Protein–RNA interactions for Protein: P21953

BCKDHB, 2-oxoisovalerate dehydrogenase subunit beta, mitochondrial, humanhuman

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Length 392 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BCKDHBP21953 AL845331.2-201ENST00000561882 1044 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
BCKDHBP21953 NAT9-220ENST00000582870 896 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
BCKDHBP21953 KLF3-AS1-207ENST00000620339 558 ntTSL 4 BASIC14.72□□□□□ -0.05
BCKDHBP21953 DNAJC2-203ENST00000379263 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
BCKDHBP21953 GOSR2-203ENST00000415811 2171 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
BCKDHBP21953 AP2A2-201ENST00000332231 4656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
BCKDHBP21953 CBWD5-204ENST00000377392 2863 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
BCKDHBP21953 NSFL1C-201ENST00000216879 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
BCKDHBP21953 COL26A1-201ENST00000313669 3033 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
BCKDHBP21953 ZNF628-201ENST00000391718 3177 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
BCKDHBP21953 UNC5D-203ENST00000416672 3532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
BCKDHBP21953 GLS2-201ENST00000311966 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
BCKDHBP21953 DLEU2-201ENST00000235290 1739 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
BCKDHBP21953 HMBOX1-210ENST00000523613 1730 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
BCKDHBP21953 SHISA6-204ENST00000441885 7575 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
BCKDHBP21953 TARBP2-203ENST00000456234 1368 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
BCKDHBP21953 ZNF333-209ENST00000601134 1392 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
BCKDHBP21953 ZNF7-202ENST00000446747 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
BCKDHBP21953 SERF2-201ENST00000249786 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
BCKDHBP21953 TEX28-203ENST00000617225 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
BCKDHBP21953 TBC1D10B-201ENST00000409939 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
BCKDHBP21953 CTSB-228ENST00000533455 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
BCKDHBP21953 AFTPH-202ENST00000238856 4040 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
BCKDHBP21953 TMEM258-207ENST00000543510 1692 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
BCKDHBP21953 NOVA2-201ENST00000263257 7803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
BCKDHBP21953 AC245100.1-201ENST00000452996 1331 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
BCKDHBP21953 ZNF672-201ENST00000306562 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
BCKDHBP21953 PRSS50-201ENST00000460241 2960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
BCKDHBP21953 NAP1L4-222ENST00000620138 2479 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
BCKDHBP21953 HMGXB3-202ENST00000503427 5275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
BCKDHBP21953 ZNF134-201ENST00000396161 4914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
BCKDHBP21953 ZDHHC4-204ENST00000396709 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
BCKDHBP21953 INHBA-203ENST00000442711 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
BCKDHBP21953 ZNF786-202ENST00000491431 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
BCKDHBP21953 CLIC5-208ENST00000544153 2051 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
BCKDHBP21953 ATP5H-201ENST00000301587 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
BCKDHBP21953 HIST1H1B-201ENST00000331442 681 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.05
BCKDHBP21953 CXCL12-202ENST00000374426 470 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
BCKDHBP21953 BX284668.5-201ENST00000422124 406 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
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BCKDHBP21953 MSRB3-206ENST00000535664 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
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BCKDHBP21953 RNASEK-210ENST00000593646 566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
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BCKDHBP21953 RGR-202ENST00000359452 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
BCKDHBP21953 ARHGEF16-202ENST00000378373 2211 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
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BCKDHBP21953 MPIG6B-204ENST00000375809 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
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BCKDHBP21953 COL26A1-203ENST00000613501 2970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
BCKDHBP21953 RMND1-202ENST00000367303 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
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BCKDHBP21953 TMEM40-204ENST00000435218 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
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BCKDHBP21953 PDE1C-201ENST00000321453 2898 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.06
BCKDHBP21953 SHQ1-201ENST00000325599 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
BCKDHBP21953 VAV3-210ENST00000527011 4510 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
BCKDHBP21953 ACTN2-207ENST00000546208 5103 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
BCKDHBP21953 PAPD5-202ENST00000436909 4635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
BCKDHBP21953 CREB3L2-204ENST00000456390 2360 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
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BCKDHBP21953 LINC01165-201ENST00000445190 1623 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
BCKDHBP21953 SMTNL1-202ENST00000527972 1649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
BCKDHBP21953 MAP2K7-201ENST00000397979 3361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
BCKDHBP21953 PLXNC1-201ENST00000258526 7346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
BCKDHBP21953 HYAL1-202ENST00000320295 2324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
BCKDHBP21953 TRIM24-202ENST00000415680 3799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
BCKDHBP21953 DPP6-203ENST00000404039 4798 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
BCKDHBP21953 STAT6-225ENST00000640254 2037 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
BCKDHBP21953 TUBGCP2-204ENST00000417178 4029 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
BCKDHBP21953 SGO1-203ENST00000412997 2587 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
BCKDHBP21953 FOXP1-218ENST00000498215 2400 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
BCKDHBP21953 SVOPL-201ENST00000288513 1413 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
BCKDHBP21953 CDKN1A-203ENST00000405375 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
BCKDHBP21953 PCDHGA11-202ENST00000518882 2263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
BCKDHBP21953 PON3-201ENST00000265627 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
BCKDHBP21953 EWSR1-204ENST00000333395 1265 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
BCKDHBP21953 AL583805.1-201ENST00000391389 531 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
BCKDHBP21953 NME2-201ENST00000393183 568 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
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