Protein–RNA interactions for Protein: P30084

ECHS1, Enoyl-CoA hydratase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 290 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ECHS1P30084 SAFB-211ENST00000592224 3014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ECHS1P30084 TMUB2-211ENST00000589184 1837 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ECHS1P30084 ABLIM3-206ENST00000506113 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ECHS1P30084 HOXA3-201ENST00000317201 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ECHS1P30084 BCAR1-208ENST00000542031 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ECHS1P30084 UHRF1BP1-202ENST00000452449 4706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ECHS1P30084 PUF60-209ENST00000527197 1559 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ECHS1P30084 SP8-203ENST00000617581 3496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ECHS1P30084 NLRP2B-201ENST00000434992 3194 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ECHS1P30084 FYCO1-205ENST00000535325 8578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ECHS1P30084 ADGRG2-207ENST00000379869 4768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ECHS1P30084 HIST3H2A-201ENST00000366695 895 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ECHS1P30084 TMEM120A-203ENST00000439537 1161 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ECHS1P30084 RN7SL618P-201ENST00000477850 296 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
ECHS1P30084 AC092910.3-201ENST00000484076 969 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ECHS1P30084 AC021491.2-201ENST00000513017 607 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ECHS1P30084 KIRREL3-AS1-201ENST00000548204 586 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ECHS1P30084 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ECHS1P30084 COX5A-203ENST00000564811 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ECHS1P30084 TRAPPC6A-202ENST00000585934 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ECHS1P30084 GRIK4-208ENST00000638419 3593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ECHS1P30084 SYT9-201ENST00000318881 3955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ECHS1P30084 LHFPL2-207ENST00000515007 4680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ECHS1P30084 LINC00221-201ENST00000603633 1656 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ECHS1P30084 SCNN1A-215ENST00000540037 3040 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ECHS1P30084 MAP3K3-203ENST00000577395 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ECHS1P30084 MLLT3-210ENST00000630269 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ECHS1P30084 DUSP26-203ENST00000523956 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ECHS1P30084 CAP2-209ENST00000616440 2776 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ECHS1P30084 DRD5P1-201ENST00000456605 1438 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
ECHS1P30084 PAPSS2-201ENST00000361175 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ECHS1P30084 CCDC57-203ENST00000392343 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ECHS1P30084 KIF17-201ENST00000247986 3969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ECHS1P30084 MARK1-201ENST00000366917 2946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
ECHS1P30084 TCAF2-202ENST00000411935 2906 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
ECHS1P30084 AC019294.4-201ENST00000561777 2905 ntBASIC15.33■□□□□ 0.05
ECHS1P30084 KIF3A-202ENST00000378746 6325 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
ECHS1P30084 DISC1-209ENST00000439617 7059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
ECHS1P30084 FAM156A-221ENST00000622447 3757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
ECHS1P30084 ARL5B-201ENST00000377275 7196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
ECHS1P30084 FKBP6-202ENST00000413573 1507 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
ECHS1P30084 SLITRK2-202ENST00000370490 7672 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.05
ECHS1P30084 CYP20A1-201ENST00000356079 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
ECHS1P30084 BCAN-201ENST00000329117 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
ECHS1P30084 C4A-243ENST00000428956 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
ECHS1P30084 C4B-202ENST00000435363 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
ECHS1P30084 AL139193.2-201ENST00000553712 1954 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
ECHS1P30084 AHDC1-201ENST00000247087 6334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
ECHS1P30084 INHBA-203ENST00000442711 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ECHS1P30084 AVL9-201ENST00000318709 6982 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ECHS1P30084 KCNT1-209ENST00000490355 3708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ECHS1P30084 AC051649.2-201ENST00000640310 3319 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ECHS1P30084 SIGLEC9-201ENST00000250360 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ECHS1P30084 PDE3A-201ENST00000359062 7576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ECHS1P30084 MRPL58-201ENST00000301585 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ECHS1P30084 LRRC37A5P-201ENST00000374304 1103 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ECHS1P30084 PSMB9-207ENST00000374859 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ECHS1P30084 PSMB9-208ENST00000395330 792 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ECHS1P30084 MIR940-201ENST00000401276 94 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
ECHS1P30084 TAS2R41-201ENST00000408916 924 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ECHS1P30084 RPP21-221ENST00000428040 594 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ECHS1P30084 LINC00899-202ENST00000444890 493 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ECHS1P30084 AL356441.1-201ENST00000452618 492 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ECHS1P30084 ALAS1-204ENST00000469224 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ECHS1P30084 SDHAP3-202ENST00000515467 728 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
ECHS1P30084 BCAT2-203ENST00000545387 1272 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ECHS1P30084 NDUFS7-216ENST00000546283 1060 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ECHS1P30084 AL138828.2-201ENST00000615812 383 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
ECHS1P30084 CHD1L-211ENST00000639534 1144 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ECHS1P30084 HNRNPA0-201ENST00000314940 8726 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ECHS1P30084 ACADM-202ENST00000370841 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ECHS1P30084 RMDN1-201ENST00000406452 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ECHS1P30084 SYCP2L-201ENST00000283141 3130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ECHS1P30084 AL157996.1-201ENST00000624684 2299 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
ECHS1P30084 BCL2L2-PABPN1-203ENST00000557008 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ECHS1P30084 ERG-207ENST00000398919 1868 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ECHS1P30084 PER1-201ENST00000317276 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ECHS1P30084 RNF167-201ENST00000262482 1915 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ECHS1P30084 MVB12B-201ENST00000361171 4819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ECHS1P30084 TGFBR3-204ENST00000465892 2908 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ECHS1P30084 PDE8A-203ENST00000394553 3912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ECHS1P30084 HIST2H2BF-201ENST00000369167 1954 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ECHS1P30084 CTNND2-202ENST00000458100 1962 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ECHS1P30084 P2RX5-TAX1BP3-201ENST00000550383 5905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ECHS1P30084 TJP2-208ENST00000535702 3984 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ECHS1P30084 LINC01648-201ENST00000445180 1519 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ECHS1P30084 AC008125.1-201ENST00000548488 1538 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ECHS1P30084 ZCCHC17-206ENST00000616393 1534 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ECHS1P30084 STK33-203ENST00000396672 2558 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ECHS1P30084 ERICH6-201ENST00000295910 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ECHS1P30084 FAM86B1-203ENST00000448228 2096 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ECHS1P30084 SLC22A20-202ENST00000525437 3196 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ECHS1P30084 SH3BP5L-201ENST00000366472 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ECHS1P30084 CAMLG-201ENST00000297156 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ECHS1P30084 DEF8-210ENST00000563594 4450 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ECHS1P30084 NIPAL3-203ENST00000358028 1757 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ECHS1P30084 REC8-213ENST00000620473 2405 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ECHS1P30084 KIAA0513-207ENST00000567328 1873 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ECHS1P30084 WDR5-201ENST00000358625 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ECHS1P30084 ALAD-201ENST00000409155 3173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52 ms