Protein–RNA interactions for Protein: Q12873

CHD3, Chromodomain-helicase-DNA-binding protein 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,000 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHD3Q12873 XXYLT1-AS1-201ENST00000458531 431 ntTSL 3 BASIC12.95□□□□□ -0.34
CHD3Q12873 OARD1-212ENST00000482515 832 ntTSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
CHD3Q12873 FAM114A2-215ENST00000522858 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
CHD3Q12873 RPL8-205ENST00000527914 551 ntTSL 3 BASIC12.95□□□□□ -0.34
CHD3Q12873 AC005840.4-201ENST00000541242 2494 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
CHD3Q12873 AC091891.1-201ENST00000560688 688 ntTSL 3 BASIC12.95□□□□□ -0.34
CHD3Q12873 AC104758.2-201ENST00000562716 483 ntTSL 3 BASIC12.95□□□□□ -0.34
CHD3Q12873 AC011474.2-201ENST00000579268 543 ntTSL 3 BASIC12.95□□□□□ -0.34
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CHD3Q12873 KRT71-201ENST00000267119 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
CHD3Q12873 EXT1-201ENST00000378204 8270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
CHD3Q12873 SLC18A2-201ENST00000298472 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
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CHD3Q12873 LINC00221-201ENST00000603633 1656 ntTSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
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CHD3Q12873 PEX13-202ENST00000401576 1108 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
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CHD3Q12873 MEGF10-202ENST00000418761 2238 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
CHD3Q12873 AC138517.2-201ENST00000637503 2594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
CHD3Q12873 CRCP-201ENST00000338592 1393 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
CHD3Q12873 C5orf24-202ENST00000394976 5065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
CHD3Q12873 GRB2-203ENST00000392562 3729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
CHD3Q12873 WBP4-201ENST00000379487 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
CHD3Q12873 RALYL-207ENST00000521695 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
CHD3Q12873 AC007787.1-201ENST00000588095 1583 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
CHD3Q12873 ATP2A3-205ENST00000397041 4675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
CHD3Q12873 SPATC1-202ENST00000447830 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
CHD3Q12873 HCK-209ENST00000538448 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
CHD3Q12873 MBD1-211ENST00000585595 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
CHD3Q12873 GAL-201ENST00000265643 818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
CHD3Q12873 SPAG11A-203ENST00000351436 534 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
CHD3Q12873 SPAG11B-204ENST00000361111 534 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
CHD3Q12873 FKBP1B-201ENST00000380986 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
CHD3Q12873 PPP1R14B-202ENST00000392210 600 ntTSL 3 BASIC12.93□□□□□ -0.34
CHD3Q12873 AP000350.4-201ENST00000433835 788 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
CHD3Q12873 MBP-227ENST00000526111 581 ntTSL 4 BASIC12.93□□□□□ -0.34
CHD3Q12873 ARL2-204ENST00000529384 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.93□□□□□ -0.34
CHD3Q12873 LINC00479-204ENST00000589300 718 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
CHD3Q12873 AC138951.2-201ENST00000623455 1161 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
CHD3Q12873 PRSS30P-206ENST00000641773 873 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
CHD3Q12873 ENDOV-204ENST00000518137 2815 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
CHD3Q12873 SLC4A2-214ENST00000485713 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
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