Protein–RNA interactions for Protein: Q13838

DDX39B, Spliceosome RNA helicase DDX39B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 428 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX39BQ13838 AC117489.1-201ENST00000625169 3217 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
DDX39BQ13838 SEPT7-202ENST00000399034 4399 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
DDX39BQ13838 SNX18-202ENST00000343017 3140 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
DDX39BQ13838 SLC26A11-202ENST00000411502 2872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
DDX39BQ13838 SLC4A7-212ENST00000446700 4000 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
DDX39BQ13838 STEAP2-201ENST00000287908 6873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
DDX39BQ13838 SLC43A2-201ENST00000301335 8136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
DDX39BQ13838 KIAA1217-203ENST00000376452 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
DDX39BQ13838 DNAJC7-202ENST00000426588 1774 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
DDX39BQ13838 PRDM16-206ENST00000511072 4282 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
DDX39BQ13838 TRAPPC8-210ENST00000582513 3205 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
DDX39BQ13838 CLEC18A-201ENST00000288040 2155 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
DDX39BQ13838 CDC42EP4-202ENST00000439510 2879 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
DDX39BQ13838 CKM-201ENST00000221476 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
DDX39BQ13838 AAAS-217ENST00000550286 1652 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
DDX39BQ13838 PCDHB16-201ENST00000609684 5001 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
DDX39BQ13838 ACTA1-201ENST00000366683 1122 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
DDX39BQ13838 MRPL55-215ENST00000366742 630 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
DDX39BQ13838 XAGE1A-203ENST00000375602 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
DDX39BQ13838 XAGE1B-203ENST00000375616 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
DDX39BQ13838 MAP9-202ENST00000379248 1165 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
DDX39BQ13838 TAGLN-202ENST00000392951 928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
DDX39BQ13838 RHOG-203ENST00000396979 1289 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
DDX39BQ13838 MRPS6-201ENST00000399312 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
DDX39BQ13838 AP1S3-204ENST00000409375 552 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
DDX39BQ13838 AC087499.6-201ENST00000411576 835 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
DDX39BQ13838 AC073133.1-201ENST00000426187 432 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
DDX39BQ13838 AC002472.2-201ENST00000442739 958 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
DDX39BQ13838 GALT-202ENST00000450095 1280 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
DDX39BQ13838 AJ271736.1-201ENST00000483543 773 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
DDX39BQ13838 AC025442.1-201ENST00000521596 481 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
DDX39BQ13838 HBS1L-208ENST00000525067 582 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
DDX39BQ13838 AP001360.1-202ENST00000526934 479 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
DDX39BQ13838 RHOG-204ENST00000533217 886 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
DDX39BQ13838 CDK4-206ENST00000549606 558 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
DDX39BQ13838 C17orf49-209ENST00000552775 779 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
DDX39BQ13838 AC079336.2-201ENST00000578408 927 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
DDX39BQ13838 AL355385.1-201ENST00000606123 409 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
DDX39BQ13838 LINC01515-215ENST00000608678 854 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
DDX39BQ13838 UPK1A-204ENST00000617999 1268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
DDX39BQ13838 AC023908.3-201ENST00000564211 3047 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
DDX39BQ13838 ARHGEF16-201ENST00000378371 2219 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
DDX39BQ13838 CDH20-201ENST00000262717 3882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
DDX39BQ13838 SUGP2-215ENST00000601879 5546 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
DDX39BQ13838 ARHGEF16-203ENST00000378378 3061 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
DDX39BQ13838 CTBP1-AS2-206ENST00000581398 5652 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
DDX39BQ13838 AMIGO2-201ENST00000266581 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
DDX39BQ13838 RAPH1-202ENST00000319170 9808 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
DDX39BQ13838 KIAA0895L-202ENST00000561621 3500 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
DDX39BQ13838 SPPL2B-207ENST00000610743 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
DDX39BQ13838 LAMB2-202ENST00000418109 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
DDX39BQ13838 EHF-210ENST00000531794 1481 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
DDX39BQ13838 HIST1H2AC-203ENST00000602637 1462 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
DDX39BQ13838 SEPT9-208ENST00000541152 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
DDX39BQ13838 PVR-202ENST00000344956 3166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
DDX39BQ13838 OIT3-202ENST00000622652 1602 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
DDX39BQ13838 OR2V1-205ENST00000642036 2609 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
DDX39BQ13838 KLC4-204ENST00000453940 1945 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
DDX39BQ13838 WDR25-204ENST00000554175 2055 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
DDX39BQ13838 AGRN-210ENST00000620552 7394 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
DDX39BQ13838 ERC1-219ENST00000546231 4390 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
DDX39BQ13838 CHRD-206ENST00000450923 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
DDX39BQ13838 RNF150-201ENST00000306799 4535 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
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DDX39BQ13838 RDM1-224ENST00000619262 1535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
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DDX39BQ13838 SNUPN-206ENST00000564675 1682 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
DDX39BQ13838 HM13-201ENST00000335574 1809 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
DDX39BQ13838 ZNF74-209ENST00000611540 3714 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
DDX39BQ13838 GDAP1L1-201ENST00000342560 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
DDX39BQ13838 EID1-201ENST00000530028 2298 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
DDX39BQ13838 GPR161-202ENST00000367835 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
DDX39BQ13838 AC123912.2-201ENST00000594927 2409 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
DDX39BQ13838 FGR-203ENST00000374005 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
DDX39BQ13838 ARMC5-202ENST00000408912 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
DDX39BQ13838 SSTR2-201ENST00000357585 7683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
DDX39BQ13838 DCUN1D2-201ENST00000332592 2626 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
DDX39BQ13838 GOLGA6L11P-201ENST00000417252 1298 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
DDX39BQ13838 SOCS2P1-201ENST00000417727 557 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
DDX39BQ13838 HLA-K-203ENST00000430151 1046 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
DDX39BQ13838 AC016735.2-201ENST00000438736 569 ntTSL 4 BASIC14.62□□□□□ -0.07
DDX39BQ13838 FAM207CP-201ENST00000443486 507 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
DDX39BQ13838 AC097717.1-202ENST00000457577 740 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
DDX39BQ13838 AC106795.3-201ENST00000511650 547 ntTSL 4 BASIC14.62□□□□□ -0.07
DDX39BQ13838 GLI4-203ENST00000517468 963 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
DDX39BQ13838 AP001107.3-201ENST00000534065 544 ntTSL 4 BASIC14.62□□□□□ -0.07
DDX39BQ13838 AC092552.1-201ENST00000547243 906 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
DDX39BQ13838 IGHV3OR16-8-201ENST00000565407 349 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
DDX39BQ13838 TMEM170A-207ENST00000569540 2331 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
DDX39BQ13838 MIR4745-201ENST00000577608 62 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
DDX39BQ13838 AC005262.2-201ENST00000587701 452 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
DDX39BQ13838 AC008494.3-201ENST00000606615 944 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
DDX39BQ13838 FOLR3-204ENST00000611028 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
DDX39BQ13838 ALDH3B1-203ENST00000612297 1231 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
DDX39BQ13838 ADRB2-201ENST00000305988 3443 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
DDX39BQ13838 TUBB4B-201ENST00000340384 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
DDX39BQ13838 SLC22A7-202ENST00000372585 2555 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
DDX39BQ13838 TICRR-202ENST00000560985 6656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
DDX39BQ13838 MAGED2-201ENST00000218439 1958 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
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