Protein–RNA interactions for Protein: Q15327

ANKRD1, Ankyrin repeat domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 319 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD1Q15327 CYP4F11-203ENST00000402119 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ANKRD1Q15327 CDC37-201ENST00000222005 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ANKRD1Q15327 ACHE-202ENST00000302913 2956 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ANKRD1Q15327 GJD2-201ENST00000290374 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ANKRD1Q15327 CYP4F11-202ENST00000326742 2877 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ANKRD1Q15327 MSTO1-201ENST00000245564 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ANKRD1Q15327 SLC35E2B-203ENST00000611123 5948 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
ANKRD1Q15327 ECHDC1-220ENST00000528402 1449 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ANKRD1Q15327 CTSB-220ENST00000531089 1436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
ANKRD1Q15327 SLC35A2-204ENST00000376521 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ANKRD1Q15327 FAM47E-STBD1-204ENST00000515604 3029 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
ANKRD1Q15327 ACE-201ENST00000290863 2479 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
ANKRD1Q15327 IDH3G-212ENST00000619865 1339 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.42
ANKRD1Q15327 LINC00094-204ENST00000599836 1689 ntAPPRIS P5 BASIC17.71■□□□□ 0.42
ANKRD1Q15327 COG8-206ENST00000306875 4247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
ANKRD1Q15327 FERMT1-201ENST00000217289 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ANKRD1Q15327 RPTOR-202ENST00000544334 5734 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
ANKRD1Q15327 KCNMA1-262ENST00000639489 4302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
ANKRD1Q15327 DLEU2-201ENST00000235290 1739 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
ANKRD1Q15327 SMARCA2-203ENST00000349721 5761 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
ANKRD1Q15327 SLC25A3-217ENST00000552981 1351 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ANKRD1Q15327 LPAR5-201ENST00000329858 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ANKRD1Q15327 PMS1-221ENST00000624204 3417 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
ANKRD1Q15327 PDE7A-203ENST00000401827 3673 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ANKRD1Q15327 EXT1-201ENST00000378204 8270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ANKRD1Q15327 EEF1B2-201ENST00000236957 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ANKRD1Q15327 TEAD3-201ENST00000338863 2983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ANKRD1Q15327 SDHB-201ENST00000375499 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ANKRD1Q15327 VCX3A-201ENST00000381089 995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ANKRD1Q15327 MAGEA12-203ENST00000393900 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ANKRD1Q15327 PTTG1-202ENST00000393964 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ANKRD1Q15327 SERF2-209ENST00000409646 559 ntTSL 4 BASIC17.7■□□□□ 0.42
ANKRD1Q15327 MTX3-202ENST00000512528 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ANKRD1Q15327 AP006333.1-201ENST00000543817 575 ntTSL 4 BASIC17.7■□□□□ 0.42
ANKRD1Q15327 CDK4-206ENST00000549606 558 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
ANKRD1Q15327 IL32-234ENST00000552936 713 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
ANKRD1Q15327 RAB11B-202ENST00000594216 894 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
ANKRD1Q15327 AC092364.2-202ENST00000597012 1073 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
ANKRD1Q15327 MKS1-202ENST00000393119 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ANKRD1Q15327 BCS1L-203ENST00000392110 1525 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
ANKRD1Q15327 SLC22A12-203ENST00000377572 2887 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ANKRD1Q15327 SALL4P5-201ENST00000419001 1760 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
ANKRD1Q15327 LRRC34-208ENST00000522830 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
ANKRD1Q15327 HSD17B6-205ENST00000554643 1751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
ANKRD1Q15327 NCOR2-203ENST00000404621 8520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ANKRD1Q15327 LINC01285-201ENST00000412422 2289 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
ANKRD1Q15327 CCT3-201ENST00000295688 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ANKRD1Q15327 NRP2-203ENST00000357785 2926 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ANKRD1Q15327 NIPA1-201ENST00000337435 6567 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ANKRD1Q15327 RABL2B-202ENST00000395590 2380 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
ANKRD1Q15327 PITPNM1-216ENST00000534749 4189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ANKRD1Q15327 PPM1B-205ENST00000409432 3025 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ANKRD1Q15327 C9orf139-202ENST00000623196 4990 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
ANKRD1Q15327 TNFAIP8L3-201ENST00000327536 2262 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ANKRD1Q15327 TELO2-201ENST00000262319 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ANKRD1Q15327 NEIL2-201ENST00000284503 2671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
ANKRD1Q15327 MAOB-201ENST00000378069 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ANKRD1Q15327 CA12-202ENST00000344366 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ANKRD1Q15327 ATG4B-206ENST00000405546 3294 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
ANKRD1Q15327 COL11A2-203ENST00000374708 6209 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
ANKRD1Q15327 NDUFA2-201ENST00000252102 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ANKRD1Q15327 SPATC1L-202ENST00000330205 1182 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ANKRD1Q15327 TMEM91-202ENST00000356385 944 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ANKRD1Q15327 FANK1-204ENST00000368695 1296 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ANKRD1Q15327 KRTAP6-3-201ENST00000391624 636 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
ANKRD1Q15327 NDUFC1-201ENST00000394223 598 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
ANKRD1Q15327 ANKRD54-202ENST00000406423 954 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
ANKRD1Q15327 TBC1D8-202ENST00000409318 3803 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
ANKRD1Q15327 CHCHD7-211ENST00000521831 573 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
ANKRD1Q15327 ATP6V0A2-207ENST00000544833 1013 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
ANKRD1Q15327 LINC00928-204ENST00000561201 1123 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ANKRD1Q15327 AC129507.3-201ENST00000571512 913 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
ANKRD1Q15327 HCFC1R1-203ENST00000572355 610 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
ANKRD1Q15327 CLUHP6-201ENST00000580789 941 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
ANKRD1Q15327 AC008805.2-201ENST00000590069 435 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
ANKRD1Q15327 ATF5-205ENST00000600336 682 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
ANKRD1Q15327 AL096865.1-201ENST00000606796 927 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
ANKRD1Q15327 AL031280.1-201ENST00000436991 2224 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
ANKRD1Q15327 TAF8-203ENST00000372982 1805 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
ANKRD1Q15327 SCAP-206ENST00000428413 3749 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
ANKRD1Q15327 SPRY4-202ENST00000434127 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ANKRD1Q15327 AL591623.1-201ENST00000417786 1960 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ANKRD1Q15327 JPH4-205ENST00000622501 3489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
ANKRD1Q15327 CHD4-201ENST00000357008 6496 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ANKRD1Q15327 PSMD13-203ENST00000431206 1591 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
ANKRD1Q15327 BCL10-201ENST00000370580 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ANKRD1Q15327 POU5F1-204ENST00000471529 1723 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ANKRD1Q15327 APAF1-201ENST00000333991 4539 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
ANKRD1Q15327 KRT8P35-201ENST00000483942 1338 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
ANKRD1Q15327 LIN9-201ENST00000328205 3567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ANKRD1Q15327 CCNB1-201ENST00000256442 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ANKRD1Q15327 LINC00163-201ENST00000434081 2155 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ANKRD1Q15327 ZNF79-202ENST00000543471 2194 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
ANKRD1Q15327 ZNF79-203ENST00000612342 2192 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
ANKRD1Q15327 NTMT1-204ENST00000372486 1487 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
ANKRD1Q15327 EID3-201ENST00000527879 1467 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
ANKRD1Q15327 VEZF1-202ENST00000581208 2321 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ANKRD1Q15327 SLC22A15-202ENST00000369503 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ANKRD1Q15327 KIAA1468-202ENST00000398130 6178 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ANKRD1Q15327 ATL3-203ENST00000538786 1920 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.2 ms