Protein–RNA interactions for Protein: Q13326

SGCG, Gamma-sarcoglycan, humanhuman

Predictions only

Length 291 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCGQ13326 XPO6-201ENST00000304658 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SGCGQ13326 TPD52L2-204ENST00000351424 2302 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
SGCGQ13326 TLE4-204ENST00000376537 2793 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SGCGQ13326 FAM104A-201ENST00000403627 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SGCGQ13326 CAMK2D-211ENST00000511664 2210 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
SGCGQ13326 PLLP-205ENST00000613167 7578 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
SGCGQ13326 UBR5-212ENST00000521922 9008 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
SGCGQ13326 ZNF382-202ENST00000423582 2657 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SGCGQ13326 ALPL-207ENST00000540617 2131 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
SGCGQ13326 C11orf16-201ENST00000326053 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SGCGQ13326 EXOC7-213ENST00000467929 2260 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
SGCGQ13326 BCL11B-201ENST00000345514 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SGCGQ13326 CPT2-201ENST00000371486 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SGCGQ13326 FOXRED1-213ENST00000532125 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
SGCGQ13326 SNX19-201ENST00000265909 6535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SGCGQ13326 IVL-201ENST00000368764 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
SGCGQ13326 FBXO44-204ENST00000376762 1734 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SGCGQ13326 ABCA7-201ENST00000263094 6816 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
SGCGQ13326 SST-201ENST00000287641 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SGCGQ13326 WDR54-201ENST00000348227 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SGCGQ13326 WDR3-202ENST00000369441 1035 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SGCGQ13326 HNRNPA1P32-201ENST00000396326 963 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
SGCGQ13326 AC053503.1-201ENST00000429882 519 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
SGCGQ13326 TMEM107-203ENST00000431792 455 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
SGCGQ13326 MRPS25-203ENST00000444840 1281 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
SGCGQ13326 AC104596.1-201ENST00000507826 579 ntTSL 4 BASIC14.9□□□□□ -0.02
SGCGQ13326 AC026495.1-203ENST00000557528 906 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
SGCGQ13326 TSR1-204ENST00000576112 1290 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
SGCGQ13326 PAX4-207ENST00000611453 1235 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
SGCGQ13326 LINC00595-217ENST00000635545 549 ntTSL 4 BASIC14.9□□□□□ -0.02
SGCGQ13326 AC020910.5-201ENST00000623668 1865 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
SGCGQ13326 INE2-201ENST00000630399 1874 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
SGCGQ13326 KRT17-201ENST00000311208 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SGCGQ13326 AC011840.2-201ENST00000563063 1520 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
SGCGQ13326 ADCY6-201ENST00000307885 6464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SGCGQ13326 IL17RA-204ENST00000612619 8506 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
SGCGQ13326 TBC1D1-219ENST00000615497 2383 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
SGCGQ13326 RASA4-204ENST00000462172 2634 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SGCGQ13326 SEC16A-202ENST00000290037 8982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SGCGQ13326 AFF4-201ENST00000265343 9552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SGCGQ13326 FOXE1-201ENST00000375123 3462 ntAPPRIS P1 BASIC14.9□□□□□ -0.02
SGCGQ13326 SPTLC2-201ENST00000216484 8170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SGCGQ13326 LYPLA1-214ENST00000618741 2526 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
SGCGQ13326 BMP1-203ENST00000354870 3989 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
SGCGQ13326 IGHA2-202ENST00000497872 1320 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SGCGQ13326 LINC00327-203ENST00000576696 1308 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SGCGQ13326 NWD2-201ENST00000309447 8325 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
SGCGQ13326 RPL3L-201ENST00000268661 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SGCGQ13326 SFTPA2-201ENST00000372325 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SGCGQ13326 PSMD13-215ENST00000621534 1572 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
SGCGQ13326 CUX1-214ENST00000550008 4350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
SGCGQ13326 THEMIS2-202ENST00000373921 2687 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
SGCGQ13326 KAT5-202ENST00000352980 2059 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SGCGQ13326 AGRN-201ENST00000379370 7323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SGCGQ13326 STAMBPL1-204ENST00000371927 4184 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
SGCGQ13326 SCARB1-202ENST00000339570 3329 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
SGCGQ13326 DDX19A-202ENST00000417604 1703 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
SGCGQ13326 TSC22D3-201ENST00000315660 2213 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SGCGQ13326 PRKAG3-206ENST00000529249 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SGCGQ13326 MAPK14-201ENST00000229794 3779 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SGCGQ13326 ASIC1-202ENST00000447966 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SGCGQ13326 ATP6V0A1-204ENST00000537728 2774 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
SGCGQ13326 ZNF620-202ENST00000418905 2022 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
SGCGQ13326 TMEM40-204ENST00000435218 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SGCGQ13326 CTCFL-210ENST00000481655 1512 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SGCGQ13326 RHOC-206ENST00000369637 888 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
SGCGQ13326 NQO2-202ENST00000380430 1098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
SGCGQ13326 SERF2-209ENST00000409646 559 ntTSL 4 BASIC14.89□□□□□ -0.03
SGCGQ13326 BCYRN1-201ENST00000418539 200 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
SGCGQ13326 TLE1P1-201ENST00000422965 589 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
SGCGQ13326 AL354877.1-201ENST00000424412 413 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
SGCGQ13326 SEPT7P2-209ENST00000450436 601 ntTSL 4 BASIC14.89□□□□□ -0.03
SGCGQ13326 APOPT1-207ENST00000477116 906 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
SGCGQ13326 FAM153B-214ENST00000512862 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
SGCGQ13326 C12orf49-204ENST00000548356 923 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
SGCGQ13326 AC025154.1-201ENST00000552806 560 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
SGCGQ13326 AC020914.3-201ENST00000594712 304 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
SGCGQ13326 NKG7-204ENST00000595217 816 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
SGCGQ13326 AL121944.1-201ENST00000605945 686 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
SGCGQ13326 NSFL1C-201ENST00000216879 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SGCGQ13326 CHAF1A-201ENST00000301280 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SGCGQ13326 CCAR2-202ENST00000389279 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SGCGQ13326 ZNF32-AS3-201ENST00000458063 1932 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SGCGQ13326 APLN-201ENST00000429967 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SGCGQ13326 HDHD3-201ENST00000238379 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SGCGQ13326 CAMSAP3-202ENST00000446248 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SGCGQ13326 CNDP1-201ENST00000358821 2215 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SGCGQ13326 CYP1A1-203ENST00000395049 1594 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SGCGQ13326 NUTM2D-202ENST00000412718 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
SGCGQ13326 TBXAS1-208ENST00000448866 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SGCGQ13326 ALDOA-201ENST00000338110 2384 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SGCGQ13326 SUSD5-201ENST00000309558 5008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SGCGQ13326 WDR45-224ENST00000485908 1301 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
SGCGQ13326 GNG2-213ENST00000556766 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SGCGQ13326 PIP5K1C-202ENST00000537021 3326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SGCGQ13326 TMED5-202ENST00000370282 6104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SGCGQ13326 SMAD2-202ENST00000356825 10445 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SGCGQ13326 DKC1-213ENST00000620277 3079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SGCGQ13326 FEZF1-AS1-202ENST00000428449 2653 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
SGCGQ13326 CCDC121-202ENST00000394775 1472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47 ms