Protein–RNA interactions for Protein: Q03989

ARID5A, AT-rich interactive domain-containing protein 5A, humanhuman

Predictions only

Length 594 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARID5AQ03989 AL360270.3-201ENST00000609118 1348 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
ARID5AQ03989 AP000550.1-201ENST00000420508 4833 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ARID5AQ03989 TMEM30B-202ENST00000555868 4471 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ARID5AQ03989 UBE2D1-201ENST00000373910 2659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ARID5AQ03989 PAX8-AS1-204ENST00000436293 2687 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ARID5AQ03989 VPS36-207ENST00000611132 4607 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ARID5AQ03989 RREB1-202ENST00000349384 7440 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ARID5AQ03989 TPM3-208ENST00000341485 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ARID5AQ03989 SLC7A4-202ENST00000403586 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ARID5AQ03989 MAP3K11-208ENST00000530153 2830 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ARID5AQ03989 AC108134.1-201ENST00000382225 3061 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ARID5AQ03989 ZCCHC17-202ENST00000373714 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ARID5AQ03989 LRRC6-205ENST00000519595 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ARID5AQ03989 GAS2L3-201ENST00000266754 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ARID5AQ03989 ELAC1-201ENST00000269466 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ARID5AQ03989 MED29-204ENST00000599213 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ARID5AQ03989 PKN1-202ENST00000342216 2960 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ARID5AQ03989 ADAM15-204ENST00000359280 2874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ARID5AQ03989 GSTO2-203ENST00000450629 1391 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ARID5AQ03989 ASPG-206ENST00000551177 4851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ARID5AQ03989 DMTN-205ENST00000432128 2508 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ARID5AQ03989 ATP13A2-202ENST00000341676 3681 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ARID5AQ03989 NRDC-201ENST00000352171 3691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ARID5AQ03989 RPS5-201ENST00000196551 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ARID5AQ03989 NPM2-201ENST00000289820 1100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ARID5AQ03989 MRPL58-201ENST00000301585 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ARID5AQ03989 NPM2-202ENST00000381530 925 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ARID5AQ03989 AL845321.1-202ENST00000432011 786 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ARID5AQ03989 RASL12-203ENST00000434605 982 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ARID5AQ03989 LINC00229-201ENST00000443783 500 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ARID5AQ03989 BMP7-AS1-201ENST00000445956 436 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ARID5AQ03989 PRKAG2-AS1-202ENST00000467458 1064 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ARID5AQ03989 DOC2GP-202ENST00000514950 1163 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
ARID5AQ03989 AC079296.1-201ENST00000531592 560 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ARID5AQ03989 DUSP13-214ENST00000607131 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ARID5AQ03989 BCRP3-202ENST00000621462 1021 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ARID5AQ03989 PDLIM3-213ENST00000629667 1016 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ARID5AQ03989 FAM219B-201ENST00000357635 3550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ARID5AQ03989 VAC14-202ENST00000536184 2161 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ARID5AQ03989 LRRC20-204ENST00000373224 3095 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ARID5AQ03989 PDGFRL-201ENST00000251630 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ARID5AQ03989 AP001267.2-201ENST00000532619 2086 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
ARID5AQ03989 C5orf66-206ENST00000624272 2479 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ARID5AQ03989 AATBC-201ENST00000400385 4598 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ARID5AQ03989 RIOX2-202ENST00000360258 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ARID5AQ03989 SLC35C2-204ENST00000372230 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ARID5AQ03989 FGFR1-201ENST00000326324 3816 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ARID5AQ03989 DLGAP1-213ENST00000534970 2365 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ARID5AQ03989 FGFR3-203ENST00000352904 3733 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ARID5AQ03989 TBC1D1-214ENST00000508802 4119 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ARID5AQ03989 RNF123-202ENST00000432042 2670 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ARID5AQ03989 GAS2L1-209ENST00000618518 3382 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ARID5AQ03989 SYP-201ENST00000263233 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ARID5AQ03989 ADAM15-201ENST00000271836 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ARID5AQ03989 RAB11FIP1-201ENST00000287263 6253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ARID5AQ03989 WDR59-201ENST00000262144 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ARID5AQ03989 UBB-201ENST00000302182 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ARID5AQ03989 SPDYE19P-201ENST00000338590 713 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
ARID5AQ03989 CALY-202ENST00000368555 783 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ARID5AQ03989 AC087499.6-201ENST00000411576 835 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
ARID5AQ03989 AL161638.1-201ENST00000420354 481 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ARID5AQ03989 AL353779.1-201ENST00000434793 351 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
ARID5AQ03989 AC011603.1-201ENST00000553174 717 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ARID5AQ03989 AC129507.1-201ENST00000570711 1013 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ARID5AQ03989 AC015688.8-201ENST00000577746 656 ntTSL 4 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ARID5AQ03989 AC010503.1-201ENST00000596027 520 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ARID5AQ03989 FOLR3-204ENST00000611028 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ARID5AQ03989 DBI-211ENST00000627093 554 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ARID5AQ03989 AC025048.6-201ENST00000634326 1161 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
ARID5AQ03989 ZMYND15-201ENST00000269289 2448 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ARID5AQ03989 CEP78-203ENST00000376598 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ARID5AQ03989 NSUN5P1-204ENST00000428392 1562 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ARID5AQ03989 STAC3-206ENST00000554578 1580 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ARID5AQ03989 SAFB-201ENST00000292123 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ARID5AQ03989 CYB561-201ENST00000360793 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ARID5AQ03989 ADAMTS13-205ENST00000371916 4330 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ARID5AQ03989 CACNA1I-203ENST00000404898 9892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ARID5AQ03989 DCUN1D4-202ENST00000381441 4207 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ARID5AQ03989 AL669831.1-201ENST00000506640 6432 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ARID5AQ03989 RAB2A-201ENST00000262646 3848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ARID5AQ03989 AMT-204ENST00000427987 1646 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ARID5AQ03989 AC113367.3-201ENST00000508316 1912 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
ARID5AQ03989 RGS9-202ENST00000443584 2078 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ARID5AQ03989 TBX5-203ENST00000405440 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ARID5AQ03989 CEP131-208ENST00000575907 3444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ARID5AQ03989 NYAP1-201ENST00000300179 3581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ARID5AQ03989 THBS2-206ENST00000617924 5280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ARID5AQ03989 MSTO1-201ENST00000245564 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ARID5AQ03989 CHEK2-204ENST00000382580 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ARID5AQ03989 TLL1-206ENST00000513213 1829 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ARID5AQ03989 ZC2HC1C-202ENST00000439583 1509 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ARID5AQ03989 AJUBA-201ENST00000262713 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ARID5AQ03989 MBD6-201ENST00000355673 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ARID5AQ03989 NUP98-203ENST00000359171 7023 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ARID5AQ03989 TMEM230-202ENST00000342308 1562 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ARID5AQ03989 PRPF38B-202ENST00000370022 1591 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ARID5AQ03989 LTBP3-221ENST00000532932 3327 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ARID5AQ03989 METTL13-202ENST00000362019 3022 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ARID5AQ03989 MRPL53-201ENST00000258105 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ARID5AQ03989 FTH1-201ENST00000273550 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.1 ms