Protein–RNA interactions for Protein: Q02487

DSC2, Desmocollin-2, humanhuman

Predictions only

Length 901 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DSC2Q02487 AC126755.1-201ENST00000525846 6405 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
DSC2Q02487 CERS3-202ENST00000394113 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
DSC2Q02487 MAGEA2-204ENST00000611674 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
DSC2Q02487 TMEM230-202ENST00000342308 1562 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
DSC2Q02487 PSMC5-209ENST00000580864 1552 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
DSC2Q02487 RALGDS-201ENST00000372047 3598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
DSC2Q02487 MAP1S-201ENST00000324096 3419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
DSC2Q02487 HNRNPU-201ENST00000283179 3120 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
DSC2Q02487 SNHG15-202ENST00000577700 3116 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
DSC2Q02487 POLR2I-201ENST00000221859 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
DSC2Q02487 DYNLRB2-201ENST00000305904 497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
DSC2Q02487 LBX2-201ENST00000341396 886 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
DSC2Q02487 DBNDD2-201ENST00000357275 1036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
DSC2Q02487 UCHL3-201ENST00000377595 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
DSC2Q02487 COPS6-202ENST00000418625 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
DSC2Q02487 AC112492.5-201ENST00000421897 457 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
DSC2Q02487 AC007969.1-201ENST00000433675 447 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
DSC2Q02487 LIMS3-203ENST00000480744 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
DSC2Q02487 RPL8-205ENST00000527914 551 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
DSC2Q02487 AP001995.1-201ENST00000531784 1157 ntTSL 4 BASIC15.21■□□□□ 0.03
DSC2Q02487 AC018653.3-202ENST00000538062 735 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
DSC2Q02487 KRT17P8-201ENST00000540749 863 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
DSC2Q02487 AC078819.1-201ENST00000547454 765 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
DSC2Q02487 AC012085.1-201ENST00000548270 765 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
DSC2Q02487 AC125603.3-201ENST00000550742 486 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
DSC2Q02487 VASH1-AS1-201ENST00000554058 871 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
DSC2Q02487 APRT-204ENST00000563655 709 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
DSC2Q02487 GLIS2-AS1-201ENST00000576080 340 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
DSC2Q02487 AC138466.3-201ENST00000619983 221 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
DSC2Q02487 USP47-207ENST00000527733 4525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
DSC2Q02487 C22orf34-201ENST00000343999 2816 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
DSC2Q02487 SLC38A10-202ENST00000374759 4300 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
DSC2Q02487 PDIA3P1-201ENST00000471856 1510 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
DSC2Q02487 MAP2K6-209ENST00000613873 1509 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
DSC2Q02487 RER1-209ENST00000605895 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
DSC2Q02487 GTF2IRD1-201ENST00000265755 3430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
DSC2Q02487 C18orf25-203ENST00000615052 5462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
DSC2Q02487 ARAP2-201ENST00000303965 7514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
DSC2Q02487 RSPO1-202ENST00000401068 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
DSC2Q02487 SNX11-202ENST00000393405 2733 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
DSC2Q02487 PRKRIP1-201ENST00000397912 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
DSC2Q02487 PPP1R21-201ENST00000281394 3137 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
DSC2Q02487 KIAA1841-201ENST00000295031 3116 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
DSC2Q02487 INE2-201ENST00000630399 1874 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
DSC2Q02487 HIST1H2AG-201ENST00000359193 2250 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
DSC2Q02487 UBE2D1-201ENST00000373910 2659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
DSC2Q02487 PLXNB1-202ENST00000358536 7308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
DSC2Q02487 FARP1-214ENST00000595437 4926 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
DSC2Q02487 SAP130-201ENST00000259234 4140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
DSC2Q02487 DLEU2-201ENST00000235290 1739 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
DSC2Q02487 ADD1-204ENST00000398123 2361 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
DSC2Q02487 DLGAP1-213ENST00000534970 2365 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
DSC2Q02487 KDM3A-201ENST00000312912 4886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
DSC2Q02487 AL589740.1-203ENST00000433637 1984 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
DSC2Q02487 C15orf52-206ENST00000559313 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
DSC2Q02487 NR4A3-201ENST00000330847 4982 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
DSC2Q02487 ROBO1-209ENST00000495273 5600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
DSC2Q02487 SLITRK2-202ENST00000370490 7672 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
DSC2Q02487 FGR-203ENST00000374005 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
DSC2Q02487 KIAA0368-201ENST00000259335 7391 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
DSC2Q02487 LETMD1-206ENST00000547008 1665 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
DSC2Q02487 SYNE3-203ENST00000554873 2826 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
DSC2Q02487 CDC25B-203ENST00000344256 3071 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
DSC2Q02487 GAL-201ENST00000265643 818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
DSC2Q02487 DBI-203ENST00000393103 599 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
DSC2Q02487 AC079776.1-201ENST00000401540 1152 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
DSC2Q02487 GGTLC2-202ENST00000448514 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
DSC2Q02487 IP6K1-203ENST00000460540 1260 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
DSC2Q02487 AL121845.2-201ENST00000467211 252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
DSC2Q02487 DNAJC19-208ENST00000486355 828 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
DSC2Q02487 MESTP3-201ENST00000503460 968 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
DSC2Q02487 AL391280.1-201ENST00000506969 1062 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
DSC2Q02487 FAM153B-214ENST00000512862 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
DSC2Q02487 RNA5SP486-201ENST00000515961 83 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
DSC2Q02487 AC012615.4-201ENST00000586694 607 ntTSL 4 BASIC15.2■□□□□ 0.02
DSC2Q02487 C19orf38-203ENST00000592854 1060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
DSC2Q02487 WNT11-204ENST00000621122 789 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
DSC2Q02487 AC138951.2-201ENST00000623455 1161 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
DSC2Q02487 AAMP-202ENST00000420660 1761 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
DSC2Q02487 ATG10-203ENST00000458350 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
DSC2Q02487 RPA3-201ENST00000223129 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
DSC2Q02487 PYGM-202ENST00000377432 2611 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
DSC2Q02487 AC020910.5-201ENST00000623668 1865 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
DSC2Q02487 PCDH10-201ENST00000264360 8489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
DSC2Q02487 IMPDH1-203ENST00000354269 2580 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
DSC2Q02487 PER2-201ENST00000254657 6385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
DSC2Q02487 DTX3-202ENST00000548198 3199 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
DSC2Q02487 LYSMD4-204ENST00000409796 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
DSC2Q02487 SAFB-202ENST00000454510 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
DSC2Q02487 PPP3CB-201ENST00000342558 2418 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
DSC2Q02487 LINC02273-201ENST00000499452 1592 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
DSC2Q02487 FYN-202ENST00000354650 3628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
DSC2Q02487 TBRG4-215ENST00000494076 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
DSC2Q02487 ZNF563-201ENST00000293725 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
DSC2Q02487 SCAF11-204ENST00000395454 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
DSC2Q02487 TRAF7-201ENST00000326181 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
DSC2Q02487 ITPK1-201ENST00000267615 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
DSC2Q02487 KCNT1-211ENST00000491806 3678 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
DSC2Q02487 BCAR3-210ENST00000539242 2114 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
DSC2Q02487 KAT8-201ENST00000219797 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.6 ms