Protein–RNA interactions for Protein: P31271

HOXA13, Homeobox protein Hox-A13, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 388 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA13P31271 AC007663.3-201ENST00000609632 465 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
HOXA13P31271 TNXB-208ENST00000611016 6083 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
HOXA13P31271 C11orf80-201ENST00000360962 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
HOXA13P31271 PSD4-201ENST00000245796 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
HOXA13P31271 AL359915.2-205ENST00000418015 1529 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
HOXA13P31271 FLJ16779-201ENST00000612722 7638 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
HOXA13P31271 SHISA9-203ENST00000558583 6724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
HOXA13P31271 CPSF7-202ENST00000394888 3650 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
HOXA13P31271 COL4A3BP-204ENST00000405807 2843 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
HOXA13P31271 HEY1-202ENST00000354724 2293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
HOXA13P31271 SNX14-215ENST00000513865 2259 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
HOXA13P31271 PPM1B-204ENST00000378551 3877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
HOXA13P31271 FAM53B-202ENST00000337318 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
HOXA13P31271 TRA2A-202ENST00000392502 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
HOXA13P31271 METTL6-201ENST00000383789 1413 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
HOXA13P31271 SELENOS-201ENST00000398226 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
HOXA13P31271 UBE2J1-201ENST00000435041 4290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
HOXA13P31271 GRID2IP-201ENST00000435185 3215 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
HOXA13P31271 IQCF3-205ENST00000456080 1685 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
HOXA13P31271 BUD13-201ENST00000260210 2196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
HOXA13P31271 RFK-201ENST00000376736 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
HOXA13P31271 NIN-203ENST00000382041 6496 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
HOXA13P31271 USP43-201ENST00000285199 4169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
HOXA13P31271 EVPL-201ENST00000301607 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
HOXA13P31271 JKAMP-207ENST00000554271 2137 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
HOXA13P31271 ISCA2-204ENST00000556816 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
HOXA13P31271 AC104640.1-201ENST00000562617 2109 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
HOXA13P31271 TBC1D8-202ENST00000409318 3803 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
HOXA13P31271 ETNPPL-201ENST00000296486 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
HOXA13P31271 SMYD1-203ENST00000444564 1816 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
HOXA13P31271 FOXRED2-204ENST00000397224 4967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
HOXA13P31271 USP35-203ENST00000529308 4216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
HOXA13P31271 FCHO1-206ENST00000594202 3214 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
HOXA13P31271 PIGT-246ENST00000639499 2021 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
HOXA13P31271 TIMP2-201ENST00000262768 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
HOXA13P31271 PARP16-201ENST00000261888 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
HOXA13P31271 AAMP-202ENST00000420660 1761 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
HOXA13P31271 CYB561D1-205ENST00000430195 5077 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
HOXA13P31271 AJ011931.1-201ENST00000618749 2492 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
HOXA13P31271 FKBP6-201ENST00000252037 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
HOXA13P31271 MAP7-207ENST00000616617 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
HOXA13P31271 SLURP2-201ENST00000317543 599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
HOXA13P31271 TSPO-201ENST00000329563 955 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
HOXA13P31271 KRTAP21-2-201ENST00000333892 440 ntAPPRIS P1 BASIC17.03■□□□□ 0.32
HOXA13P31271 VAMP4-202ENST00000367740 1193 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
HOXA13P31271 SMS-201ENST00000379404 1174 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
HOXA13P31271 HNRNPA1P32-201ENST00000396326 963 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
HOXA13P31271 KRT8P13-201ENST00000463294 1010 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
HOXA13P31271 AL157935.2-201ENST00000476274 1071 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
HOXA13P31271 TSPO-206ENST00000583777 636 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
HOXA13P31271 EPS8L2-201ENST00000318562 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
HOXA13P31271 MSTO1-201ENST00000245564 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
HOXA13P31271 RCOR2-201ENST00000301459 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
HOXA13P31271 PEPD-201ENST00000244137 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
HOXA13P31271 CLCN2-201ENST00000265593 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
HOXA13P31271 IL6ST-209ENST00000502326 3007 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
HOXA13P31271 PKD2L2-205ENST00000508638 2333 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
HOXA13P31271 ADPRHL1-201ENST00000356501 1877 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
HOXA13P31271 ADCY2-201ENST00000338316 6575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
HOXA13P31271 MTA2-201ENST00000278823 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
HOXA13P31271 FBXO45-202ENST00000440469 3689 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
HOXA13P31271 TMCO5B-204ENST00000529696 1568 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
HOXA13P31271 ADAD1-201ENST00000296513 1961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
HOXA13P31271 IGHA2-202ENST00000497872 1320 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
HOXA13P31271 ENDOU-203ENST00000545824 1513 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
HOXA13P31271 NMNAT3-203ENST00000413939 1711 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
HOXA13P31271 SHC1P1-201ENST00000425230 1745 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
HOXA13P31271 SLK-201ENST00000335753 7673 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
HOXA13P31271 CYP4F11-202ENST00000326742 2877 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
HOXA13P31271 MBD3L5-201ENST00000329753 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
HOXA13P31271 FAM24B-202ENST00000368898 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
HOXA13P31271 RBM8A-201ENST00000369307 796 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
HOXA13P31271 LMO4-201ENST00000370542 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
HOXA13P31271 AGER-203ENST00000375065 665 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
HOXA13P31271 NRSN2-201ENST00000382285 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
HOXA13P31271 TLE1P1-201ENST00000422965 589 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
HOXA13P31271 TMEM107-203ENST00000431792 455 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
HOXA13P31271 AL355994.3-201ENST00000437156 466 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
HOXA13P31271 AC004898.1-201ENST00000451057 766 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
HOXA13P31271 APOPT1-207ENST00000477116 906 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
HOXA13P31271 PAX5-211ENST00000522003 1019 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
HOXA13P31271 AL451050.2-201ENST00000606967 682 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
HOXA13P31271 MLLT10-216ENST00000621220 381 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
HOXA13P31271 ASAH1-201ENST00000262097 2618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
HOXA13P31271 CNKSR1-201ENST00000361530 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
HOXA13P31271 NOP2-222ENST00000617555 2017 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
HOXA13P31271 ZNF286A-218ENST00000583566 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
HOXA13P31271 MBTD1-201ENST00000376381 1420 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
HOXA13P31271 NKIRAS1-208ENST00000443659 2391 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
HOXA13P31271 PTOV1-214ENST00000600603 1443 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
HOXA13P31271 MCF2L2-201ENST00000328913 4980 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
HOXA13P31271 ELMSAN1-202ENST00000394071 7721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
HOXA13P31271 MFSD14B-201ENST00000375344 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
HOXA13P31271 SCAF11-204ENST00000395454 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
HOXA13P31271 SURF6-201ENST00000372022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
HOXA13P31271 CNBP-208ENST00000504813 1549 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
HOXA13P31271 LINC01101-201ENST00000622953 1884 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
HOXA13P31271 ABLIM2-201ENST00000341937 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
HOXA13P31271 ZFPM2-206ENST00000520492 3960 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
HOXA13P31271 EPHX2-209ENST00000521780 2038 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 81.3 ms