Protein–RNA interactions for Protein: P48165

GJA8, Gap junction alpha-8 protein, humanhuman

Predictions only

Length 433 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJA8P48165 OR4S1-201ENST00000319988 930 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
GJA8P48165 AC019118.2-201ENST00000425776 718 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
GJA8P48165 LINC01278-201ENST00000433061 529 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
GJA8P48165 SERBP1P2-201ENST00000436888 1164 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
GJA8P48165 AC013448.2-201ENST00000440341 787 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
GJA8P48165 LINC00211-203ENST00000446799 662 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
GJA8P48165 SNRPF-204ENST00000552085 815 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
GJA8P48165 AC006548.2-201ENST00000605217 529 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
GJA8P48165 AC012073.1-201ENST00000606114 1108 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
GJA8P48165 LINC01278-206ENST00000610088 554 ntTSL 4 BASIC16.46■□□□□ 0.23
GJA8P48165 BX088702.1-201ENST00000610784 235 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
GJA8P48165 PMP22-201ENST00000312280 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
GJA8P48165 NOL4L-211ENST00000621426 6577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
GJA8P48165 SLC34A1-204ENST00000512593 1912 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
GJA8P48165 CHRNA7-217ENST00000636603 2012 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
GJA8P48165 NFYC-205ENST00000372654 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
GJA8P48165 DDHD1-202ENST00000357758 5603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
GJA8P48165 DHCR7-201ENST00000355527 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
GJA8P48165 SLAIN2-201ENST00000264313 6299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
GJA8P48165 RAB22A-201ENST00000244040 8670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
GJA8P48165 APOLD1-202ENST00000356591 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
GJA8P48165 REPS2-201ENST00000303843 7771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
GJA8P48165 UBE2R2-201ENST00000263228 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
GJA8P48165 RAD1-202ENST00000341754 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
GJA8P48165 ACE-204ENST00000428043 5120 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
GJA8P48165 LINC00200-201ENST00000425630 2434 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
GJA8P48165 CORO6-201ENST00000345068 2603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
GJA8P48165 LINC00599-203ENST00000519461 2922 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
GJA8P48165 SCUBE2-207ENST00000520467 3148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
GJA8P48165 CCDC136-212ENST00000487361 2268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
GJA8P48165 TK2-201ENST00000299697 5114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
GJA8P48165 MAP4K3-202ENST00000341681 4271 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
GJA8P48165 KLHDC2-206ENST00000554589 1641 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
GJA8P48165 SELENOV-201ENST00000335426 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
GJA8P48165 SELENOV-205ENST00000622070 1704 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
GJA8P48165 TEAD3-201ENST00000338863 2983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
GJA8P48165 VARS-215ENST00000375663 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
GJA8P48165 OSGIN1-203ENST00000393306 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
GJA8P48165 SLC7A5-201ENST00000261622 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
GJA8P48165 SLC12A9-201ENST00000354161 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
GJA8P48165 IFT74-203ENST00000433700 2119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
GJA8P48165 BAIAP2-205ENST00000435091 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
GJA8P48165 USP13-201ENST00000263966 8323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
GJA8P48165 ZNF436-AS1-201ENST00000335648 2547 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
GJA8P48165 MDFIC-202ENST00000393486 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
GJA8P48165 NEURL1B-201ENST00000369800 6424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
GJA8P48165 OTUD7A-201ENST00000307050 10770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
GJA8P48165 MMP2-201ENST00000219070 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
GJA8P48165 GTF3C6-201ENST00000329970 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
GJA8P48165 FAM3B-201ENST00000357985 1088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
GJA8P48165 TRBV4-1-201ENST00000390357 373 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
GJA8P48165 TRBV4-2-201ENST00000390392 455 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
GJA8P48165 AL390778.2-201ENST00000420883 886 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
GJA8P48165 DUX4L50-201ENST00000455245 715 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
GJA8P48165 TXNRD2-206ENST00000462330 1129 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
GJA8P48165 SOX2-OT-208ENST00000477928 902 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
GJA8P48165 RHEB-207ENST00000496004 744 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
GJA8P48165 HERC2P11-201ENST00000562845 725 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
GJA8P48165 AC100756.2-201ENST00000569537 736 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
GJA8P48165 SRRM2-205ENST00000570971 1132 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
GJA8P48165 THY1-209ENST00000580275 578 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
GJA8P48165 FTLP5-201ENST00000586853 534 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
GJA8P48165 PGPEP1-206ENST00000597431 545 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
GJA8P48165 LINC02018-201ENST00000608169 1268 ntTSL 4 BASIC16.45■□□□□ 0.22
GJA8P48165 AL138720.1-201ENST00000629853 778 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
GJA8P48165 CHRNA1-203ENST00000409219 1466 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
GJA8P48165 CCDC51-206ENST00000447018 1461 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
GJA8P48165 SLC3A2-203ENST00000377890 2161 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
GJA8P48165 LAT2-204ENST00000398475 2453 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
GJA8P48165 MAP3K8-207ENST00000542547 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
GJA8P48165 LRRN2-203ENST00000367177 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
GJA8P48165 TEX261-201ENST00000272438 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
GJA8P48165 PIEZO1-201ENST00000301015 8072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
GJA8P48165 KCNN2-201ENST00000264773 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
GJA8P48165 GOSR2-211ENST00000623037 1814 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
GJA8P48165 THSD1-202ENST00000349258 3189 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GJA8P48165 MEN1-207ENST00000377326 3150 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
GJA8P48165 STAT3-201ENST00000264657 5047 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GJA8P48165 PDE4C-202ENST00000355502 5979 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
GJA8P48165 AADAT-201ENST00000337664 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GJA8P48165 MGEA5-202ENST00000361464 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GJA8P48165 RAPSN-201ENST00000298854 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GJA8P48165 SLC29A2-205ENST00000544554 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
GJA8P48165 TOM1L1-221ENST00000575882 2507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GJA8P48165 DAB2IP-201ENST00000259371 5469 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
GJA8P48165 AC004554.1-201ENST00000422830 1468 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
GJA8P48165 NEK3-206ENST00000611833 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
GJA8P48165 SERPINB6-206ENST00000380546 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GJA8P48165 ZNF619-201ENST00000314686 2233 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
GJA8P48165 MFSD1-202ENST00000392813 2244 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
GJA8P48165 SCP2-204ENST00000407246 2239 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
GJA8P48165 AASDHPPT-201ENST00000278618 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GJA8P48165 PLAC9P1-201ENST00000397540 389 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
GJA8P48165 KRT18P36-201ENST00000411618 1276 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
GJA8P48165 RAD51C-203ENST00000421782 567 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GJA8P48165 ATP1A4-205ENST00000470705 886 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GJA8P48165 NAPSB-201ENST00000525179 678 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
GJA8P48165 RAP1B-216ENST00000537460 1072 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
GJA8P48165 NAA40-206ENST00000542163 1035 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
GJA8P48165 PIGT-208ENST00000545755 1158 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35 ms