Protein–RNA interactions for Protein: Q13536

C1orf61, Protein CROC-4, humanhuman

Predictions only

Length 156 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C1orf61Q13536 MAD1L1-203ENST00000402746 2355 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
C1orf61Q13536 RABL2A-206ENST00000409842 1979 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
C1orf61Q13536 SLC39A8-202ENST00000394833 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
C1orf61Q13536 EFEMP1-202ENST00000394555 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
C1orf61Q13536 SERPING1-204ENST00000378324 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
C1orf61Q13536 FAM109A-203ENST00000547838 2846 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC14.6□□□□□ -0.07
C1orf61Q13536 THEMIS2-202ENST00000373921 2687 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
C1orf61Q13536 CLSTN1-201ENST00000361311 4647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
C1orf61Q13536 KRT71-201ENST00000267119 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
C1orf61Q13536 COPS3-201ENST00000268717 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
C1orf61Q13536 HYAL2-201ENST00000357750 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
C1orf61Q13536 ANXA6-202ENST00000377751 1430 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
C1orf61Q13536 ZFP30-201ENST00000351218 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
C1orf61Q13536 NBEAL2-205ENST00000450053 8827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
C1orf61Q13536 OTUD3-201ENST00000375120 6397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
C1orf61Q13536 UVSSA-206ENST00000507531 2597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
C1orf61Q13536 TSEN2-201ENST00000284995 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
C1orf61Q13536 MPIG6B-204ENST00000375809 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
C1orf61Q13536 SRGAP2B-207ENST00000641863 2367 ntAPPRIS P5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
C1orf61Q13536 STAR-201ENST00000276449 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
C1orf61Q13536 AC003102.2-201ENST00000589195 1469 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
C1orf61Q13536 DACT3-203ENST00000410105 3085 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
C1orf61Q13536 IVL-201ENST00000368764 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
C1orf61Q13536 ABHD18-202ENST00000398965 2177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
C1orf61Q13536 FZR1-201ENST00000313639 1215 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
C1orf61Q13536 RGS10-202ENST00000369103 804 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
C1orf61Q13536 NCR3-204ENST00000376073 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
C1orf61Q13536 AC080129.2-201ENST00000418353 430 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
C1orf61Q13536 AC106786.1-201ENST00000442777 792 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
C1orf61Q13536 Z97180.1-201ENST00000445173 988 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
C1orf61Q13536 TCEAL4-208ENST00000472484 1273 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
C1orf61Q13536 AC005586.1-201ENST00000488310 577 ntTSL 4 BASIC14.59□□□□□ -0.07
C1orf61Q13536 RNA5SP423-201ENST00000517127 109 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
C1orf61Q13536 TNNT1-203ENST00000536926 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
C1orf61Q13536 AL445483.1-201ENST00000568695 736 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
C1orf61Q13536 NRN1L-202ENST00000576147 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
C1orf61Q13536 RANGRF-205ENST00000580434 749 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
C1orf61Q13536 CLEC11A-202ENST00000599973 1026 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
C1orf61Q13536 AC138627.1-207ENST00000641560 1006 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
C1orf61Q13536 FURIN-207ENST00000618099 4345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
C1orf61Q13536 ETV5-206ENST00000434744 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
C1orf61Q13536 RAI2-204ENST00000451717 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
C1orf61Q13536 SPAG1-202ENST00000388798 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
C1orf61Q13536 CDK11B-209ENST00000629312 2496 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
C1orf61Q13536 SALL4P5-201ENST00000419001 1760 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
C1orf61Q13536 PPL-205ENST00000590782 5845 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
C1orf61Q13536 CHIA-206ENST00000430615 1320 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
C1orf61Q13536 ABTB1-206ENST00000468137 2065 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
C1orf61Q13536 LAD1-201ENST00000367313 2336 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
C1orf61Q13536 DUS2-207ENST00000565263 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
C1orf61Q13536 KLF5-201ENST00000377687 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
C1orf61Q13536 PEF1-201ENST00000373703 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
C1orf61Q13536 PITPNB-202ENST00000335272 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
C1orf61Q13536 TMEM51-204ENST00000428417 1942 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.07
C1orf61Q13536 GPC1-201ENST00000264039 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
C1orf61Q13536 TMEM258-207ENST00000543510 1692 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.07
C1orf61Q13536 SELENOS-201ENST00000398226 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
C1orf61Q13536 DLX4-202ENST00000411890 1404 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
C1orf61Q13536 PTOV1-214ENST00000600603 1443 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
C1orf61Q13536 SDK1-210ENST00000615806 10258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
C1orf61Q13536 PPM1B-204ENST00000378551 3877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
C1orf61Q13536 AQP10-203ENST00000484864 2262 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
C1orf61Q13536 SIKE1-203ENST00000369528 5506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
C1orf61Q13536 ZNF620-202ENST00000418905 2022 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
C1orf61Q13536 CCDC6-201ENST00000263102 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
C1orf61Q13536 SCUBE2-207ENST00000520467 3148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
C1orf61Q13536 MAGEA12-202ENST00000393869 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
C1orf61Q13536 EGFR-203ENST00000344576 2864 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
C1orf61Q13536 STX1A-201ENST00000222812 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
C1orf61Q13536 KAT5-202ENST00000352980 2059 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
C1orf61Q13536 STX1A-204ENST00000395156 2050 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
C1orf61Q13536 SGCE-205ENST00000437425 1508 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
C1orf61Q13536 CTCFL-210ENST00000481655 1512 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
C1orf61Q13536 FSD1L-206ENST00000481272 1804 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
C1orf61Q13536 PSME1-201ENST00000206451 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
C1orf61Q13536 NPPA-201ENST00000376476 728 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
C1orf61Q13536 LINC01352-201ENST00000431347 962 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
C1orf61Q13536 UPF3AP2-201ENST00000457924 1132 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
C1orf61Q13536 OARD1-204ENST00000464633 717 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
C1orf61Q13536 RPL18P13-201ENST00000478088 569 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
C1orf61Q13536 AC093904.2-201ENST00000495580 418 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
C1orf61Q13536 HNRNPA1P36-201ENST00000521313 955 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
C1orf61Q13536 AP003065.1-201ENST00000540912 562 ntTSL 4 BASIC14.58□□□□□ -0.08
C1orf61Q13536 SPAG5-AS1-203ENST00000554154 491 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
C1orf61Q13536 PIGH-209ENST00000559581 1049 ntTSL 4 BASIC14.58□□□□□ -0.08
C1orf61Q13536 AC013355.1-201ENST00000562625 723 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
C1orf61Q13536 AL645939.5-201ENST00000606834 243 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
C1orf61Q13536 AC097724.1-201ENST00000609581 426 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
C1orf61Q13536 AP001505.2-201ENST00000616815 443 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
C1orf61Q13536 LINC01668-201ENST00000635001 513 ntTSL 4 BASIC14.58□□□□□ -0.08
C1orf61Q13536 AK4-202ENST00000395334 6998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
C1orf61Q13536 OLIG2-201ENST00000333337 3262 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.08
C1orf61Q13536 PARD6G-201ENST00000353265 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
C1orf61Q13536 RMND1-202ENST00000367303 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
C1orf61Q13536 AC027601.1-201ENST00000575922 4506 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
C1orf61Q13536 DTX2-201ENST00000324432 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
C1orf61Q13536 TIMP2-201ENST00000262768 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
C1orf61Q13536 OSTF1-201ENST00000346234 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
C1orf61Q13536 PCDHA3-202ENST00000532566 4594 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
C1orf61Q13536 IL1RN-203ENST00000361779 1922 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 92.9 ms