Protein–RNA interactions for Protein: Q13371

PDCL, Phosducin-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 301 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDCLQ13371 AC011497.1-201ENST00000596781 561 ntTSL 4 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PDCLQ13371 WFDC1-204ENST00000613603 549 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
PDCLQ13371 KLK15-201ENST00000326856 1389 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PDCLQ13371 ATXN7L1-207ENST00000477775 2426 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PDCLQ13371 GPSM3-207ENST00000375043 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PDCLQ13371 KLK6-203ENST00000391808 1478 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PDCLQ13371 RPRD1A-202ENST00000399022 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PDCLQ13371 PSMC3-213ENST00000619920 1580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PDCLQ13371 INTS4P1-203ENST00000641008 3683 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
PDCLQ13371 ADAM15-206ENST00000368412 2804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PDCLQ13371 PCDHGB8P-201ENST00000502926 1973 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
PDCLQ13371 PUS7-202ENST00000469408 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PDCLQ13371 CAMKK2-209ENST00000446440 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PDCLQ13371 DDIAS-203ENST00000525361 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PDCLQ13371 IL1RN-203ENST00000361779 1922 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PDCLQ13371 MED4-201ENST00000258648 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PDCLQ13371 REC8-209ENST00000611366 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PDCLQ13371 TOM1L2-202ENST00000379504 2418 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PDCLQ13371 BLK-201ENST00000259089 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PDCLQ13371 KLF11-205ENST00000535335 4033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PDCLQ13371 CUX1-215ENST00000556210 4044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PDCLQ13371 FARP1-214ENST00000595437 4926 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PDCLQ13371 MARK4-202ENST00000300843 5209 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PDCLQ13371 CCNY-201ENST00000265375 4768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PDCLQ13371 TRIM46-210ENST00000545012 2979 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PDCLQ13371 GABARAPL1-218ENST00000546017 2294 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PDCLQ13371 DUOXA1-216ENST00000613425 1867 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PDCLQ13371 CTSD-211ENST00000637387 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PDCLQ13371 GOLGA6L2-201ENST00000312015 1379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PDCLQ13371 NDUFA3-203ENST00000391763 338 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PDCLQ13371 TEN1-201ENST00000397640 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PDCLQ13371 STMN1-204ENST00000426559 948 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PDCLQ13371 LNCPRESS1-201ENST00000429254 756 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PDCLQ13371 FYCO1-203ENST00000438446 1072 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PDCLQ13371 CXorf40A-211ENST00000450602 1204 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PDCLQ13371 AC078785.1-203ENST00000467342 573 ntTSL 4 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PDCLQ13371 AC010327.1-201ENST00000587871 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PDCLQ13371 AC133539.2-201ENST00000604757 467 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
PDCLQ13371 CLCN7-201ENST00000262318 3717 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PDCLQ13371 NARFL-202ENST00000540986 3212 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PDCLQ13371 HTR3A-202ENST00000355556 2331 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PDCLQ13371 ZNF398-205ENST00000491174 2232 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PDCLQ13371 ALAS2-201ENST00000330807 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PDCLQ13371 AL158070.2-201ENST00000623713 1621 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
PDCLQ13371 RDM1-224ENST00000619262 1535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PDCLQ13371 SGK2-201ENST00000341458 2498 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PDCLQ13371 ADRB2-201ENST00000305988 3443 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PDCLQ13371 ANKRD13B-201ENST00000394859 3214 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PDCLQ13371 RNPS1-216ENST00000565678 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PDCLQ13371 CYB5R2-204ENST00000524790 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PDCLQ13371 RIC1-201ENST00000251879 4127 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PDCLQ13371 SYT13-201ENST00000020926 5144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PDCLQ13371 GEMIN7-201ENST00000270257 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PDCLQ13371 TRIM50-202ENST00000453152 1599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PDCLQ13371 AC020915.1-201ENST00000413518 1469 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PDCLQ13371 ZFYVE28-211ENST00000515312 3247 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PDCLQ13371 SEC13-201ENST00000337354 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PDCLQ13371 ZNF890P-201ENST00000422060 1352 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PDCLQ13371 BX640514.1-201ENST00000583223 1918 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
PDCLQ13371 AGPS-201ENST00000264167 7764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PDCLQ13371 SCAMP4-202ENST00000409472 2394 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PDCLQ13371 ZNF286A-218ENST00000583566 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PDCLQ13371 CGB5-201ENST00000301408 841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PDCLQ13371 BANF1-201ENST00000312175 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PDCLQ13371 CALY-203ENST00000368558 825 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PDCLQ13371 FANK1-204ENST00000368695 1296 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PDCLQ13371 RHOG-203ENST00000396979 1289 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PDCLQ13371 DHDDS-206ENST00000427245 868 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PDCLQ13371 AC140481.1-201ENST00000448777 706 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PDCLQ13371 LHX6-205ENST00000464484 666 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PDCLQ13371 KRBOX4-207ENST00000487081 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PDCLQ13371 TMEM176B-206ENST00000492607 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PDCLQ13371 TIMM8B-201ENST00000504148 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PDCLQ13371 AC136475.2-201ENST00000526612 392 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PDCLQ13371 RHOG-204ENST00000533217 886 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PDCLQ13371 PAM16-204ENST00000571941 674 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PDCLQ13371 MRPS23-202ENST00000578444 580 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PDCLQ13371 AC005262.2-201ENST00000587701 452 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PDCLQ13371 HDDC2-203ENST00000608284 538 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PDCLQ13371 IL32-235ENST00000613483 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PDCLQ13371 CDCA2-201ENST00000330560 3731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PDCLQ13371 ARAP2-201ENST00000303965 7514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PDCLQ13371 MBD1-211ENST00000585595 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PDCLQ13371 MAGEA8-205ENST00000542674 2084 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PDCLQ13371 KCP-203ENST00000610776 5108 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PDCLQ13371 PDRG1-201ENST00000202017 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PDCLQ13371 SLC19A2-201ENST00000236137 3671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PDCLQ13371 TOX3-201ENST00000219746 3233 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PDCLQ13371 AFAP1L1-205ENST00000515000 2319 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PDCLQ13371 GRN-201ENST00000053867 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PDCLQ13371 RCN2-203ENST00000394885 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PDCLQ13371 ELAC1-201ENST00000269466 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PDCLQ13371 HTR3A-206ENST00000506841 2221 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PDCLQ13371 VPS36-207ENST00000611132 4607 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PDCLQ13371 RSPH6A-203ENST00000600188 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PDCLQ13371 WDR27-201ENST00000423258 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PDCLQ13371 AL360270.3-201ENST00000609118 1348 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
PDCLQ13371 PNPLA5-202ENST00000381198 2000 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PDCLQ13371 PPRC1-203ENST00000413464 4580 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PDCLQ13371 KHK-201ENST00000260598 2397 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.2 ms