Protein–RNA interactions for Protein: Q2V2M9

FHOD3, FH1/FH2 domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,422 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FHOD3Q2V2M9 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
FHOD3Q2V2M9 JAKMIP1-205ENST00000410077 1835 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
FHOD3Q2V2M9 KIAA1755-206ENST00000496900 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
FHOD3Q2V2M9 PCBP1-AS1-214ENST00000419542 1309 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
FHOD3Q2V2M9 DNM2-203ENST00000389253 3581 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
FHOD3Q2V2M9 FNDC5-201ENST00000373471 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
FHOD3Q2V2M9 CDK5RAP3-201ENST00000338399 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
FHOD3Q2V2M9 SNCAIP-207ENST00000504884 1885 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
FHOD3Q2V2M9 ABR-203ENST00000536794 2213 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
FHOD3Q2V2M9 SLC25A19-205ENST00000442286 1496 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
FHOD3Q2V2M9 NPC1L1-203ENST00000423141 2554 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
FHOD3Q2V2M9 ANXA6-215ENST00000523714 2451 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
FHOD3Q2V2M9 TNNT2-202ENST00000360372 969 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
FHOD3Q2V2M9 TNNT2-204ENST00000367317 1050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
FHOD3Q2V2M9 GEMIN7-202ENST00000391951 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
FHOD3Q2V2M9 TNNT2-209ENST00000421663 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
FHOD3Q2V2M9 Z99943.1-201ENST00000451545 718 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
FHOD3Q2V2M9 AC130709.1-201ENST00000484779 1212 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
FHOD3Q2V2M9 HDAC2-AS2-213ENST00000520891 603 ntTSL 4 BASIC23.15■■□□□ 1.3
FHOD3Q2V2M9 POLD4-208ENST00000532830 904 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
FHOD3Q2V2M9 AP000842.2-201ENST00000533033 517 ntTSL 4 BASIC23.15■■□□□ 1.3
FHOD3Q2V2M9 NEU3-207ENST00000534628 746 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
FHOD3Q2V2M9 LDLRAD4-208ENST00000586765 844 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
FHOD3Q2V2M9 CES4A-207ENST00000540947 2284 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
FHOD3Q2V2M9 GLB1L2-201ENST00000339772 3152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
FHOD3Q2V2M9 MSTO1-201ENST00000245564 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
FHOD3Q2V2M9 WIPI2-201ENST00000288828 4476 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
FHOD3Q2V2M9 CTSL-201ENST00000340342 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
FHOD3Q2V2M9 ALPPL2-201ENST00000295453 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
FHOD3Q2V2M9 TMPRSS3-202ENST00000398397 1342 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
FHOD3Q2V2M9 PDYN-AS1-201ENST00000446562 1802 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
FHOD3Q2V2M9 FGFR4-201ENST00000292408 3122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
FHOD3Q2V2M9 SNAPC1-201ENST00000216294 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
FHOD3Q2V2M9 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
FHOD3Q2V2M9 RASSF6-202ENST00000335049 1360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
FHOD3Q2V2M9 ZNF385C-205ENST00000618554 2596 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
FHOD3Q2V2M9 EPS15L1-207ENST00000594975 2489 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
FHOD3Q2V2M9 SGCE-202ENST00000415788 1871 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
FHOD3Q2V2M9 CGB1-201ENST00000301407 573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
FHOD3Q2V2M9 PPIE-202ENST00000356511 1079 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
FHOD3Q2V2M9 ZNF165-201ENST00000377325 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
FHOD3Q2V2M9 HPGD-203ENST00000422112 805 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
FHOD3Q2V2M9 PTK2-225ENST00000520892 571 ntTSL 4 BASIC23.14■■□□□ 1.29
FHOD3Q2V2M9 GMFG-209ENST00000600322 622 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
FHOD3Q2V2M9 AC009560.1-201ENST00000620208 434 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
FHOD3Q2V2M9 YY1AP1-201ENST00000295566 2626 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
FHOD3Q2V2M9 PTPN5-202ENST00000396166 2299 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
FHOD3Q2V2M9 HNRNPF-204ENST00000443950 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
FHOD3Q2V2M9 LINC00905-203ENST00000588838 1414 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
FHOD3Q2V2M9 LTBP4-205ENST00000396819 4764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
FHOD3Q2V2M9 GDI2-203ENST00000380191 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
FHOD3Q2V2M9 AP002353.1-201ENST00000528257 1599 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
FHOD3Q2V2M9 RAMP3-201ENST00000242249 1323 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
FHOD3Q2V2M9 MAEA-207ENST00000505177 1340 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
FHOD3Q2V2M9 DIP2A-205ENST00000466639 2711 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
FHOD3Q2V2M9 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
FHOD3Q2V2M9 C2CD4C-201ENST00000332235 3129 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
FHOD3Q2V2M9 MXD4-201ENST00000337190 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
FHOD3Q2V2M9 IQCF5-AS1-201ENST00000440723 2000 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
FHOD3Q2V2M9 MANEAL-201ENST00000329006 1930 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
FHOD3Q2V2M9 LIMS2-209ENST00000410038 1695 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
FHOD3Q2V2M9 PLAC8L1-201ENST00000311450 638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
FHOD3Q2V2M9 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
FHOD3Q2V2M9 AC114488.1-201ENST00000435872 591 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
FHOD3Q2V2M9 SOX9-AS1-207ENST00000446332 443 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
FHOD3Q2V2M9 MYLK-AS1-202ENST00000470449 760 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
FHOD3Q2V2M9 CRTC3-AS1-202ENST00000559531 657 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
FHOD3Q2V2M9 AC124068.2-202ENST00000562356 612 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
FHOD3Q2V2M9 AC124068.2-201ENST00000569473 1109 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
FHOD3Q2V2M9 MIR6858-201ENST00000620733 67 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
FHOD3Q2V2M9 Z99756.1-201ENST00000458463 1951 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
FHOD3Q2V2M9 AC112484.1-201ENST00000508239 2291 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
FHOD3Q2V2M9 F2-201ENST00000311907 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
FHOD3Q2V2M9 FAM57B-202ENST00000380495 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
FHOD3Q2V2M9 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
FHOD3Q2V2M9 ANAPC5-201ENST00000261819 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
FHOD3Q2V2M9 VASH2-204ENST00000366966 1369 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
FHOD3Q2V2M9 MAP2K6-205ENST00000589647 1512 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
FHOD3Q2V2M9 MTHFD1L-211ENST00000611279 3475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
FHOD3Q2V2M9 AK1-202ENST00000373156 757 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
FHOD3Q2V2M9 AL953897.1-201ENST00000376620 1868 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
FHOD3Q2V2M9 FAM104A-201ENST00000403627 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
FHOD3Q2V2M9 RHBDD2-203ENST00000428119 1274 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
FHOD3Q2V2M9 GAS5-209ENST00000430245 723 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
FHOD3Q2V2M9 AC092580.1-201ENST00000433998 658 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
FHOD3Q2V2M9 TREX1-202ENST00000444177 1200 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
FHOD3Q2V2M9 DCST1-AS1-201ENST00000452962 822 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
FHOD3Q2V2M9 RN7SL81P-201ENST00000493781 261 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
FHOD3Q2V2M9 RHEB-207ENST00000496004 744 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
FHOD3Q2V2M9 OSMR-AS1-202ENST00000512519 837 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
FHOD3Q2V2M9 AC061992.1-201ENST00000592569 777 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
FHOD3Q2V2M9 SLC19A2-202ENST00000367804 2976 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
FHOD3Q2V2M9 FAM222B-202ENST00000452648 2836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
FHOD3Q2V2M9 AC004805.1-201ENST00000577662 1616 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
FHOD3Q2V2M9 OSBP2-209ENST00000438716 2747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
FHOD3Q2V2M9 RELL1-201ENST00000314117 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
FHOD3Q2V2M9 DKC1-201ENST00000369550 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
FHOD3Q2V2M9 SMARCD1-202ENST00000394963 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
FHOD3Q2V2M9 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
FHOD3Q2V2M9 SPRYD7-201ENST00000361840 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 7.8 ms