Protein–RNA interactions for Protein: Q13156

RPA4, Replication protein A 30 kDa subunit, humanhuman

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Length 261 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPA4Q13156 STX1A-203ENST00000395155 783 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
RPA4Q13156 IFT20-203ENST00000395418 825 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
RPA4Q13156 ITPA-202ENST00000399838 897 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
RPA4Q13156 BUD31-202ENST00000403633 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
RPA4Q13156 MB-205ENST00000406324 582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
RPA4Q13156 MDM2-215ENST00000428863 1037 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
RPA4Q13156 KCNQ1-AS1-201ENST00000440887 1084 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
RPA4Q13156 AC103563.7-201ENST00000448734 478 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
RPA4Q13156 PUDP-206ENST00000540122 825 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
RPA4Q13156 NOP2-220ENST00000545915 630 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
RPA4Q13156 SNX29P1-201ENST00000548357 1007 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
RPA4Q13156 MAP1LC3B2-202ENST00000556529 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
RPA4Q13156 AC106820.3-201ENST00000561653 397 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
RPA4Q13156 LINC01887-202ENST00000584734 860 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
RPA4Q13156 SLC35G4-201ENST00000588001 1017 ntAPPRIS P1 BASIC14.68□□□□□ -0.06
RPA4Q13156 IFT20-216ENST00000588477 774 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
RPA4Q13156 AC010735.2-201ENST00000607970 584 ntTSL 4 BASIC14.68□□□□□ -0.06
RPA4Q13156 ARAP2-201ENST00000303965 7514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
RPA4Q13156 PI16-203ENST00000611814 2083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
RPA4Q13156 AC005885.1-204ENST00000637885 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
RPA4Q13156 GHDC-203ENST00000428494 2518 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
RPA4Q13156 ELFN2-201ENST00000402918 8361 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.68□□□□□ -0.06
RPA4Q13156 HOXC12-201ENST00000243103 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
RPA4Q13156 ELOA-204ENST00000613537 4924 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
RPA4Q13156 ZNF19-208ENST00000565637 2612 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
RPA4Q13156 SRPX-206ENST00000544439 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
RPA4Q13156 UBAP1-201ENST00000297661 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
RPA4Q13156 AC003102.2-201ENST00000589195 1469 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
RPA4Q13156 PDP1-201ENST00000297598 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
RPA4Q13156 SPPL2B-207ENST00000610743 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
RPA4Q13156 DEGS1-201ENST00000323699 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
RPA4Q13156 LINC02212-201ENST00000515243 2130 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
RPA4Q13156 PCDHA3-202ENST00000532566 4594 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
RPA4Q13156 GRID2IP-201ENST00000435185 3215 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
RPA4Q13156 AC023632.2-201ENST00000523011 1789 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
RPA4Q13156 REC8-209ENST00000611366 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
RPA4Q13156 GOLGA5-201ENST00000163416 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
RPA4Q13156 RPS6KL1-201ENST00000354625 5195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
RPA4Q13156 HSPA12B-201ENST00000254963 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
RPA4Q13156 IGSF1-204ENST00000370903 4594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
RPA4Q13156 RAB5B-202ENST00000448789 1530 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
RPA4Q13156 UBE3B-212ENST00000540230 1541 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
RPA4Q13156 VSIG10L-201ENST00000335624 3397 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
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RPA4Q13156 PLTP-201ENST00000354050 1731 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
RPA4Q13156 ZCCHC17-202ENST00000373714 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
RPA4Q13156 KIAA1841-201ENST00000295031 3116 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
RPA4Q13156 SMYD1-203ENST00000444564 1816 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
RPA4Q13156 RPA3-201ENST00000223129 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
RPA4Q13156 NCR3-201ENST00000340027 1042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
RPA4Q13156 TPM2-202ENST00000360958 1189 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
RPA4Q13156 SNX21-203ENST00000372541 771 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
RPA4Q13156 C9orf116-205ENST00000429260 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
RPA4Q13156 AL354761.2-202ENST00000430816 546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
RPA4Q13156 AC128709.2-201ENST00000438408 558 ntTSL 4 BASIC14.67□□□□□ -0.06
RPA4Q13156 LRRC74B-201ENST00000442047 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
RPA4Q13156 KRT223P-202ENST00000449164 1292 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
RPA4Q13156 FAM153B-214ENST00000512862 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
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RPA4Q13156 GCHFR-204ENST00000559445 626 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
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RPA4Q13156 SPN-201ENST00000360121 6894 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
RPA4Q13156 C4A-259ENST00000498271 5269 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
RPA4Q13156 EGOT-201ENST00000414938 1464 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
RPA4Q13156 LEF1-202ENST00000379951 3477 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
RPA4Q13156 UBE2G2-202ENST00000345496 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
RPA4Q13156 PLAGL1-208ENST00000437412 2640 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
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RPA4Q13156 ISCA2-204ENST00000556816 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
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RPA4Q13156 SDK1-210ENST00000615806 10258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
RPA4Q13156 SALL4P5-201ENST00000419001 1760 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
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RPA4Q13156 LINC01101-201ENST00000622953 1884 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
RPA4Q13156 PAF1-201ENST00000221265 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
RPA4Q13156 CHDH-201ENST00000315251 7665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
RPA4Q13156 AC013726.1-201ENST00000563747 2285 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
RPA4Q13156 CTCFL-210ENST00000481655 1512 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
RPA4Q13156 C18orf25-203ENST00000615052 5462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
RPA4Q13156 AGPAT1-201ENST00000336984 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
RPA4Q13156 NEK5-204ENST00000617045 2127 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
RPA4Q13156 CNKSR1-201ENST00000361530 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
RPA4Q13156 PATZ1-204ENST00000405309 3711 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
RPA4Q13156 CLCN2-202ENST00000344937 3187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
RPA4Q13156 SIDT1-202ENST00000393830 2572 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
RPA4Q13156 DPP6-205ENST00000427557 2388 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
RPA4Q13156 DUOXA1-210ENST00000559014 1965 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
RPA4Q13156 FIS1-201ENST00000223136 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
RPA4Q13156 PLAC9-201ENST00000372263 785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
RPA4Q13156 MIR658-201ENST00000385210 100 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
RPA4Q13156 GPR17-202ENST00000393018 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
RPA4Q13156 DBI-203ENST00000393103 599 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
RPA4Q13156 PEMT-203ENST00000395782 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
RPA4Q13156 MIR1202-201ENST00000408529 83 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
RPA4Q13156 U82695.1-202ENST00000428676 700 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
RPA4Q13156 TMEM14B-210ENST00000473276 730 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
RPA4Q13156 AC119751.2-201ENST00000504529 210 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
RPA4Q13156 LLPH-AS1-201ENST00000510317 623 ntTSL 4 BASIC14.66□□□□□ -0.06
RPA4Q13156 ATG10-207ENST00000513443 978 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
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