Protein–RNA interactions for Protein: Q3LI58

KRTAP21-1, Keratin-associated protein 21-1, humanhuman

Predictions only

Length 79 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP21-1Q3LI58 IP6K2-221ENST00000449610 1673 ntTSL 2 BASIC2.31□□□□□ -2.04
KRTAP21-1Q3LI58 UGT3A1-204ENST00000507113 1650 ntTSL 2 BASIC2.31□□□□□ -2.04
KRTAP21-1Q3LI58 PRKAB1-205ENST00000540121 1673 ntTSL 5 BASIC2.31□□□□□ -2.04
KRTAP21-1Q3LI58 FANCA-213ENST00000563673 1694 ntTSL 1 (best) BASIC2.31□□□□□ -2.04
KRTAP21-1Q3LI58 IKBKG-208ENST00000611176 1654 ntTSL 2 BASIC2.31□□□□□ -2.04
KRTAP21-1Q3LI58 USP10-201ENST00000219473 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.31□□□□□ -2.04
KRTAP21-1Q3LI58 ENG-202ENST00000373203 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.31□□□□□ -2.04
KRTAP21-1Q3LI58 EPHB4-210ENST00000616502 3737 ntTSL 5 BASIC2.31□□□□□ -2.04
KRTAP21-1Q3LI58 EPB42-202ENST00000441366 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.31□□□□□ -2.04
KRTAP21-1Q3LI58 CREB3L2-204ENST00000456390 2360 ntTSL 2 BASIC2.31□□□□□ -2.04
KRTAP21-1Q3LI58 SYT6-205ENST00000609117 4424 ntTSL 5 BASIC2.31□□□□□ -2.04
KRTAP21-1Q3LI58 DDR1-262ENST00000508312 3073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.31□□□□□ -2.04
KRTAP21-1Q3LI58 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.31□□□□□ -2.04
KRTAP21-1Q3LI58 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.31□□□□□ -2.04
KRTAP21-1Q3LI58 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.31□□□□□ -2.04
KRTAP21-1Q3LI58 GALNT9-202ENST00000397325 1727 ntTSL 1 (best) BASIC2.31□□□□□ -2.04
KRTAP21-1Q3LI58 ANKRD20A7P-201ENST00000402318 2414 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
KRTAP21-1Q3LI58 NID2-208ENST00000617139 3827 ntTSL 5 BASIC2.31□□□□□ -2.04
KRTAP21-1Q3LI58 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.31□□□□□ -2.04
KRTAP21-1Q3LI58 ZFP91-201ENST00000316059 5220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.31□□□□□ -2.04
KRTAP21-1Q3LI58 CPAMD8-203ENST00000443236 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.31□□□□□ -2.04
KRTAP21-1Q3LI58 RAB33B-201ENST00000305626 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.31□□□□□ -2.04
KRTAP21-1Q3LI58 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.31□□□□□ -2.04
KRTAP21-1Q3LI58 LINC01019-201ENST00000505443 3199 ntTSL 1 (best) BASIC2.31□□□□□ -2.04
KRTAP21-1Q3LI58 EYA3-202ENST00000373864 2459 ntTSL 5 BASIC2.31□□□□□ -2.04
KRTAP21-1Q3LI58 ANXA6-215ENST00000523714 2451 ntTSL 2 BASIC2.31□□□□□ -2.04
KRTAP21-1Q3LI58 AC138749.1-201ENST00000567652 2472 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
KRTAP21-1Q3LI58 PDK2-216ENST00000614357 2493 ntTSL 5 BASIC2.31□□□□□ -2.04
KRTAP21-1Q3LI58 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.31□□□□□ -2.04
KRTAP21-1Q3LI58 NT5C3A-204ENST00000405342 1759 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.31□□□□□ -2.04
KRTAP21-1Q3LI58 AL034550.2-201ENST00000620523 1771 ntTSL 2 BASIC2.31□□□□□ -2.04
KRTAP21-1Q3LI58 MYBPH-202ENST00000621380 1772 ntTSL 5 BASIC2.31□□□□□ -2.04
KRTAP21-1Q3LI58 CCNA1-204ENST00000630422 1751 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.31□□□□□ -2.04
KRTAP21-1Q3LI58 ATRN-202ENST00000446916 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.31□□□□□ -2.04
KRTAP21-1Q3LI58 COTL1-201ENST00000262428 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.31□□□□□ -2.04
KRTAP21-1Q3LI58 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.31□□□□□ -2.04
KRTAP21-1Q3LI58 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.31□□□□□ -2.04
KRTAP21-1Q3LI58 ATP6V1B1-202ENST00000412314 1805 ntTSL 5 BASIC2.31□□□□□ -2.04
KRTAP21-1Q3LI58 NSUN5P1-206ENST00000457988 1836 ntTSL 2 BASIC2.31□□□□□ -2.04
KRTAP21-1Q3LI58 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC2.31□□□□□ -2.04
KRTAP21-1Q3LI58 BCL2L1-203ENST00000376062 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.31□□□□□ -2.04
KRTAP21-1Q3LI58 DLL4-201ENST00000249749 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.31□□□□□ -2.04
KRTAP21-1Q3LI58 CHMP7-201ENST00000313219 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.31□□□□□ -2.04
KRTAP21-1Q3LI58 SWAP70-201ENST00000318950 4882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.31□□□□□ -2.04
KRTAP21-1Q3LI58 C1S-202ENST00000360817 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.31□□□□□ -2.04
KRTAP21-1Q3LI58 TIGD1-201ENST00000408957 2625 ntAPPRIS P1 BASIC2.31□□□□□ -2.04
KRTAP21-1Q3LI58 B3GNT5-202ENST00000460419 3368 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.31□□□□□ -2.04
KRTAP21-1Q3LI58 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.31□□□□□ -2.04
KRTAP21-1Q3LI58 EPHA8-201ENST00000166244 4943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.31□□□□□ -2.04
KRTAP21-1Q3LI58 PKIA-202ENST00000396418 4163 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.31□□□□□ -2.04
KRTAP21-1Q3LI58 TRIM65-201ENST00000269383 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.31□□□□□ -2.04
KRTAP21-1Q3LI58 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.31□□□□□ -2.04
KRTAP21-1Q3LI58 PIP5K1B-208ENST00000541509 2664 ntTSL 2 BASIC2.31□□□□□ -2.04
KRTAP21-1Q3LI58 ZNF606-204ENST00000547828 2680 ntTSL 2 BASIC2.31□□□□□ -2.04
KRTAP21-1Q3LI58 C3orf62-201ENST00000343010 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.31□□□□□ -2.04
KRTAP21-1Q3LI58 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.31□□□□□ -2.04
KRTAP21-1Q3LI58 MCRS1-201ENST00000343810 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.31□□□□□ -2.04
KRTAP21-1Q3LI58 PSEN2-203ENST00000422240 1947 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC2.31□□□□□ -2.04
KRTAP21-1Q3LI58 GUCY2EP-203ENST00000531117 1918 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
KRTAP21-1Q3LI58 LINC01285-204ENST00000634601 1947 ntTSL 5 BASIC2.31□□□□□ -2.04
KRTAP21-1Q3LI58 ASB2-201ENST00000315988 2743 ntTSL 1 (best) BASIC2.31□□□□□ -2.04
KRTAP21-1Q3LI58 GGPS1-202ENST00000358966 2740 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.31□□□□□ -2.04
KRTAP21-1Q3LI58 AC090136.3-201ENST00000520834 2704 ntTSL 1 (best) BASIC2.31□□□□□ -2.04
KRTAP21-1Q3LI58 SAP30BP-225ENST00000584667 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.31□□□□□ -2.04
KRTAP21-1Q3LI58 SPATS2L-205ENST00000409151 1979 ntTSL 2 BASIC2.31□□□□□ -2.04
KRTAP21-1Q3LI58 SDR16C5-203ENST00000522671 1988 ntTSL 2 BASIC2.31□□□□□ -2.04
KRTAP21-1Q3LI58 ACIN1-222ENST00000557515 2751 ntTSL 5 BASIC2.31□□□□□ -2.04
KRTAP21-1Q3LI58 TUSC5-201ENST00000333813 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.31□□□□□ -2.04
KRTAP21-1Q3LI58 IGF2-204ENST00000381406 5179 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC2.31□□□□□ -2.04
KRTAP21-1Q3LI58 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.31□□□□□ -2.04
KRTAP21-1Q3LI58 LPAR1-203ENST00000374431 3637 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.31□□□□□ -2.04
KRTAP21-1Q3LI58 SUPT20H-212ENST00000475892 2836 ntTSL 1 (best) BASIC2.31□□□□□ -2.04
KRTAP21-1Q3LI58 MTA3-204ENST00000406911 2041 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC2.31□□□□□ -2.04
KRTAP21-1Q3LI58 DIS3L2-205ENST00000409401 2048 ntTSL 1 (best) BASIC2.31□□□□□ -2.04
KRTAP21-1Q3LI58 CDK16-211ENST00000518022 2022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.31□□□□□ -2.04
KRTAP21-1Q3LI58 RNPC3-202ENST00000524631 2013 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC2.31□□□□□ -2.04
KRTAP21-1Q3LI58 CYP4F12-215ENST00000550308 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.31□□□□□ -2.04
KRTAP21-1Q3LI58 AC011498.7-201ENST00000624986 2027 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
KRTAP21-1Q3LI58 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.31□□□□□ -2.04
KRTAP21-1Q3LI58 GORASP1-201ENST00000319283 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.31□□□□□ -2.04
KRTAP21-1Q3LI58 OFD1-203ENST00000380567 3736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.31□□□□□ -2.04
KRTAP21-1Q3LI58 ADAM28-202ENST00000437154 2085 ntTSL 1 (best) BASIC2.31□□□□□ -2.04
KRTAP21-1Q3LI58 ARMCX3-203ENST00000471229 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.31□□□□□ -2.04
KRTAP21-1Q3LI58 CBY1-201ENST00000216029 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.31□□□□□ -2.04
KRTAP21-1Q3LI58 EMC4-201ENST00000249209 852 ntTSL 1 (best) BASIC2.31□□□□□ -2.04
KRTAP21-1Q3LI58 NDUFA2-201ENST00000252102 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.31□□□□□ -2.04
KRTAP21-1Q3LI58 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.31□□□□□ -2.04
KRTAP21-1Q3LI58 C1orf123-201ENST00000294360 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.31□□□□□ -2.04
KRTAP21-1Q3LI58 FMC1-201ENST00000297534 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.31□□□□□ -2.04
KRTAP21-1Q3LI58 UBXN1-202ENST00000301935 1153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.31□□□□□ -2.04
KRTAP21-1Q3LI58 THAP3-202ENST00000307896 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.31□□□□□ -2.04
KRTAP21-1Q3LI58 ANK1-203ENST00000314214 1185 ntTSL 1 (best) BASIC2.31□□□□□ -2.04
KRTAP21-1Q3LI58 SPEM1-201ENST00000323675 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.31□□□□□ -2.04
KRTAP21-1Q3LI58 RESP18-201ENST00000333527 795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.31□□□□□ -2.04
KRTAP21-1Q3LI58 NNAT-202ENST00000346199 1209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.31□□□□□ -2.04
KRTAP21-1Q3LI58 HPSE2-202ENST00000370549 2121 ntTSL 1 (best) BASIC2.31□□□□□ -2.04
KRTAP21-1Q3LI58 SS18L1-202ENST00000370848 1238 ntTSL 1 (best) BASIC2.31□□□□□ -2.04
KRTAP21-1Q3LI58 TMEM59-202ENST00000371337 600 ntTSL 2 BASIC2.31□□□□□ -2.04
KRTAP21-1Q3LI58 GBGT1-202ENST00000372038 847 ntTSL 3 BASIC2.31□□□□□ -2.04
KRTAP21-1Q3LI58 SNX21-203ENST00000372541 771 ntTSL 2 BASIC2.31□□□□□ -2.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.1 ms