Protein–RNA interactions for Protein: P60709

ACTB, Actin, cytoplasmic 1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTBP60709 OSBPL8-218ENST00000611266 7239 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
ACTBP60709 ASAH1-258ENST00000637790 3042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
ACTBP60709 HMGA2-204ENST00000403681 4473 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
ACTBP60709 CLK4-201ENST00000316308 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
ACTBP60709 IMPDH1-204ENST00000419067 2431 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
ACTBP60709 SHPK-201ENST00000225519 3838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
ACTBP60709 EPAS1-201ENST00000263734 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
ACTBP60709 LARP4-201ENST00000293618 6296 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
ACTBP60709 AL357054.3-201ENST00000607084 2055 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
ACTBP60709 ATG14-201ENST00000247178 4742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
ACTBP60709 MLXIPL-205ENST00000429400 3173 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
ACTBP60709 SRPX-206ENST00000544439 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
ACTBP60709 AC027288.3-202ENST00000550268 1820 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
ACTBP60709 ANKHD1-203ENST00000360839 8221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
ACTBP60709 DBN1-203ENST00000393565 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
ACTBP60709 RBM6-201ENST00000266022 3750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
ACTBP60709 SCYL1-208ENST00000527009 2586 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
ACTBP60709 TMEM209-202ENST00000462753 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
ACTBP60709 SMTN-223ENST00000619644 3227 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
ACTBP60709 PSMC3IP-204ENST00000587209 1381 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
ACTBP60709 C22orf34-204ENST00000414287 2197 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
ACTBP60709 ZNF593-201ENST00000270812 698 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
ACTBP60709 PLK2-201ENST00000274289 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
ACTBP60709 ITLN1-201ENST00000326245 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
ACTBP60709 FO393414.2-201ENST00000405153 598 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
ACTBP60709 AP001062.3-201ENST00000422357 704 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
ACTBP60709 KIAA0930-215ENST00000496226 589 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
ACTBP60709 TVP23B-206ENST00000574226 1080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
ACTBP60709 AC068594.1-203ENST00000581153 695 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
ACTBP60709 AC103808.2-201ENST00000582755 594 ntTSL 4 BASIC12.99□□□□□ -0.33
ACTBP60709 KF456478.1-201ENST00000585980 472 ntTSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
ACTBP60709 COLCA2-206ENST00000638573 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
ACTBP60709 AC084121.4-201ENST00000641598 221 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
ACTBP60709 AF228730.8-201ENST00000642140 221 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
ACTBP60709 SEMA4B-201ENST00000332496 3781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
ACTBP60709 MARS-201ENST00000262027 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
ACTBP60709 AC090099.1-203ENST00000527059 2945 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
ACTBP60709 CYP4F11-202ENST00000326742 2877 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
ACTBP60709 ADAM15-202ENST00000355956 2877 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
ACTBP60709 NDNF-201ENST00000379692 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
ACTBP60709 NR4A1-213ENST00000550082 2029 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
ACTBP60709 CDH16-202ENST00000394055 2821 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
ACTBP60709 ESR2-209ENST00000555278 1883 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
ACTBP60709 SLC2A11-223ENST00000611880 3264 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
ACTBP60709 TPM3-205ENST00000328159 1771 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
ACTBP60709 ARPC4-TTLL3-201ENST00000397256 2466 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
ACTBP60709 FGR-204ENST00000399173 2483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
ACTBP60709 MED22-209ENST00000610888 3867 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
ACTBP60709 KCNJ5-201ENST00000338350 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
ACTBP60709 OXCT1-AS1-201ENST00000508458 1731 ntTSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
ACTBP60709 PITX2-204ENST00000394595 1693 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
ACTBP60709 PTBP1-221ENST00000635647 3691 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
ACTBP60709 PMM2-201ENST00000268261 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
ACTBP60709 ZW10-201ENST00000200135 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
ACTBP60709 SLC20A2-208ENST00000520262 2992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
ACTBP60709 GRN-214ENST00000589265 1632 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
ACTBP60709 HDAC11-213ENST00000437379 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
ACTBP60709 CFAP74-209ENST00000493964 5247 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
ACTBP60709 SCYL1-205ENST00000524944 2715 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
ACTBP60709 DNASE1L1-206ENST00000393638 2665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
ACTBP60709 COL25A1-201ENST00000399126 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
ACTBP60709 ARAP1-201ENST00000334211 4942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
ACTBP60709 HES2-201ENST00000377834 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
ACTBP60709 KCNK9-203ENST00000520439 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
ACTBP60709 SNAP91-215ENST00000521743 4263 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
ACTBP60709 FAM153B-220ENST00000515817 1966 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
ACTBP60709 FAM90A1-203ENST00000538603 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
ACTBP60709 FAM9C-205ENST00000542843 5858 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
ACTBP60709 ARHGEF1-202ENST00000347545 3091 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
ACTBP60709 LILRP1-201ENST00000444199 1370 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
ACTBP60709 AC009133.1-201ENST00000569981 2449 ntTSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
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ACTBP60709 GPR68-203ENST00000531499 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
ACTBP60709 MKRN3-201ENST00000314520 2337 ntAPPRIS P1 BASIC12.98□□□□□ -0.33
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ACTBP60709 SYNRG-231ENST00000622045 3859 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
ACTBP60709 GALNT4-201ENST00000529983 5399 ntAPPRIS P1 BASIC12.98□□□□□ -0.33
ACTBP60709 CENPM-201ENST00000215980 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
ACTBP60709 PSMB6-201ENST00000270586 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
ACTBP60709 TNFAIP8L1-201ENST00000327473 3814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
ACTBP60709 MRNIP-202ENST00000376931 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
ACTBP60709 AL627223.1-201ENST00000416693 442 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
ACTBP60709 AL109613.1-202ENST00000427243 639 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
ACTBP60709 LINC01705-201ENST00000438158 562 ntTSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
ACTBP60709 IRF3-204ENST00000442265 315 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
ACTBP60709 AL355140.1-201ENST00000457328 398 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
ACTBP60709 TNFAIP8L1-202ENST00000536716 3845 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
ACTBP60709 RAB26-202ENST00000541451 944 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
ACTBP60709 PPP1R14B-203ENST00000542235 920 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
ACTBP60709 KRT73-AS1-202ENST00000551089 563 ntTSL 4 BASIC12.98□□□□□ -0.33
ACTBP60709 LHX5-AS1-201ENST00000551357 522 ntTSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
ACTBP60709 CIRBP-204ENST00000585630 870 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC12.98□□□□□ -0.33
ACTBP60709 AC108010.1-201ENST00000605862 1107 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
ACTBP60709 LINC00623-201ENST00000613486 486 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
ACTBP60709 PSMB6-205ENST00000614486 871 ntTSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
ACTBP60709 CCDC117-202ENST00000421503 3766 ntTSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
ACTBP60709 WDR17-205ENST00000508596 4294 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
ACTBP60709 CASC2-202ENST00000426021 3232 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
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