Protein–RNA interactions for Protein: P40425

PBX2, Pre-B-cell leukemia transcription factor 2, humanhuman

Predictions only

Length 430 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PBX2P40425 LRRC47-201ENST00000378251 4310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PBX2P40425 MTDH-201ENST00000336273 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PBX2P40425 GSAP-201ENST00000257626 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PBX2P40425 SPATC1L-201ENST00000291672 2303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PBX2P40425 CACNA1H-206ENST00000565831 7815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PBX2P40425 TSC2-222ENST00000568454 5434 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PBX2P40425 ZBTB10-202ENST00000426744 9878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PBX2P40425 ZNF7-202ENST00000446747 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PBX2P40425 ZMYND10-202ENST00000360165 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PBX2P40425 TNFRSF1A-202ENST00000366159 1339 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PBX2P40425 TBC1D2B-201ENST00000300584 6067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PBX2P40425 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PBX2P40425 JMJD4-206ENST00000615711 2591 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PBX2P40425 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PBX2P40425 CALR3-201ENST00000269881 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PBX2P40425 FERD3L-201ENST00000275461 640 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PBX2P40425 PRTFDC1-202ENST00000376376 741 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PBX2P40425 PLAC9P1-201ENST00000397540 389 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PBX2P40425 GUSBP10-201ENST00000417412 665 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
PBX2P40425 AC019118.2-201ENST00000425776 718 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PBX2P40425 AC073115.1-201ENST00000436056 532 ntTSL 4 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PBX2P40425 LINC01378-202ENST00000437514 783 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PBX2P40425 RPS23-204ENST00000507980 836 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PBX2P40425 AC026191.1-204ENST00000517846 608 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PBX2P40425 IFITM1-204ENST00000528780 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PBX2P40425 ACTN1-AS1-202ENST00000553961 599 ntTSL 4 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PBX2P40425 AC092131.1-201ENST00000564046 548 ntTSL 4 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PBX2P40425 AC007952.4-201ENST00000573866 637 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
PBX2P40425 AC011451.1-201ENST00000591336 405 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PBX2P40425 ALKBH7-202ENST00000596657 603 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PBX2P40425 AL139339.2-201ENST00000608063 657 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
PBX2P40425 CDH16-207ENST00000568632 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PBX2P40425 CLIC5-208ENST00000544153 2051 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PBX2P40425 CAPN3-207ENST00000397200 1643 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PBX2P40425 SLC39A1-203ENST00000368621 2398 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PBX2P40425 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PBX2P40425 KIF16B-203ENST00000408042 4640 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PBX2P40425 NFATC3-222ENST00000575270 3824 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PBX2P40425 PPP1R26-202ENST00000401470 4769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PBX2P40425 SMAD3-201ENST00000327367 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PBX2P40425 TSC2-201ENST00000219476 6156 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
PBX2P40425 AMFR-201ENST00000290649 3600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PBX2P40425 TMEM139-205ENST00000410004 2114 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
PBX2P40425 PIEZO1-201ENST00000301015 8072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PBX2P40425 C16orf58-211ENST00000570164 2783 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
PBX2P40425 PDZD8-201ENST00000334464 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PBX2P40425 RND2-202ENST00000587250 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PBX2P40425 PRODH2-201ENST00000301175 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PBX2P40425 TMEM258-207ENST00000543510 1692 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
PBX2P40425 CLMAT3-201ENST00000510576 1973 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PBX2P40425 AC013726.1-201ENST00000563747 2285 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
PBX2P40425 APBB1-218ENST00000608655 1920 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
PBX2P40425 UNC13A-205ENST00000551649 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
PBX2P40425 KRTAP1-3-201ENST00000344363 972 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
PBX2P40425 TNNT2-203ENST00000367315 1083 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
PBX2P40425 ZNRD1-203ENST00000376782 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
PBX2P40425 C11orf49-203ENST00000378618 1166 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
PBX2P40425 THAP4-202ENST00000402136 785 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PBX2P40425 LAMA4-209ENST00000453937 645 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PBX2P40425 AC244197.1-201ENST00000456494 951 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
PBX2P40425 AC068985.1-201ENST00000463297 703 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
PBX2P40425 TMEM222-204ENST00000466759 368 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
PBX2P40425 AC078828.1-201ENST00000471993 458 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
PBX2P40425 AC055748.1-201ENST00000489836 959 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
PBX2P40425 AC093627.2-201ENST00000497017 568 ntTSL 4 BASIC15.77■□□□□ 0.12
PBX2P40425 AC109479.3-201ENST00000520163 360 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
PBX2P40425 AC022087.1-201ENST00000558372 612 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
PBX2P40425 AC022558.1-201ENST00000560450 454 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
PBX2P40425 AL031058.1-201ENST00000561592 888 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
PBX2P40425 TMEM205-210ENST00000588560 840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
PBX2P40425 SIGLEC22P-202ENST00000602065 544 ntTSL 4 BASIC15.77■□□□□ 0.12
PBX2P40425 NOP16-211ENST00000621444 954 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PBX2P40425 GUCY1A2-202ENST00000347596 2532 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PBX2P40425 SPECC1-203ENST00000395525 2536 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PBX2P40425 PDE8B-201ENST00000264917 5956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
PBX2P40425 TMEM132E-201ENST00000321639 5631 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
PBX2P40425 RMND1-202ENST00000367303 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
PBX2P40425 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
PBX2P40425 HSD17B6-206ENST00000555159 1525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
PBX2P40425 AC112504.1-201ENST00000623415 1841 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
PBX2P40425 SLC29A1-206ENST00000371755 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
PBX2P40425 ADARB1-202ENST00000360697 6604 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
PBX2P40425 GINS2-201ENST00000253462 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
PBX2P40425 PANK4-201ENST00000378466 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
PBX2P40425 KRT35-201ENST00000246639 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
PBX2P40425 SUFU-202ENST00000369902 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
PBX2P40425 SLCO5A1-206ENST00000530307 2630 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
PBX2P40425 ARHGAP27-214ENST00000532891 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
PBX2P40425 CTSB-201ENST00000345125 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
PBX2P40425 PCDHA12-202ENST00000613593 2588 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
PBX2P40425 ALG11-203ENST00000523764 1404 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
PBX2P40425 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
PBX2P40425 PCDH8P1-201ENST00000428983 2773 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
PBX2P40425 MFSD2A-201ENST00000372809 2173 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PBX2P40425 LRRC6-213ENST00000620350 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PBX2P40425 IFNGR1-201ENST00000367739 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PBX2P40425 SALL3-202ENST00000537592 6555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PBX2P40425 ADIRF-AS1-201ENST00000418273 2627 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PBX2P40425 MAEL-201ENST00000367870 1831 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PBX2P40425 CAMK2G-205ENST00000372765 1822 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.2 ms