Protein–RNA interactions for Protein: Q15397

PUM3, Pumilio homolog 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 648 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PUM3Q15397 LINC00854-216ENST00000636331 718 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PUM3Q15397 LARP4B-211ENST00000612396 8546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PUM3Q15397 AL391244.1-206ENST00000447725 1843 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PUM3Q15397 MON2-213ENST00000552738 5543 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PUM3Q15397 TMBIM1-201ENST00000258412 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PUM3Q15397 RABL2B-202ENST00000395590 2380 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PUM3Q15397 SH3KBP1-201ENST00000379697 1944 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PUM3Q15397 MBLAC2-202ENST00000514906 1936 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
PUM3Q15397 CLCN7-202ENST00000382745 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PUM3Q15397 TMEM230-201ENST00000202834 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PUM3Q15397 SEC13-208ENST00000397109 1467 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PUM3Q15397 ELF2-204ENST00000394235 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PUM3Q15397 TLL1-204ENST00000507499 4818 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PUM3Q15397 LHX5-201ENST00000261731 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PUM3Q15397 LINC00472-203ENST00000426635 2958 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PUM3Q15397 ZNF302-207ENST00000505365 2955 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PUM3Q15397 ASB10-204ENST00000420175 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PUM3Q15397 TCAF2P1-201ENST00000291129 2421 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
PUM3Q15397 C19orf57-201ENST00000346736 2489 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PUM3Q15397 SRPRA-206ENST00000532259 2453 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PUM3Q15397 ZFP36-203ENST00000597629 1786 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PUM3Q15397 GMPPB-201ENST00000308375 3217 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PUM3Q15397 AC092135.3-201ENST00000624151 1846 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
PUM3Q15397 NRBF2-201ENST00000277746 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PUM3Q15397 GOLGA8R-201ENST00000327271 1896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PUM3Q15397 RUFY2-204ENST00000399200 2685 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PUM3Q15397 KL-201ENST00000380099 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PUM3Q15397 TM9SF1-202ENST00000396854 2055 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PUM3Q15397 VAMP8-203ENST00000432071 664 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PUM3Q15397 AL157407.1-201ENST00000435784 904 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
PUM3Q15397 KLK11-204ENST00000453757 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PUM3Q15397 MACROD2-AS1-202ENST00000455291 663 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PUM3Q15397 SNHG14-209ENST00000456576 544 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PUM3Q15397 AC010973.2-201ENST00000485974 1230 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PUM3Q15397 HLA-J-204ENST00000495278 958 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
PUM3Q15397 AC105362.1-201ENST00000511234 564 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PUM3Q15397 MSRB3-209ENST00000540804 884 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PUM3Q15397 SNORD3B-2-202ENST00000571722 791 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
PUM3Q15397 AC005962.1-201ENST00000584100 773 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
PUM3Q15397 AC008805.1-201ENST00000590892 364 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
PUM3Q15397 SELENOW-204ENST00000595615 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PUM3Q15397 SELENOW-216ENST00000612212 875 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PUM3Q15397 IKZF1-217ENST00000612658 962 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PUM3Q15397 MBD3L2B-202ENST00000637800 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PUM3Q15397 PER1-201ENST00000317276 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PUM3Q15397 KDM6A-202ENST00000382899 5789 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PUM3Q15397 PPP3CA-207ENST00000512215 4007 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PUM3Q15397 AL136172.1-201ENST00000598590 1394 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
PUM3Q15397 AP002360.1-202ENST00000530460 2462 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PUM3Q15397 AC009961.1-203ENST00000607836 2520 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PUM3Q15397 CDH7-203ENST00000536984 3766 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PUM3Q15397 PDE4C-202ENST00000355502 5979 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PUM3Q15397 PDE1C-201ENST00000321453 2898 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PUM3Q15397 ARHGEF1-204ENST00000378152 2986 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PUM3Q15397 CELF3-201ENST00000290583 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PUM3Q15397 CSRP1-201ENST00000340006 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PUM3Q15397 SLC1A7-204ENST00000611397 2499 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PUM3Q15397 MLKL-202ENST00000308807 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PUM3Q15397 CAST-224ENST00000508830 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PUM3Q15397 FGF4-201ENST00000168712 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PUM3Q15397 FKBP9-201ENST00000242209 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PUM3Q15397 PSME1-201ENST00000206451 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PUM3Q15397 AL645933.1-201ENST00000440087 609 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
PUM3Q15397 AL161719.1-201ENST00000442716 385 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PUM3Q15397 ZNF527-203ENST00000483919 1142 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PUM3Q15397 AL928654.3-201ENST00000552675 445 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PUM3Q15397 C14orf132-204ENST00000556728 774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PUM3Q15397 AL132642.1-201ENST00000557646 553 ntTSL 4 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PUM3Q15397 AC110285.1-205ENST00000572301 559 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PUM3Q15397 AC010323.1-201ENST00000598884 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PUM3Q15397 AC100757.4-201ENST00000626934 759 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
PUM3Q15397 CHIA-206ENST00000430615 1320 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PUM3Q15397 RABL6-211ENST00000629216 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PUM3Q15397 CD48-203ENST00000613788 1500 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PUM3Q15397 PLA1A-205ENST00000494440 1775 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PUM3Q15397 INTS11-204ENST00000421495 1868 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PUM3Q15397 NR4A3-204ENST00000618101 5706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PUM3Q15397 PCBP4-201ENST00000322099 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PUM3Q15397 NR4A1-213ENST00000550082 2029 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PUM3Q15397 UPF3B-202ENST00000345865 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PUM3Q15397 REC8-209ENST00000611366 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PUM3Q15397 AKAP1-201ENST00000314126 2380 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PUM3Q15397 CCHCR1-208ENST00000451521 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PUM3Q15397 TRIM13-204ENST00000420995 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PUM3Q15397 MTFMT-201ENST00000220058 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PUM3Q15397 ENAH-203ENST00000366843 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PUM3Q15397 SERTM1-201ENST00000315190 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PUM3Q15397 USP42-201ENST00000306177 5155 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PUM3Q15397 MXD1-201ENST00000264444 5587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PUM3Q15397 TMEM132D-202ENST00000422113 5776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PUM3Q15397 ACSL3-201ENST00000357430 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PUM3Q15397 PIP5K1C-202ENST00000537021 3326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PUM3Q15397 PHTF1-205ENST00000393357 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PUM3Q15397 GSN-215ENST00000545652 2428 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PUM3Q15397 TBC1D22A-205ENST00000406733 2267 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PUM3Q15397 EID1-201ENST00000530028 2298 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PUM3Q15397 ABHD14B-201ENST00000315877 2236 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PUM3Q15397 RASGRF1-202ENST00000419573 6294 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PUM3Q15397 PTPRS-205ENST00000588012 5993 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PUM3Q15397 MGME1-201ENST00000377704 1781 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
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