Protein–RNA interactions for Protein: Q0D2K0

NIPAL4, Magnesium transporter NIPA4, humanhuman

Predictions only

Length 466 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NIPAL4Q0D2K0 NCR1-202ENST00000338835 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
NIPAL4Q0D2K0 NCR1-203ENST00000350790 739 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
NIPAL4Q0D2K0 GABARAPL2-201ENST00000037243 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
NIPAL4Q0D2K0 POM121L8P-201ENST00000417732 1281 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
NIPAL4Q0D2K0 POM121L9P-203ENST00000441984 1285 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
NIPAL4Q0D2K0 KRT17P7-201ENST00000451704 1104 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
NIPAL4Q0D2K0 GS1-24F4.2-201ENST00000500823 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
NIPAL4Q0D2K0 RBM7-207ENST00000544582 692 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
NIPAL4Q0D2K0 AL356805.1-201ENST00000556383 341 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
NIPAL4Q0D2K0 HIRIP3-204ENST00000564026 988 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
NIPAL4Q0D2K0 AC025279.2-201ENST00000569730 653 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
NIPAL4Q0D2K0 SLC25A39-207ENST00000586016 1156 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
NIPAL4Q0D2K0 FLT3LG-205ENST00000596435 1034 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
NIPAL4Q0D2K0 GNRHR2-204ENST00000604273 1078 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
NIPAL4Q0D2K0 SNHG28-203ENST00000621242 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
NIPAL4Q0D2K0 FKBP4-208ENST00000630279 156 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
NIPAL4Q0D2K0 CYP1A1-210ENST00000617691 2521 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
NIPAL4Q0D2K0 TOMM34-201ENST00000372813 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
NIPAL4Q0D2K0 AC027601.5-201ENST00000624065 2482 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
NIPAL4Q0D2K0 PDE7A-203ENST00000401827 3673 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
NIPAL4Q0D2K0 BIRC5-203ENST00000374948 2446 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
NIPAL4Q0D2K0 WARS2-202ENST00000369426 2811 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
NIPAL4Q0D2K0 FAM103A1-201ENST00000304191 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
NIPAL4Q0D2K0 UNKL-201ENST00000248104 4320 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
NIPAL4Q0D2K0 MAPT-206ENST00000415613 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
NIPAL4Q0D2K0 ECSIT-201ENST00000252440 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
NIPAL4Q0D2K0 KAT5-216ENST00000534650 1875 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
NIPAL4Q0D2K0 HNRNPUL1-201ENST00000263367 2952 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
NIPAL4Q0D2K0 HTR3A-206ENST00000506841 2221 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
NIPAL4Q0D2K0 AC004754.1-201ENST00000600536 2242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
NIPAL4Q0D2K0 RPP40-202ENST00000380051 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
NIPAL4Q0D2K0 PNMA1-201ENST00000316836 2590 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.03
NIPAL4Q0D2K0 VCAN-211ENST00000513984 1825 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
NIPAL4Q0D2K0 C15orf52-202ENST00000397536 4717 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
NIPAL4Q0D2K0 VARS2-211ENST00000541562 3566 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
NIPAL4Q0D2K0 CLCNKA-201ENST00000331433 2475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
NIPAL4Q0D2K0 GPANK1-205ENST00000375906 2793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
NIPAL4Q0D2K0 PUDP-202ENST00000412827 1376 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
NIPAL4Q0D2K0 ADGRA1-203ENST00000607359 6004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
NIPAL4Q0D2K0 SGK1-205ENST00000413996 2686 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
NIPAL4Q0D2K0 SNX14-202ENST00000346348 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
NIPAL4Q0D2K0 PPP1R16B-201ENST00000299824 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
NIPAL4Q0D2K0 PYGM-202ENST00000377432 2611 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
NIPAL4Q0D2K0 FRMPD4-201ENST00000380682 8465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
NIPAL4Q0D2K0 NDUFB7-201ENST00000215565 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
NIPAL4Q0D2K0 ZNRD1-201ENST00000332435 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
NIPAL4Q0D2K0 VCX3B-202ENST00000381032 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
NIPAL4Q0D2K0 ITPR1-AS1-201ENST00000412804 858 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
NIPAL4Q0D2K0 RPUSD3-204ENST00000424438 1005 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
NIPAL4Q0D2K0 AC020915.1-202ENST00000427361 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
NIPAL4Q0D2K0 RNASEH1-AS1-202ENST00000438436 1218 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
NIPAL4Q0D2K0 FTH1P14-201ENST00000482930 551 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
NIPAL4Q0D2K0 CLRN2-201ENST00000511148 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
NIPAL4Q0D2K0 CD4-210ENST00000541982 1187 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
NIPAL4Q0D2K0 AC005865.1-202ENST00000543036 641 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
NIPAL4Q0D2K0 TROAP-207ENST00000548311 623 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
NIPAL4Q0D2K0 AC244669.2-201ENST00000612320 853 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
NIPAL4Q0D2K0 ETV2-208ENST00000621247 941 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
NIPAL4Q0D2K0 TRAF3-202ENST00000351691 2239 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
NIPAL4Q0D2K0 TRAPPC11-202ENST00000357207 4435 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
NIPAL4Q0D2K0 CCNB1-201ENST00000256442 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
NIPAL4Q0D2K0 AP004608.1-203ENST00000528482 3679 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
NIPAL4Q0D2K0 FGR-203ENST00000374005 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
NIPAL4Q0D2K0 DNAJC14-201ENST00000317269 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
NIPAL4Q0D2K0 C3orf62-201ENST00000343010 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
NIPAL4Q0D2K0 CYP4X1-201ENST00000371901 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
NIPAL4Q0D2K0 DMTN-203ENST00000381470 2601 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
NIPAL4Q0D2K0 AL122018.1-201ENST00000446607 2310 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
NIPAL4Q0D2K0 ATP5F1-202ENST00000369722 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
NIPAL4Q0D2K0 TCEA2-203ENST00000361317 1427 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
NIPAL4Q0D2K0 ATP6AP2-211ENST00000636196 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
NIPAL4Q0D2K0 API5-203ENST00000455725 2257 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
NIPAL4Q0D2K0 AL591623.1-201ENST00000417786 1960 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
NIPAL4Q0D2K0 IRAK4-212ENST00000551736 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
NIPAL4Q0D2K0 CYB561D1-204ENST00000420578 3326 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
NIPAL4Q0D2K0 FOXRED2-204ENST00000397224 4967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
NIPAL4Q0D2K0 SAFB-201ENST00000292123 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
NIPAL4Q0D2K0 KCTD15-201ENST00000284006 4918 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
NIPAL4Q0D2K0 TTC13-201ENST00000366661 3253 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
NIPAL4Q0D2K0 LINC00163-201ENST00000434081 2155 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
NIPAL4Q0D2K0 KLHL42-201ENST00000381271 6703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
NIPAL4Q0D2K0 CTSW-201ENST00000307886 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
NIPAL4Q0D2K0 ARFIP1-202ENST00000356064 1302 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
NIPAL4Q0D2K0 HACD3-202ENST00000442729 1332 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
NIPAL4Q0D2K0 ZC3HAV1-204ENST00000471652 3182 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
NIPAL4Q0D2K0 RADIL-201ENST00000399583 3689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
NIPAL4Q0D2K0 PRSS54-201ENST00000219301 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
NIPAL4Q0D2K0 TAF8-203ENST00000372982 1805 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
NIPAL4Q0D2K0 DIDO1-201ENST00000266070 8574 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
NIPAL4Q0D2K0 TRAPPC3-203ENST00000373163 951 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
NIPAL4Q0D2K0 AC233976.1-201ENST00000425150 451 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
NIPAL4Q0D2K0 AC245100.3-201ENST00000441281 285 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
NIPAL4Q0D2K0 AC139149.1-202ENST00000442532 783 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
NIPAL4Q0D2K0 SIRPB2-203ENST00000444444 884 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
NIPAL4Q0D2K0 AP000552.1-208ENST00000452952 576 ntTSL 4 BASIC15.25■□□□□ 0.03
NIPAL4Q0D2K0 NUTM2A-AS1-212ENST00000458739 733 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
NIPAL4Q0D2K0 AC115284.1-201ENST00000488257 547 ntTSL 4 BASIC15.25■□□□□ 0.03
NIPAL4Q0D2K0 OVOL1-AS1-202ENST00000532454 494 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
NIPAL4Q0D2K0 DRAP1-208ENST00000532933 751 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
NIPAL4Q0D2K0 AP000439.4-201ENST00000567742 664 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39 ms