Protein–RNA interactions for Protein: Q12933

TRAF2, TNF receptor-associated factor 2, humanhuman

Predictions only

Length 501 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF2Q12933 AL162274.1-201ENST00000617191 1098 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
TRAF2Q12933 MUC1-228ENST00000620103 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TRAF2Q12933 ARID1B-222ENST00000637003 1290 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TRAF2Q12933 IL32-201ENST00000008180 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TRAF2Q12933 HAND2-AS1-202ENST00000502896 5278 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TRAF2Q12933 TSC22D1-211ENST00000501704 4026 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TRAF2Q12933 RHPN1-201ENST00000289013 3683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TRAF2Q12933 ENDOV-204ENST00000518137 2815 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TRAF2Q12933 OSBPL5-210ENST00000525498 2733 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TRAF2Q12933 ZSCAN10-209ENST00000576985 2739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TRAF2Q12933 C20orf166-AS1-203ENST00000475015 2585 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TRAF2Q12933 ZNF384-202ENST00000355772 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TRAF2Q12933 ATP11B-201ENST00000323116 7325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TRAF2Q12933 BANP-203ENST00000393207 2438 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TRAF2Q12933 DPP6-205ENST00000427557 2388 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TRAF2Q12933 PNPLA3-203ENST00000423180 2222 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TRAF2Q12933 HNRNPDL-208ENST00000621267 4139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TRAF2Q12933 NOX3-201ENST00000159060 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TRAF2Q12933 TNFSF13-202ENST00000349228 2036 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TRAF2Q12933 SCLT1-209ENST00000511426 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TRAF2Q12933 GTF2IRD1-203ENST00000455841 3315 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TRAF2Q12933 AC004805.1-201ENST00000577662 1616 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TRAF2Q12933 PACSIN2-201ENST00000263246 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TRAF2Q12933 COL11A2-202ENST00000361917 6104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TRAF2Q12933 UBE3B-202ENST00000342494 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TRAF2Q12933 NHEG1-202ENST00000432330 1357 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TRAF2Q12933 TTLL13P-202ENST00000438251 2738 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TRAF2Q12933 SNRNP27-202ENST00000409116 1339 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TRAF2Q12933 AURKC-203ENST00000448930 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TRAF2Q12933 MCL1-202ENST00000369026 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TRAF2Q12933 ALG5-201ENST00000239891 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TRAF2Q12933 ZBTB12BP-201ENST00000314232 1122 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
TRAF2Q12933 CRYAA-202ENST00000398132 826 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TRAF2Q12933 COPS6-202ENST00000418625 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TRAF2Q12933 HIST1H2BPS3-201ENST00000419683 341 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
TRAF2Q12933 GGTLC2-202ENST00000448514 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TRAF2Q12933 ZFPL1-207ENST00000526791 384 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TRAF2Q12933 AC025279.2-201ENST00000569730 653 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
TRAF2Q12933 FP236240.1-204ENST00000624932 712 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TRAF2Q12933 TNS2-201ENST00000314250 5010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TRAF2Q12933 AKAP1-201ENST00000314126 2380 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TRAF2Q12933 ARHGEF16-201ENST00000378371 2219 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TRAF2Q12933 NEDD4L-202ENST00000356462 3335 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TRAF2Q12933 ZNF800-201ENST00000265827 4203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TRAF2Q12933 TRAK1-208ENST00000484786 2008 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TRAF2Q12933 PIGT-246ENST00000639499 2021 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TRAF2Q12933 CCDC6-201ENST00000263102 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TRAF2Q12933 UBE3A-207ENST00000614096 8741 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TRAF2Q12933 SELPLG-201ENST00000228463 1704 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TRAF2Q12933 MAGEA2B-202ENST00000370293 1714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TRAF2Q12933 AC026688.2-201ENST00000518984 1734 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TRAF2Q12933 CAMSAP3-202ENST00000446248 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TRAF2Q12933 CTNS-202ENST00000381870 2470 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TRAF2Q12933 PPP1R1B-205ENST00000579000 1466 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TRAF2Q12933 TCF7-218ENST00000520958 1408 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TRAF2Q12933 APBB1-219ENST00000608704 2095 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TRAF2Q12933 MTRF1L-201ENST00000367230 3431 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TRAF2Q12933 MAGEA2-209ENST00000623806 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TRAF2Q12933 GSN-203ENST00000373808 2664 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TRAF2Q12933 SLC6A13-203ENST00000445055 1950 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TRAF2Q12933 MROH1-207ENST00000528919 5234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TRAF2Q12933 C4orf19-201ENST00000284437 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TRAF2Q12933 RETN-201ENST00000221515 520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TRAF2Q12933 CMA1-202ENST00000250378 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TRAF2Q12933 GABARAPL2-201ENST00000037243 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TRAF2Q12933 UCHL3-201ENST00000377595 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TRAF2Q12933 LENEP-202ENST00000392487 555 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
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TRAF2Q12933 AL035588.1-201ENST00000438967 408 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
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TRAF2Q12933 SCGB1C2-201ENST00000595228 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
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TRAF2Q12933 SPATA21-206ENST00000612240 603 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TRAF2Q12933 WNT11-204ENST00000621122 789 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TRAF2Q12933 RIC8A-217ENST00000626818 159 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TRAF2Q12933 AJ011931.1-201ENST00000618749 2492 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
TRAF2Q12933 NR3C1-203ENST00000394464 6795 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TRAF2Q12933 CUL7-203ENST00000535468 5504 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TRAF2Q12933 NUMBL-201ENST00000252891 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TRAF2Q12933 ZMYND10-202ENST00000360165 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TRAF2Q12933 REC8-209ENST00000611366 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TRAF2Q12933 AMZ1-201ENST00000312371 5516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TRAF2Q12933 C20orf202-201ENST00000400633 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TRAF2Q12933 POU5F1B-201ENST00000465342 5360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TRAF2Q12933 AC022400.6-201ENST00000603027 5818 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TRAF2Q12933 PSMD13-215ENST00000621534 1572 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TRAF2Q12933 PTPN20-206ENST00000395722 1995 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
TRAF2Q12933 LINC01107-201ENST00000446979 1975 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
TRAF2Q12933 PNMA3-202ENST00000593810 1432 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
TRAF2Q12933 ZNF74-209ENST00000611540 3714 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
TRAF2Q12933 GRAP-201ENST00000284154 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
TRAF2Q12933 CLASP2-203ENST00000359576 7141 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
TRAF2Q12933 B3GNTL1-211ENST00000576599 1787 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
TRAF2Q12933 DHCR7-202ENST00000407721 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
TRAF2Q12933 LRRC6-205ENST00000519595 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
TRAF2Q12933 SOD1-201ENST00000270142 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
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