Protein–RNA interactions for Protein: Q14683

SMC1A, Structural maintenance of chromosomes protein 1A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,233 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMC1AQ14683 ADCY7-203ENST00000537579 2090 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
SMC1AQ14683 MAP2K7-201ENST00000397979 3361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SMC1AQ14683 PDPK1-201ENST00000268673 4728 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SMC1AQ14683 WDR33-201ENST00000322313 9471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SMC1AQ14683 SIDT1-201ENST00000264852 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
SMC1AQ14683 AMIGO2-201ENST00000266581 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SMC1AQ14683 AMT-204ENST00000427987 1646 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
SMC1AQ14683 ACOXL-201ENST00000340561 2188 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SMC1AQ14683 ZNF663P-201ENST00000400371 2722 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SMC1AQ14683 TTC39A-208ENST00000413473 2718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SMC1AQ14683 AC104452.1-203ENST00000636166 2266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
SMC1AQ14683 CDK5RAP2-202ENST00000360190 5985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SMC1AQ14683 GRB2-203ENST00000392562 3729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
SMC1AQ14683 SLC22A12-203ENST00000377572 2887 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SMC1AQ14683 INTS4P2-202ENST00000614726 2019 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
SMC1AQ14683 GPAT3-201ENST00000264409 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SMC1AQ14683 RCOR2-201ENST00000301459 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SMC1AQ14683 SDR42E2-201ENST00000602312 2630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
SMC1AQ14683 ATP11B-201ENST00000323116 7325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
SMC1AQ14683 AC112229.3-201ENST00000603767 3202 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
SMC1AQ14683 AC013271.1-201ENST00000640669 3202 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
SMC1AQ14683 ERICH5-201ENST00000318528 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SMC1AQ14683 PPP1R15A-201ENST00000200453 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SMC1AQ14683 SUGP2-202ENST00000337018 3640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SMC1AQ14683 AL354714.1-201ENST00000356006 2136 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SMC1AQ14683 CRH-201ENST00000276571 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SMC1AQ14683 PIGG-202ENST00000383028 2787 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SMC1AQ14683 CAPZB-204ENST00000375144 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SMC1AQ14683 METTL17-202ENST00000382985 1586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SMC1AQ14683 MROH4P-201ENST00000431302 1578 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
SMC1AQ14683 PVR-202ENST00000344956 3166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
SMC1AQ14683 KRTAP19-3-201ENST00000334063 522 ntAPPRIS P1 BASIC16.87■□□□□ 0.29
SMC1AQ14683 VAPA-201ENST00000340541 1227 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
SMC1AQ14683 RHCE-205ENST00000349438 1235 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SMC1AQ14683 MBP-203ENST00000359645 1255 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SMC1AQ14683 MS4A13-201ENST00000378185 808 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SMC1AQ14683 EEF1B2-202ENST00000392221 880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
SMC1AQ14683 RBM24-203ENST00000425446 1034 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
SMC1AQ14683 RPL28-203ENST00000428193 573 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
SMC1AQ14683 GNB3-202ENST00000435982 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SMC1AQ14683 CXorf40A-211ENST00000450602 1204 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
SMC1AQ14683 MTX3-202ENST00000512528 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SMC1AQ14683 AC109479.1-201ENST00000519603 624 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
SMC1AQ14683 AC068587.3-201ENST00000526613 355 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
SMC1AQ14683 AC018653.3-202ENST00000538062 735 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
SMC1AQ14683 AL133153.2-201ENST00000557524 303 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
SMC1AQ14683 GSTZ1-219ENST00000557639 873 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
SMC1AQ14683 RPL28-207ENST00000558815 616 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
SMC1AQ14683 SHBG-212ENST00000575314 1146 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SMC1AQ14683 IFT20-214ENST00000585089 1071 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SMC1AQ14683 ZNF180-204ENST00000586637 1023 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
SMC1AQ14683 AL606495.2-201ENST00000605867 535 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
SMC1AQ14683 LINC01663-201ENST00000614596 535 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
SMC1AQ14683 GJD2-201ENST00000290374 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SMC1AQ14683 PDRG1-201ENST00000202017 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SMC1AQ14683 ADAMTS14-201ENST00000373207 5260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SMC1AQ14683 RABEPK-201ENST00000259460 1313 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SMC1AQ14683 ARFIP1-202ENST00000356064 1302 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SMC1AQ14683 ADAMTSL1-207ENST00000380566 2321 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SMC1AQ14683 PPOX-201ENST00000352210 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SMC1AQ14683 TBPL2-201ENST00000247219 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SMC1AQ14683 SCAP-206ENST00000428413 3749 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
SMC1AQ14683 DPYSL4-201ENST00000338492 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SMC1AQ14683 UNC5B-202ENST00000373192 6451 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SMC1AQ14683 LRRK1-201ENST00000388948 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
SMC1AQ14683 HMOX2-205ENST00000458134 1797 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
SMC1AQ14683 CIART-203ENST00000369095 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SMC1AQ14683 TMEM220-202ENST00000455996 1402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SMC1AQ14683 AL669831.1-201ENST00000506640 6432 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
SMC1AQ14683 MEOX2-201ENST00000262041 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SMC1AQ14683 HTR7-203ENST00000371719 3033 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SMC1AQ14683 AC093525.2-201ENST00000564543 1944 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SMC1AQ14683 ABCA7-203ENST00000435683 6211 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SMC1AQ14683 LRRC17-202ENST00000339431 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SMC1AQ14683 ZFPM2-206ENST00000520492 3960 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SMC1AQ14683 PDPK1-202ENST00000342085 7241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SMC1AQ14683 AC079336.5-201ENST00000581360 2480 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SMC1AQ14683 ZEB1-AS1-208ENST00000607166 2503 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
SMC1AQ14683 NINJ2-201ENST00000305108 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SMC1AQ14683 AKIP1-202ENST00000309357 1232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SMC1AQ14683 RHOC-206ENST00000369637 888 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SMC1AQ14683 APOA1-204ENST00000375323 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SMC1AQ14683 ADAMTSL1-208ENST00000380570 931 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SMC1AQ14683 MDP1-202ENST00000396833 582 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SMC1AQ14683 BRWD1P1-201ENST00000401091 371 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
SMC1AQ14683 MORN2-204ENST00000409665 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SMC1AQ14683 TOMM22P5-201ENST00000416399 439 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
SMC1AQ14683 AC099336.1-201ENST00000417053 1171 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
SMC1AQ14683 USB1-202ENST00000423271 1217 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SMC1AQ14683 HIST2H2BA-202ENST00000430394 752 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SMC1AQ14683 AL355864.2-201ENST00000447420 863 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
SMC1AQ14683 AL355994.2-201ENST00000447882 704 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
SMC1AQ14683 TMEM225B-203ENST00000453227 1041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SMC1AQ14683 AC093904.3-201ENST00000492300 368 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SMC1AQ14683 C4orf3-202ENST00000504110 667 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SMC1AQ14683 AC106772.2-201ENST00000515085 442 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SMC1AQ14683 AC100810.1-201ENST00000518822 978 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SMC1AQ14683 AC025674.2-201ENST00000522622 2971 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SMC1AQ14683 TAPBPL-205ENST00000544021 772 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SMC1AQ14683 LINC00928-204ENST00000561201 1123 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
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