Protein–RNA interactions for Protein: P68133

ACTA1, Actin, alpha skeletal muscle, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTA1P68133 ZNF395-201ENST00000344423 4808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
ACTA1P68133 RP1L1-202ENST00000382483 7973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
ACTA1P68133 PRDM4-201ENST00000228437 4210 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
ACTA1P68133 TFF2-201ENST00000291526 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
ACTA1P68133 MRPS18A-202ENST00000372133 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
ACTA1P68133 CLTA-203ENST00000396603 1090 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
ACTA1P68133 HFE-208ENST00000397022 1280 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
ACTA1P68133 AC005281.1-201ENST00000433040 911 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
ACTA1P68133 AC092910.3-201ENST00000484076 969 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
ACTA1P68133 HFE-214ENST00000488199 781 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
ACTA1P68133 HDAC2-AS2-213ENST00000520891 603 ntTSL 4 BASIC13.45□□□□□ -0.26
ACTA1P68133 AC090735.1-201ENST00000523881 488 ntTSL 4 BASIC13.45□□□□□ -0.26
ACTA1P68133 AC125603.3-201ENST00000550742 486 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
ACTA1P68133 IGHV3OR16-13-201ENST00000562905 353 ntAPPRIS P1 BASIC13.45□□□□□ -0.26
ACTA1P68133 FBRS-201ENST00000287468 2811 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
ACTA1P68133 MYLK-208ENST00000475616 5745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
ACTA1P68133 ITGA6-202ENST00000409080 5306 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
ACTA1P68133 MKL1-202ENST00000396617 4505 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
ACTA1P68133 OPN5-202ENST00000371211 1801 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
ACTA1P68133 PIGG-202ENST00000383028 2787 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
ACTA1P68133 TRIM13-201ENST00000356017 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
ACTA1P68133 IKZF1-218ENST00000615491 5637 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
ACTA1P68133 KSR1-216ENST00000582410 2392 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
ACTA1P68133 PCDHA11-201ENST00000398640 6115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
ACTA1P68133 AL157414.3-201ENST00000624276 1954 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
ACTA1P68133 CCDC47-201ENST00000225726 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
ACTA1P68133 CSPG4-201ENST00000308508 8290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
ACTA1P68133 C15orf59-204ENST00000569673 6573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
ACTA1P68133 STYXL1-203ENST00000359697 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
ACTA1P68133 PSMC3IP-204ENST00000587209 1381 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
ACTA1P68133 KLHL21-201ENST00000377658 4487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
ACTA1P68133 HLA-DPA1-242ENST00000419277 1704 ntAPPRIS P2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
ACTA1P68133 TBC1D2-203ENST00000375064 3174 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
ACTA1P68133 NPFFR1-201ENST00000277942 8921 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
ACTA1P68133 PEG13-201ENST00000631594 5667 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
ACTA1P68133 PTGES3-202ENST00000414274 1547 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
ACTA1P68133 PRRT2-202ENST00000358758 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
ACTA1P68133 MAOB-201ENST00000378069 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
ACTA1P68133 PIP4K2A-201ENST00000323883 1319 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
ACTA1P68133 DUOXA1-202ENST00000430224 1317 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
ACTA1P68133 ASB10-204ENST00000420175 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
ACTA1P68133 RILPL1-202ENST00000376874 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
ACTA1P68133 AC005523.2-201ENST00000601192 3568 ntTSL 4 BASIC13.44□□□□□ -0.26
ACTA1P68133 TOP3B-201ENST00000357179 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
ACTA1P68133 NDUFC2-201ENST00000281031 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
ACTA1P68133 KIFC3-207ENST00000543930 3018 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
ACTA1P68133 ATE1-201ENST00000224652 4930 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
ACTA1P68133 KIAA0319-201ENST00000378214 6802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
ACTA1P68133 PDLIM5-202ENST00000318007 1960 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
ACTA1P68133 TMEM5-205ENST00000537373 1966 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
ACTA1P68133 CRYBG2-201ENST00000308182 5245 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
ACTA1P68133 PDCD2L-201ENST00000246535 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
ACTA1P68133 GOLIM4-201ENST00000309027 2100 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
ACTA1P68133 ATP1A1-AS1-202ENST00000369492 1011 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
ACTA1P68133 AL645937.2-201ENST00000396808 931 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
ACTA1P68133 AL121832.1-203ENST00000433121 475 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
ACTA1P68133 LINC01705-201ENST00000438158 562 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
ACTA1P68133 NSUN5P1-208ENST00000473960 500 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
ACTA1P68133 AC026191.1-201ENST00000491930 829 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
ACTA1P68133 GABARAPL1-217ENST00000545887 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
ACTA1P68133 AL512356.2-201ENST00000546955 174 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
ACTA1P68133 LHX5-AS1-201ENST00000551357 522 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
ACTA1P68133 AL512361.1-201ENST00000554200 418 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
ACTA1P68133 AC010336.2-201ENST00000564226 506 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
ACTA1P68133 LINC01413-201ENST00000564843 772 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
ACTA1P68133 AC051619.7-201ENST00000568314 623 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
ACTA1P68133 PYCR1-207ENST00000577756 1144 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
ACTA1P68133 LINC01128-208ENST00000608189 824 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
ACTA1P68133 TVP23A-210ENST00000612195 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
ACTA1P68133 APBB1IP-202ENST00000376236 2771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
ACTA1P68133 MPZL1-203ENST00000392121 3421 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
ACTA1P68133 UBE3A-220ENST00000630424 5075 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
ACTA1P68133 RPARP-AS1-202ENST00000492465 1556 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
ACTA1P68133 ELAC1-201ENST00000269466 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
ACTA1P68133 BEND5-201ENST00000371833 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
ACTA1P68133 DDX19A-202ENST00000417604 1703 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
ACTA1P68133 RPUSD2-201ENST00000315616 2358 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
ACTA1P68133 CDK17-201ENST00000261211 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
ACTA1P68133 GCC1-201ENST00000321407 4149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
ACTA1P68133 CD244-202ENST00000368033 1360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
ACTA1P68133 DNAJA4-206ENST00000446172 1399 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
ACTA1P68133 TNS2-202ENST00000314276 4944 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
ACTA1P68133 AL589669.1-201ENST00000639829 1506 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
ACTA1P68133 NOX5-203ENST00000448182 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
ACTA1P68133 LANCL3-202ENST00000378621 10298 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
ACTA1P68133 SLC25A29-208ENST00000554912 5169 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
ACTA1P68133 DNAJC27-207ENST00000534855 4831 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
ACTA1P68133 ARID4B-201ENST00000264183 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
ACTA1P68133 TP73-205ENST00000378285 2117 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
ACTA1P68133 RSPH9-202ENST00000372165 2586 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
ACTA1P68133 URAHP-202ENST00000409873 1349 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
ACTA1P68133 MSH5-201ENST00000375703 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
ACTA1P68133 RIMS1-214ENST00000518273 4116 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
ACTA1P68133 ITGB4-202ENST00000449880 5689 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
ACTA1P68133 ILDR1-205ENST00000462014 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
ACTA1P68133 ELAVL2-201ENST00000223951 3763 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
ACTA1P68133 AMIGO2-201ENST00000266581 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
ACTA1P68133 CFAP52-202ENST00000396219 1912 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
ACTA1P68133 RIC8B-202ENST00000392837 5135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
ACTA1P68133 AGRN-201ENST00000379370 7323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
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