Protein–RNA interactions for Protein: Q12791

KCNMA1, Calcium-activated potassium channel subunit alpha-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,236 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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KCNMA1Q12791 THY1-206ENST00000528522 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
KCNMA1Q12791 DEPDC7-201ENST00000241051 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
KCNMA1Q12791 VLDLR-202ENST00000382099 3240 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
KCNMA1Q12791 GLUL-202ENST00000331872 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
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KCNMA1Q12791 INSC-208ENST00000530161 1702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
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KCNMA1Q12791 SLC38A4-201ENST00000266579 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
KCNMA1Q12791 MSTO2P-201ENST00000314835 1709 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
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KCNMA1Q12791 ATP2A3-204ENST00000397035 4182 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
KCNMA1Q12791 MYH14-210ENST00000601313 6896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
KCNMA1Q12791 AC092135.3-201ENST00000624151 1846 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
KCNMA1Q12791 TRIM50-202ENST00000453152 1599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
KCNMA1Q12791 CES1-203ENST00000422046 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
KCNMA1Q12791 TRIM46-202ENST00000368382 3127 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
KCNMA1Q12791 PPP1R16B-202ENST00000373331 6106 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
KCNMA1Q12791 RTN4IP1-201ENST00000369063 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
KCNMA1Q12791 SAPCD2-201ENST00000409687 3848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
KCNMA1Q12791 STOML1-204ENST00000541638 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
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KCNMA1Q12791 AMACR-203ENST00000382072 2919 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
KCNMA1Q12791 SLC30A5-209ENST00000621204 3999 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
KCNMA1Q12791 ZBTB10-203ENST00000430430 10132 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
KCNMA1Q12791 AC012617.1-204ENST00000586340 2305 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
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KCNMA1Q12791 GOLGA6L11P-201ENST00000417252 1298 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
KCNMA1Q12791 WBP2-203ENST00000433525 928 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.8 ms