NFATC4-218ENST00000554966 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CTXN3Q4LDR2 NFATC4-225ENST00000556169 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CTXN3Q4LDR2 RALGPS1-203ENST00000373434 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CTXN3Q4LDR2 EPS15L1-207ENST00000594975 2489 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CTXN3Q4LDR2 LCOR-202ENST00000356016 4834 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CTXN3Q4LDR2 PDE4A-203ENST00000380702 4781 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CTXN3Q4LDR2 GP5-201ENST00000401815 3534 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CTXN3Q4LDR2 ACSF2-202ENST00000427954 2251 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CTXN3Q4LDR2 YARS-201ENST00000373477 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CTXN3Q4LDR2 MSI2-201ENST00000284073 6364 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CTXN3Q4LDR2 NEK11-210ENST00000510769 2149 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CTXN3Q4LDR2 HIF3A-218ENST00000600383 2101 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CTXN3Q4LDR2 CACFD1-202ENST00000316948 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CTXN3Q4LDR2 SATB2-206ENST00000457245 2656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CTXN3Q4LDR2 HORMAD1-201ENST00000322343 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CTXN3Q4LDR2 CHAF1A-201ENST00000301280 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CTXN3Q4LDR2 APBA2-205ENST00000558330 3349 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CTXN3Q4LDR2 AL390038.1-201ENST00000419814 2481 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CTXN3Q4LDR2 AL359258.1-201ENST00000438965 2481 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CTXN3Q4LDR2 PLPP3-201ENST00000371250 3292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CTXN3Q4LDR2 ABCB8-212ENST00000477719 1625 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CTXN3Q4LDR2 GRN-201ENST00000053867 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CTXN3Q4LDR2 TMEM9-204ENST00000367334 1529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CTXN3Q4LDR2 GPBAR1-203ENST00000521462 1465 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CTXN3Q4LDR2 HNRNPUL1-220ENST00000602130 2932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CTXN3Q4LDR2 FEM1B-201ENST00000306917 7122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CTXN3Q4LDR2 PTOV1-214ENST00000600603 1443 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CTXN3Q4LDR2 PACSIN2-204ENST00000403744 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CTXN3Q4LDR2 PDP1-203ENST00000517764 2140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CTXN3Q4LDR2 HNF1A-211ENST00000543427 2819 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CTXN3Q4LDR2 SF3B4-201ENST00000271628 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CTXN3Q4LDR2 POLD4-201ENST00000312419 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CTXN3Q4LDR2 SDCCAG3P2-201ENST00000326105 1023 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
CTXN3Q4LDR2 AL662890.1-201ENST00000396818 632 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
CTXN3Q4LDR2 AC007731.4-201ENST00000420225 652 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CTXN3Q4LDR2 AL157392.3-216ENST00000437446 462 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CTXN3Q4LDR2 AC011742.3-201ENST00000439053 820 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
CTXN3Q4LDR2 SPTLC1P5-201ENST00000450718 252 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
CTXN3Q4LDR2 AL358393.1-201ENST00000456771 532 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CTXN3Q4LDR2 AC106047.1-202ENST00000467484 482 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CTXN3Q4LDR2 RCAN1-212ENST00000492600 935 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CTXN3Q4LDR2 AC022217.1-201ENST00000521069 738 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
CTXN3Q4LDR2 MRPL51-202ENST00000537701 601 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CTXN3Q4LDR2 AC005324.6-201ENST00000587972 613 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
CTXN3Q4LDR2 AC084346.2-201ENST00000607097 949 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
CTXN3Q4LDR2 AC234782.2-201ENST00000614615 1240 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CTXN3Q4LDR2 AC091544.8-201ENST00000619490 361 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
CTXN3Q4LDR2 IGHV1OR21-1-201ENST00000622028 353 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CTXN3Q4LDR2 PCBP2-OT1-201ENST00000634357 590 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
CTXN3Q4LDR2 LINC00854-216ENST00000636331 718 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CTXN3Q4LDR2 TBC1D3P5-202ENST00000581469 2513 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CTXN3Q4LDR2 DHODH-201ENST00000219240 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CTXN3Q4LDR2 NSFL1C-201ENST00000216879 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CTXN3Q4LDR2 PUS7-202ENST00000469408 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CTXN3Q4LDR2 SERPING1-204ENST00000378324 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CTXN3Q4LDR2 TMED7-TICAM2-202ENST00000333314 3453 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CTXN3Q4LDR2 BRF1-201ENST00000327359 2292 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CTXN3Q4LDR2 GRIN2A-201ENST00000330684 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CTXN3Q4LDR2 RTP1-201ENST00000312295 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CTXN3Q4LDR2 RHOBTB2-206ENST00000522948 4959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CTXN3Q4LDR2 INHBB-201ENST00000295228 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CTXN3Q4LDR2 COL11A2-201ENST00000341947 6425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CTXN3Q4LDR2 AL109954.1-202ENST00000564051 2148 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
CTXN3Q4LDR2 ZNF706-201ENST00000311212 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CTXN3Q4LDR2 GATA4-206ENST00000528712 2614 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CTXN3Q4LDR2 ENDOU-203ENST00000545824 1513 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CTXN3Q4LDR2 CERS3-202ENST00000394113 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CTXN3Q4LDR2 HSPA1B-201ENST00000375650 2521 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CTXN3Q4LDR2 SURF4-202ENST00000371989 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CTXN3Q4LDR2 PDRG1-201ENST00000202017 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CTXN3Q4LDR2 SCML4-201ENST00000369020 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CTXN3Q4LDR2 DAAM2-211ENST00000633794 3871 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CTXN3Q4LDR2 ACTL7B-201ENST00000374667 2379 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CTXN3Q4LDR2 SNCAIP-207ENST00000504884 1885 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CTXN3Q4LDR2 LRP11-201ENST00000239367 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CTXN3Q4LDR2 KAAG1-201ENST00000274766 1382 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CTXN3Q4LDR2 ZNF815P-201ENST00000421890 1352 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CTXN3Q4LDR2 ERO1B-202ENST00000354619 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CTXN3Q4LDR2 TSSK2-201ENST00000399635 1816 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CTXN3Q4LDR2 TM4SF19-AS1-203ENST00000452051 1829 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CTXN3Q4LDR2 LINC01267-201ENST00000502417 2284 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CTXN3Q4LDR2 SLC6A2-204ENST00000561820 2268 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CTXN3Q4LDR2 CHTF18-205ENST00000455171 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CTXN3Q4LDR2 SLITRK2-202ENST00000370490 7672 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CTXN3Q4LDR2 NUMBL-201ENST00000252891 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CTXN3Q4LDR2 ZNF7-202ENST00000446747 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CTXN3Q4LDR2 CCNA1-204ENST00000630422 1751 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CTXN3Q4LDR2 TUBBP5-203ENST00000508529 1334 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
CTXN3Q4LDR2 C9orf47-201ENST00000334490 4829 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CTXN3Q4LDR2 TLE3-223ENST00000560939 3021 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CTXN3Q4LDR2 ASB3-202ENST00000394717 1734 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CTXN3Q4LDR2 RAB40AL-201ENST00000218249 1029 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CTXN3Q4LDR2 NPPA-201ENST00000376476 728 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CTXN3Q4LDR2 NIF3L1-205ENST00000409588 1269 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CTXN3Q4LDR2 AL008707.1-201ENST00000422498 534 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
CTXN3Q4LDR2 TREML1-202ENST00000426005 981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CTXN3Q4LDR2 AC092800.1-201ENST00000449492 579 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CTXN3Q4LDR2 RPL18P13-201ENST00000478088 569 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
CTXN3Q4LDR2 ALG3P1-201ENST00000508806 1114 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
CTXN3Q4LDR2 AGTRAP-212ENST00000510878 849 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
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