Protein–RNA interactions for Protein: Q12983

BNIP3, BCL2/adenovirus E1B 19 kDa protein-interacting protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 259 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BNIP3Q12983 SLC13A5-203ENST00000433363 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
BNIP3Q12983 SLITRK2-202ENST00000370490 7672 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
BNIP3Q12983 BRAT1-201ENST00000340611 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
BNIP3Q12983 C5orf24-204ENST00000504727 2923 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
BNIP3Q12983 TGFB1I1-203ENST00000394863 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
BNIP3Q12983 SIGLEC11-202ENST00000426971 2479 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
BNIP3Q12983 ROPN1-203ENST00000459660 1909 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
BNIP3Q12983 CELF4-223ENST00000603232 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
BNIP3Q12983 RNF222-202ENST00000399398 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
BNIP3Q12983 NR6A1-205ENST00000487099 7031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
BNIP3Q12983 ATP6AP2-211ENST00000636196 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
BNIP3Q12983 SATB2-205ENST00000443023 6194 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
BNIP3Q12983 HNF4A-202ENST00000316673 1470 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
BNIP3Q12983 CNTNAP3P2-201ENST00000617175 3861 ntBASIC15.07■□□□□ 0
BNIP3Q12983 NELFA-202ENST00000382882 3343 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
BNIP3Q12983 AVL9-201ENST00000318709 6982 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
BNIP3Q12983 RBFOX1-205ENST00000436368 1530 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
BNIP3Q12983 FBXO8-202ENST00000503293 1546 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
BNIP3Q12983 GOLGA7B-201ENST00000370602 6447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
BNIP3Q12983 PRRT2-214ENST00000637064 2153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
BNIP3Q12983 ARC-201ENST00000356613 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
BNIP3Q12983 SNX14-215ENST00000513865 2259 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
BNIP3Q12983 DEPDC5-203ENST00000400242 2395 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
BNIP3Q12983 FRA10AC1-201ENST00000359204 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
BNIP3Q12983 GOPC-203ENST00000535237 4460 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
BNIP3Q12983 ZSCAN32-205ENST00000439568 1746 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
BNIP3Q12983 MGMT-201ENST00000306010 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
BNIP3Q12983 MAGEA12-202ENST00000393869 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
BNIP3Q12983 PIK3CD-206ENST00000536656 5483 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
BNIP3Q12983 PIK3CD-208ENST00000628140 5483 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
BNIP3Q12983 WBP4-201ENST00000379487 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
BNIP3Q12983 GLMP-214ENST00000614643 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
BNIP3Q12983 RIPK1-201ENST00000259808 4160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
BNIP3Q12983 PDLIM5-202ENST00000318007 1960 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
BNIP3Q12983 KATNA1-203ENST00000367411 1984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
BNIP3Q12983 SEPT7-201ENST00000350320 4350 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
BNIP3Q12983 PDE3A-201ENST00000359062 7576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
BNIP3Q12983 CAPN5-202ENST00000456580 2805 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
BNIP3Q12983 AHNAK-201ENST00000257247 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
BNIP3Q12983 POLD4-201ENST00000312419 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
BNIP3Q12983 CSH1-201ENST00000316193 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
BNIP3Q12983 CATSPERZ-201ENST00000328404 743 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
BNIP3Q12983 TPM3P8-201ENST00000330554 643 ntBASIC15.06■□□□□ 0
BNIP3Q12983 HIST1H2AJ-201ENST00000333151 387 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
BNIP3Q12983 HIST3H3-201ENST00000366696 481 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
BNIP3Q12983 LINC01694-201ENST00000424569 821 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
BNIP3Q12983 DHDDS-206ENST00000427245 868 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
BNIP3Q12983 AC053503.1-201ENST00000429882 519 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
BNIP3Q12983 SPATA3-204ENST00000433428 856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
BNIP3Q12983 MTX1P1-201ENST00000440904 838 ntBASIC15.06■□□□□ 0
BNIP3Q12983 SIRPB2-203ENST00000444444 884 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
BNIP3Q12983 BX322559.1-201ENST00000456613 319 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
BNIP3Q12983 LINC02447-202ENST00000501888 2146 ntBASIC15.06■□□□□ 0
BNIP3Q12983 TRIM67-201ENST00000366653 3936 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
BNIP3Q12983 ATP6V1H-201ENST00000355221 2365 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
BNIP3Q12983 HMGA2-210ENST00000541363 8094 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
BNIP3Q12983 DARS-AS1-209ENST00000594219 1420 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
BNIP3Q12983 CORO6-201ENST00000345068 2603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
BNIP3Q12983 CCDC51-204ENST00000442740 1554 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
BNIP3Q12983 HLA-DQB1-205ENST00000434651 1642 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
BNIP3Q12983 AMT-224ENST00000635808 1610 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
BNIP3Q12983 FANCA-213ENST00000563673 1694 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
BNIP3Q12983 FSIP1-201ENST00000350221 2805 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
BNIP3Q12983 SMPDL3A-201ENST00000368440 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
BNIP3Q12983 BRF1-203ENST00000379937 3314 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
BNIP3Q12983 ZNF7-218ENST00000544249 2125 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
BNIP3Q12983 ATXN7-213ENST00000538065 6842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
BNIP3Q12983 FECH-202ENST00000382873 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
BNIP3Q12983 RFX1-201ENST00000254325 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
BNIP3Q12983 COCH-203ENST00000460581 2688 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
BNIP3Q12983 PTPN13-204ENST00000436978 8573 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
BNIP3Q12983 NPHP3-AS1-201ENST00000489343 2957 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
BNIP3Q12983 UBTF-201ENST00000302904 4997 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
BNIP3Q12983 KDM5C-205ENST00000404049 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
BNIP3Q12983 RHPN1-201ENST00000289013 3683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
BNIP3Q12983 LSM10-201ENST00000315732 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
BNIP3Q12983 RPL13A-201ENST00000391857 1181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
BNIP3Q12983 SMIM11A-203ENST00000399299 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
BNIP3Q12983 CD8B2-202ENST00000417670 633 ntBASIC15.05■□□□□ -0
BNIP3Q12983 AC007731.4-201ENST00000420225 652 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
BNIP3Q12983 AL157902.1-202ENST00000425010 763 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
BNIP3Q12983 AC233976.1-201ENST00000425150 451 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
BNIP3Q12983 ARTN-209ENST00000479128 471 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
BNIP3Q12983 AC078785.1-201ENST00000496389 734 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
BNIP3Q12983 LINC02205-201ENST00000559752 239 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
BNIP3Q12983 AC011447.3-204ENST00000585498 883 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
BNIP3Q12983 TUBB6-210ENST00000590967 430 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
BNIP3Q12983 RBM8A-206ENST00000632555 751 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
BNIP3Q12983 SPIN2A-201ENST00000374906 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
BNIP3Q12983 AL354989.2-201ENST00000435838 1540 ntBASIC15.05■□□□□ -0
BNIP3Q12983 PIP4K2C-207ENST00000550465 1532 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
BNIP3Q12983 AC015818.8-201ENST00000587907 1519 ntBASIC15.05■□□□□ -0
BNIP3Q12983 CHIA-201ENST00000343320 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
BNIP3Q12983 MINK1-201ENST00000347992 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
BNIP3Q12983 VSIG10-202ENST00000359236 4946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
BNIP3Q12983 SNUPN-206ENST00000564675 1682 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
BNIP3Q12983 SSFA2-205ENST00000431877 5150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
BNIP3Q12983 TINF2-202ENST00000399423 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
BNIP3Q12983 CCDC144A-202ENST00000340621 2214 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
BNIP3Q12983 PIK3IP1-203ENST00000441972 2374 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 158.7 ms