Protein–RNA interactions for Protein: Q07325

CXCL9, C-X-C motif chemokine 9, humanhuman

Predictions only

Length 125 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CXCL9Q07325 PSMD4P1-201ENST00000433951 1109 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
CXCL9Q07325 AGPAT5P1-201ENST00000455855 1019 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
CXCL9Q07325 MYL7-209ENST00000458240 791 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CXCL9Q07325 AREG-202ENST00000502307 956 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
CXCL9Q07325 AC003982.2-201ENST00000536933 365 ntTSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
CXCL9Q07325 TSHR-205ENST00000554263 1184 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CXCL9Q07325 TSHR-206ENST00000554435 1089 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CXCL9Q07325 AC020659.1-202ENST00000564432 531 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
CXCL9Q07325 SRRM2-205ENST00000570971 1132 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
CXCL9Q07325 AC007952.4-201ENST00000573866 637 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
CXCL9Q07325 AC104961.2-201ENST00000578129 663 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
CXCL9Q07325 AP005131.2-201ENST00000589045 487 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
CXCL9Q07325 LINC02081-203ENST00000591384 867 ntTSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
CXCL9Q07325 AC011247.3-201ENST00000603297 438 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
CXCL9Q07325 RAB3IP-204ENST00000378815 2386 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
CXCL9Q07325 TRAK1-208ENST00000484786 2008 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
CXCL9Q07325 RNF32-202ENST00000317955 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CXCL9Q07325 CNBP-201ENST00000422453 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CXCL9Q07325 A1BG-AS1-204ENST00000595302 2130 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
CXCL9Q07325 ROCK2-209ENST00000616279 6401 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CXCL9Q07325 KRT8P28-201ENST00000433288 1390 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
CXCL9Q07325 G6PD-201ENST00000369620 1799 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
CXCL9Q07325 AAMP-202ENST00000420660 1761 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
CXCL9Q07325 PGRMC2-208ENST00000613358 3783 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CXCL9Q07325 ACOT7-210ENST00000608083 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CXCL9Q07325 SLC6A9-207ENST00000475075 1881 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
CXCL9Q07325 NRSN2-210ENST00000621012 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CXCL9Q07325 ACTL6A-202ENST00000429709 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CXCL9Q07325 SMPDL3B-201ENST00000373888 1548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CXCL9Q07325 ZNF574-202ENST00000359044 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CXCL9Q07325 SPINT1-202ENST00000562057 2456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CXCL9Q07325 PRSS50-201ENST00000460241 2960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CXCL9Q07325 TRPV4-204ENST00000536838 2514 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CXCL9Q07325 CNTNAP2-225ENST00000639247 2064 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CXCL9Q07325 SYDE2-202ENST00000341460 5512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CXCL9Q07325 METTL17-201ENST00000339374 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CXCL9Q07325 AC009242.1-201ENST00000634300 2706 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CXCL9Q07325 FAM83G-202ENST00000388995 5266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CXCL9Q07325 PAIP2-202ENST00000394795 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CXCL9Q07325 LCE3B-201ENST00000335633 288 ntAPPRIS P1 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CXCL9Q07325 TMEM242-201ENST00000367144 1030 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CXCL9Q07325 MAD2L2-206ENST00000376672 1002 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CXCL9Q07325 LY86-202ENST00000379953 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CXCL9Q07325 STK16-203ENST00000409516 895 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CXCL9Q07325 AC097059.1-201ENST00000413103 885 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CXCL9Q07325 SOX2-OT-208ENST00000477928 902 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CXCL9Q07325 AC105390.1-201ENST00000511330 560 ntTSL 4 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CXCL9Q07325 MRPL49-209ENST00000534078 518 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CXCL9Q07325 AC138701.2-201ENST00000553634 226 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
CXCL9Q07325 AC093567.1-201ENST00000590649 877 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CXCL9Q07325 ZNF530-203ENST00000597864 634 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CXCL9Q07325 AP000322.3-201ENST00000608665 388 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
CXCL9Q07325 AC073592.2-201ENST00000623062 780 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
CXCL9Q07325 AC114296.1-204ENST00000637197 1173 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CXCL9Q07325 AC002472.4-201ENST00000641915 272 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
CXCL9Q07325 CLCN2-205ENST00000457512 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CXCL9Q07325 ISLR-201ENST00000249842 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CXCL9Q07325 HSPA1B-201ENST00000375650 2521 ntAPPRIS P1 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CXCL9Q07325 FUT7-201ENST00000314412 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CXCL9Q07325 RPL13-204ENST00000452368 1455 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CXCL9Q07325 GPSM3-209ENST00000487761 1460 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CXCL9Q07325 CGGBP1-201ENST00000309534 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CXCL9Q07325 PSMC3-213ENST00000619920 1580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CXCL9Q07325 AL590440.2-201ENST00000641973 1595 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
CXCL9Q07325 CCND3-201ENST00000372987 2233 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CXCL9Q07325 TMEM198B-203ENST00000482378 2230 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CXCL9Q07325 JPH2-202ENST00000372980 4787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CXCL9Q07325 DUS2-207ENST00000565263 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CXCL9Q07325 IGSF8-202ENST00000368086 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CXCL9Q07325 SLC2A13-202ENST00000380858 3082 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CXCL9Q07325 UBAC2-AS1-201ENST00000426037 1771 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CXCL9Q07325 CYTH1-201ENST00000361101 3311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CXCL9Q07325 CYTH1-202ENST00000446868 3311 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CXCL9Q07325 PIGQ-201ENST00000026218 2846 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CXCL9Q07325 NHP2-202ENST00000314397 599 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CXCL9Q07325 ZNF165-201ENST00000377325 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CXCL9Q07325 PPM1N-201ENST00000396735 895 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CXCL9Q07325 LIF-202ENST00000403987 592 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CXCL9Q07325 AL009181.1-201ENST00000418471 1085 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CXCL9Q07325 PPM1N-208ENST00000456399 618 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CXCL9Q07325 TXNRD2-206ENST00000462330 1129 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CXCL9Q07325 CD59-210ENST00000528700 652 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CXCL9Q07325 AC090825.1-202ENST00000560059 665 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CXCL9Q07325 AC136624.2-201ENST00000574883 542 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CXCL9Q07325 MIR4472-1-201ENST00000584349 80 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
CXCL9Q07325 HKR1-225ENST00000592168 566 ntTSL 4 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CXCL9Q07325 TMIGD2-204ENST00000600349 333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CXCL9Q07325 SH2B1-203ENST00000359285 3033 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CXCL9Q07325 RRP1-207ENST00000497547 3022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CXCL9Q07325 SLC44A1-203ENST00000374724 3088 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CXCL9Q07325 EXT2-210ENST00000533608 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CXCL9Q07325 PDE2A-226ENST00000544570 3119 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CXCL9Q07325 RSPO1-202ENST00000401068 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CXCL9Q07325 TMTC1-206ENST00000551659 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CXCL9Q07325 THUMPD3-210ENST00000515662 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CXCL9Q07325 MARCKS-201ENST00000612661 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CXCL9Q07325 HRAT92-201ENST00000452622 3506 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CXCL9Q07325 SGCE-205ENST00000437425 1508 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CXCL9Q07325 GJB1-203ENST00000374029 1587 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CXCL9Q07325 ANTXR1-201ENST00000303714 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.4 ms