Protein–RNA interactions for Protein: Q1MSJ5

CSPP1, Centrosome and spindle pole-associated protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,256 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSPP1Q1MSJ5 ISCA1-201ENST00000311534 813 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CSPP1Q1MSJ5 UCK1-203ENST00000372211 2114 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CSPP1Q1MSJ5 IGHV3-23-201ENST00000390609 432 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CSPP1Q1MSJ5 AL133267.1-201ENST00000398220 340 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
CSPP1Q1MSJ5 ATP5J-205ENST00000400094 589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CSPP1Q1MSJ5 ITPR1-AS1-201ENST00000412804 858 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CSPP1Q1MSJ5 IQCF3-201ENST00000437810 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CSPP1Q1MSJ5 SATB1-217ENST00000493952 626 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CSPP1Q1MSJ5 MPI-209ENST00000564003 1195 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CSPP1Q1MSJ5 PSMD7-204ENST00000567958 692 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CSPP1Q1MSJ5 ELOF1-205ENST00000589171 743 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CSPP1Q1MSJ5 TPGS2-215ENST00000590842 1239 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CSPP1Q1MSJ5 RPS19-202ENST00000593863 526 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CSPP1Q1MSJ5 GNRHR2-204ENST00000604273 1078 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CSPP1Q1MSJ5 MALAT1-213ENST00000618227 593 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CSPP1Q1MSJ5 ZBTB45P1-201ENST00000452761 1456 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
CSPP1Q1MSJ5 RNPS1-216ENST00000565678 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CSPP1Q1MSJ5 PTPN5-204ENST00000396170 3871 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CSPP1Q1MSJ5 ABCG1-203ENST00000361802 3034 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CSPP1Q1MSJ5 KLHDC8A-202ENST00000367156 3177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CSPP1Q1MSJ5 LINC01184-204ENST00000501702 2977 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CSPP1Q1MSJ5 CYP1B1-AS1-201ENST00000413828 1781 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CSPP1Q1MSJ5 NUP54-217ENST00000514987 1563 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CSPP1Q1MSJ5 TDG-209ENST00000544861 1387 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CSPP1Q1MSJ5 CREB3L3-204ENST00000602147 1382 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CSPP1Q1MSJ5 SPOCK3-202ENST00000357545 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CSPP1Q1MSJ5 MINDY4-201ENST00000265299 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CSPP1Q1MSJ5 STAT1-203ENST00000392323 2723 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CSPP1Q1MSJ5 CRYBG1-204ENST00000633556 9909 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CSPP1Q1MSJ5 MKRN3-201ENST00000314520 2337 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CSPP1Q1MSJ5 LAP3-211ENST00000618908 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CSPP1Q1MSJ5 EFHC1-212ENST00000635984 3293 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CSPP1Q1MSJ5 ALDH4A1-205ENST00000538309 1940 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CSPP1Q1MSJ5 GIPC2-201ENST00000370759 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CSPP1Q1MSJ5 CLCNKB-204ENST00000619181 1544 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CSPP1Q1MSJ5 UVRAG-201ENST00000356136 4123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CSPP1Q1MSJ5 CYP20A1-203ENST00000429815 1812 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CSPP1Q1MSJ5 C12orf10-201ENST00000267103 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CSPP1Q1MSJ5 NDUFS8-201ENST00000313468 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CSPP1Q1MSJ5 SYCE1-202ENST00000343131 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CSPP1Q1MSJ5 VAMP4-202ENST00000367740 1193 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CSPP1Q1MSJ5 LINC00659-201ENST00000412500 540 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CSPP1Q1MSJ5 HIST3H2BA-201ENST00000436555 524 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
CSPP1Q1MSJ5 RPS2P32-201ENST00000439199 892 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
CSPP1Q1MSJ5 RPSAP31-202ENST00000445165 716 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CSPP1Q1MSJ5 AL359815.1-201ENST00000457706 821 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CSPP1Q1MSJ5 PSEN2-206ENST00000472139 1163 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CSPP1Q1MSJ5 SLED1-202ENST00000512051 380 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
CSPP1Q1MSJ5 REEP4-207ENST00000523293 913 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CSPP1Q1MSJ5 SLC1A4-205ENST00000531327 1217 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CSPP1Q1MSJ5 TMEM63A-209ENST00000537914 1018 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CSPP1Q1MSJ5 TRMT112-206ENST00000544844 1106 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CSPP1Q1MSJ5 HILS1-202ENST00000545329 423 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
CSPP1Q1MSJ5 MAPKAPK5-203ENST00000547305 494 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CSPP1Q1MSJ5 AURKB-214ENST00000585124 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CSPP1Q1MSJ5 BCRP3-202ENST00000621462 1021 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CSPP1Q1MSJ5 RDX-218ENST00000544551 4117 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CSPP1Q1MSJ5 CDT1-201ENST00000301019 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CSPP1Q1MSJ5 SPIN3-204ENST00000638257 4835 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CSPP1Q1MSJ5 PRSS54-204ENST00000567164 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CSPP1Q1MSJ5 P2RY1-201ENST00000305097 6747 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CSPP1Q1MSJ5 TMEM230-202ENST00000342308 1562 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CSPP1Q1MSJ5 HSPA7-201ENST00000445535 1927 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
CSPP1Q1MSJ5 AC007787.1-201ENST00000588095 1583 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
CSPP1Q1MSJ5 ILF2-205ENST00000615950 1906 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CSPP1Q1MSJ5 LGALS8-203ENST00000341872 2437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CSPP1Q1MSJ5 TPM3-208ENST00000341485 2063 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CSPP1Q1MSJ5 AC018442.1-201ENST00000421439 2061 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
CSPP1Q1MSJ5 RFX2-222ENST00000592546 2578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CSPP1Q1MSJ5 CASQ1-201ENST00000368078 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CSPP1Q1MSJ5 HMGA1-204ENST00000401473 1887 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CSPP1Q1MSJ5 APP-205ENST00000358918 2366 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CSPP1Q1MSJ5 ACVR1B-206ENST00000542485 2362 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CSPP1Q1MSJ5 GPAT4-201ENST00000396987 6298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CSPP1Q1MSJ5 TEX28-203ENST00000617225 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CSPP1Q1MSJ5 THEMIS2-203ENST00000373925 1650 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CSPP1Q1MSJ5 POM121-202ENST00000395270 7011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CSPP1Q1MSJ5 ACY3-201ENST00000255082 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CSPP1Q1MSJ5 RAD51C-215ENST00000583539 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CSPP1Q1MSJ5 MBNL1-205ENST00000355460 5941 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CSPP1Q1MSJ5 FAM153B-220ENST00000515817 1966 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CSPP1Q1MSJ5 GRIN2C-201ENST00000293190 4261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CSPP1Q1MSJ5 PROSER3-202ENST00000396908 2149 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CSPP1Q1MSJ5 SV2A-201ENST00000369145 2903 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CSPP1Q1MSJ5 AL034550.2-201ENST00000620523 1771 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CSPP1Q1MSJ5 RASGEF1A-204ENST00000395810 3235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CSPP1Q1MSJ5 ZNF32-AS3-201ENST00000458063 1932 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CSPP1Q1MSJ5 NBL1-201ENST00000289749 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CSPP1Q1MSJ5 DBNDD2-205ENST00000372717 1207 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CSPP1Q1MSJ5 PTPA-220ENST00000436883 532 ntTSL 4 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CSPP1Q1MSJ5 DNAJB6-209ENST00000443280 1159 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CSPP1Q1MSJ5 USP40-206ENST00000443711 628 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CSPP1Q1MSJ5 LINC00473-201ENST00000444465 798 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CSPP1Q1MSJ5 IGFBP2-204ENST00000456764 846 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CSPP1Q1MSJ5 MSC-AS1-206ENST00000519751 596 ntTSL 4 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CSPP1Q1MSJ5 RPL10P19-202ENST00000520582 722 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CSPP1Q1MSJ5 FKBP5-203ENST00000539068 3827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CSPP1Q1MSJ5 CARHSP1-203ENST00000561530 729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CSPP1Q1MSJ5 MYMX-202ENST00000576476 682 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CSPP1Q1MSJ5 CD300LG-205ENST00000586233 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
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