Protein–RNA interactions for Protein: Q05D32

CTDSPL2, CTD small phosphatase-like protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 466 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDSPL2Q05D32 SH3BGR-201ENST00000333634 1251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CTDSPL2Q05D32 MIR326-201ENST00000362220 95 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
CTDSPL2Q05D32 UBE2T-201ENST00000367274 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CTDSPL2Q05D32 GATD1-203ENST00000397472 790 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CTDSPL2Q05D32 AL355994.2-201ENST00000447882 704 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
CTDSPL2Q05D32 FAM162A-202ENST00000469967 1015 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CTDSPL2Q05D32 AC090502.1-202ENST00000515416 966 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CTDSPL2Q05D32 CYGB-203ENST00000589145 788 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CTDSPL2Q05D32 AL358472.3-201ENST00000608147 415 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
CTDSPL2Q05D32 ZACNP1-201ENST00000612259 710 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
CTDSPL2Q05D32 LINC01002-220ENST00000632790 449 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CTDSPL2Q05D32 AC006453.2-202ENST00000635968 827 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CTDSPL2Q05D32 EDDM13-208ENST00000637802 854 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CTDSPL2Q05D32 IFT52-201ENST00000373030 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CTDSPL2Q05D32 PAQR8-202ENST00000442253 4738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CTDSPL2Q05D32 AGT-201ENST00000366667 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CTDSPL2Q05D32 ZNF575-202ENST00000458714 2285 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CTDSPL2Q05D32 STYXL1-201ENST00000248600 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CTDSPL2Q05D32 DLGAP1-214ENST00000539435 2402 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CTDSPL2Q05D32 LSS-202ENST00000397728 4936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CTDSPL2Q05D32 PTPRH-201ENST00000263434 3343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CTDSPL2Q05D32 GRIK5-204ENST00000593562 3308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CTDSPL2Q05D32 SRPX-206ENST00000544439 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CTDSPL2Q05D32 DIABLO-203ENST00000353548 1345 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CTDSPL2Q05D32 TIGD4-201ENST00000304337 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CTDSPL2Q05D32 GPKOW-201ENST00000156109 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CTDSPL2Q05D32 DNAJA1-201ENST00000330899 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CTDSPL2Q05D32 PODN-201ENST00000312553 3010 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CTDSPL2Q05D32 SUSD4-204ENST00000366878 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CTDSPL2Q05D32 LINC02212-201ENST00000515243 2130 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CTDSPL2Q05D32 MCF2L2-201ENST00000328913 4980 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CTDSPL2Q05D32 MED16-203ENST00000325464 2922 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CTDSPL2Q05D32 KLHL42-201ENST00000381271 6703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CTDSPL2Q05D32 FAM189A2-201ENST00000257515 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CTDSPL2Q05D32 ZNF804B-201ENST00000333190 4659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CTDSPL2Q05D32 C17orf80-203ENST00000359042 3645 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CTDSPL2Q05D32 RSPH6A-202ENST00000597055 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CTDSPL2Q05D32 EMC4-201ENST00000249209 852 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CTDSPL2Q05D32 EIF3G-201ENST00000253108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CTDSPL2Q05D32 ELFN1-201ENST00000424383 3845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CTDSPL2Q05D32 KLK4-202ENST00000431178 481 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CTDSPL2Q05D32 GOLGA2P4-201ENST00000441462 777 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
CTDSPL2Q05D32 IQCF3-203ENST00000444293 450 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CTDSPL2Q05D32 GDNF-AS1-201ENST00000503382 604 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CTDSPL2Q05D32 FAM86HP-204ENST00000513466 959 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
CTDSPL2Q05D32 MUTYH-237ENST00000531105 501 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CTDSPL2Q05D32 USB1-203ENST00000539737 1212 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CTDSPL2Q05D32 AC125603.3-201ENST00000550742 486 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CTDSPL2Q05D32 DPF3-210ENST00000556509 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CTDSPL2Q05D32 AL583722.2-201ENST00000557223 663 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CTDSPL2Q05D32 AC002472.3-201ENST00000640124 621 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
CTDSPL2Q05D32 WHRN-202ENST00000362057 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CTDSPL2Q05D32 AC007292.2-201ENST00000593524 1812 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
CTDSPL2Q05D32 MRPS7-201ENST00000245539 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CTDSPL2Q05D32 DHX36-201ENST00000308361 3487 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CTDSPL2Q05D32 PAQR6-214ENST00000613336 1599 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CTDSPL2Q05D32 C6orf120-201ENST00000332290 2667 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CTDSPL2Q05D32 ZNF777-201ENST00000247930 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CTDSPL2Q05D32 RPH3AL-201ENST00000323434 2809 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CTDSPL2Q05D32 KCNQ2-204ENST00000359125 3253 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CTDSPL2Q05D32 BRCC3-201ENST00000330045 2496 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CTDSPL2Q05D32 SEC24D-202ENST00000419654 2786 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CTDSPL2Q05D32 EIF4G3-205ENST00000400422 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CTDSPL2Q05D32 KLC4-204ENST00000453940 1945 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CTDSPL2Q05D32 USP43-202ENST00000570475 3500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CTDSPL2Q05D32 LINC00926-201ENST00000501726 2530 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CTDSPL2Q05D32 B9D1-209ENST00000477478 1353 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CTDSPL2Q05D32 FAM208B-201ENST00000328090 8626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CTDSPL2Q05D32 FKBP6-201ENST00000252037 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CTDSPL2Q05D32 LINC00658-202ENST00000420529 1542 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CTDSPL2Q05D32 AC012313.3-202ENST00000599109 3322 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CTDSPL2Q05D32 DBF4-201ENST00000265728 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CTDSPL2Q05D32 FOXRED2-204ENST00000397224 4967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CTDSPL2Q05D32 MRPL34-201ENST00000252602 968 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CTDSPL2Q05D32 MLST8-201ENST00000301724 1735 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CTDSPL2Q05D32 ANAPC11-202ENST00000357385 881 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CTDSPL2Q05D32 AC011450.1-202ENST00000358234 573 ntTSL 4 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CTDSPL2Q05D32 NEK2-201ENST00000366998 1865 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CTDSPL2Q05D32 TPD52L2-207ENST00000369927 1094 ntTSL 4 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CTDSPL2Q05D32 RPF1-202ENST00000370656 724 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CTDSPL2Q05D32 TCEAL1-203ENST00000372626 721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CTDSPL2Q05D32 HIST1H2AH-201ENST00000377459 387 ntAPPRIS P1 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CTDSPL2Q05D32 AL136309.1-201ENST00000403917 691 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
CTDSPL2Q05D32 TLE1P1-201ENST00000422965 589 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
CTDSPL2Q05D32 AC100850.1-201ENST00000506768 649 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
CTDSPL2Q05D32 STRA6-207ENST00000535552 2631 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CTDSPL2Q05D32 KIFC3-205ENST00000540079 2781 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CTDSPL2Q05D32 PIGH-209ENST00000559581 1049 ntTSL 4 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CTDSPL2Q05D32 NIFKP4-201ENST00000567275 1192 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
CTDSPL2Q05D32 AC136428.1-201ENST00000569103 349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CTDSPL2Q05D32 AC093525.1-201ENST00000569317 596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CTDSPL2Q05D32 AC139099.3-201ENST00000572850 472 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CTDSPL2Q05D32 AP001002.3-201ENST00000623482 206 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
CTDSPL2Q05D32 NPAS2-201ENST00000335681 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CTDSPL2Q05D32 SLC25A34-201ENST00000294454 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CTDSPL2Q05D32 COCH-203ENST00000460581 2688 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CTDSPL2Q05D32 CCNL1-202ENST00000295926 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CTDSPL2Q05D32 KITLG-202ENST00000347404 1948 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CTDSPL2Q05D32 RUBCNL-212ENST00000631139 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CTDSPL2Q05D32 DEPDC7-201ENST00000241051 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.4 ms