Protein–RNA interactions for Protein: P13164

IFITM1, Interferon-induced transmembrane protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 125 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFITM1P13164 SMIM10L1-201ENST00000622602 4795 ntAPPRIS P1 BASIC10.22□□□□□ -0.77
IFITM1P13164 FBXO22-201ENST00000308275 10725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
IFITM1P13164 OSBP2-219ENST00000535268 3248 ntTSL 2 BASIC10.22□□□□□ -0.77
IFITM1P13164 ZNF142-205ENST00000449707 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
IFITM1P13164 AC010327.3-201ENST00000591665 1643 ntTSL 2 BASIC10.22□□□□□ -0.77
IFITM1P13164 PCDHGB7-202ENST00000612073 2785 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.22□□□□□ -0.77
IFITM1P13164 NFE2-201ENST00000312156 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
IFITM1P13164 CTR9-201ENST00000361367 4586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
IFITM1P13164 ADAMTSL1-205ENST00000380548 8030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
IFITM1P13164 GPR68-204ENST00000535815 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
IFITM1P13164 SPTBN2-210ENST00000611817 2890 ntTSL 2 BASIC10.22□□□□□ -0.77
IFITM1P13164 HK2-201ENST00000290573 5772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
IFITM1P13164 BEND6-203ENST00000370748 3497 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
IFITM1P13164 DMBT1-201ENST00000330163 5802 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
IFITM1P13164 DMBT1-206ENST00000368956 5802 ntTSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
IFITM1P13164 CMPK1-203ENST00000371873 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
IFITM1P13164 PLCD1-204ENST00000463876 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.22□□□□□ -0.77
IFITM1P13164 SGMS1-203ENST00000429490 3634 ntTSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
IFITM1P13164 OPN4-202ENST00000372071 2401 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
IFITM1P13164 COL3A1-201ENST00000304636 5543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
IFITM1P13164 SUPV3L1-201ENST00000359655 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
IFITM1P13164 PHACTR2-202ENST00000367582 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
IFITM1P13164 SNHG28-201ENST00000368102 2501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.22□□□□□ -0.77
IFITM1P13164 AC015921.1-201ENST00000574885 2546 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
IFITM1P13164 HRCT1-201ENST00000354323 950 ntAPPRIS P1 BASIC10.22□□□□□ -0.77
IFITM1P13164 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC10.22□□□□□ -0.77
IFITM1P13164 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
IFITM1P13164 AL157935.1-209ENST00000415141 1105 ntTSL 2 BASIC10.22□□□□□ -0.77
IFITM1P13164 IGF2-206ENST00000418738 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
IFITM1P13164 FAM185BP-201ENST00000443595 716 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
IFITM1P13164 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
IFITM1P13164 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
IFITM1P13164 AC135776.2-201ENST00000567803 714 ntTSL 4 BASIC10.22□□□□□ -0.77
IFITM1P13164 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC10.22□□□□□ -0.77
IFITM1P13164 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
IFITM1P13164 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.22□□□□□ -0.77
IFITM1P13164 MTDHP4-201ENST00000600287 670 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
IFITM1P13164 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC10.22□□□□□ -0.77
IFITM1P13164 AC097359.3-201ENST00000603982 1210 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
IFITM1P13164 SBK3-202ENST00000612221 1270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
IFITM1P13164 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
IFITM1P13164 CHST13-202ENST00000615522 1146 ntTSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
IFITM1P13164 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
IFITM1P13164 CLK4-201ENST00000316308 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
IFITM1P13164 KIFC3-204ENST00000465878 3225 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
IFITM1P13164 RBM15-202ENST00000487146 3316 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
IFITM1P13164 BRAP-202ENST00000419234 4026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
IFITM1P13164 PRR30-201ENST00000335524 2008 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
IFITM1P13164 FAM49B-201ENST00000401979 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.22□□□□□ -0.77
IFITM1P13164 TNRC6C-205ENST00000588061 8419 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
IFITM1P13164 SRPRB-201ENST00000466490 2827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
IFITM1P13164 CACNA1C-231ENST00000616390 2833 ntTSL 2 BASIC10.22□□□□□ -0.77
IFITM1P13164 AC012184.2-203ENST00000443119 2110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
IFITM1P13164 PLOD2-202ENST00000360060 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
IFITM1P13164 HPSE-207ENST00000513463 1458 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
IFITM1P13164 SPHK2-201ENST00000245222 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
IFITM1P13164 C5AR2-201ENST00000595464 6746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
IFITM1P13164 PML-210ENST00000563500 4502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
IFITM1P13164 HEY1-202ENST00000354724 2293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
IFITM1P13164 MSC-AS1-208ENST00000522519 1537 ntTSL 2 BASIC10.22□□□□□ -0.77
IFITM1P13164 KCNMA1-285ENST00000640605 3864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
IFITM1P13164 RHD-202ENST00000342055 1557 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
IFITM1P13164 LINC00940-201ENST00000418006 2350 ntTSL 2 BASIC10.22□□□□□ -0.77
IFITM1P13164 SIRPA-202ENST00000358771 3996 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
IFITM1P13164 MAGEF1-201ENST00000317897 1636 ntAPPRIS P1 BASIC10.22□□□□□ -0.77
IFITM1P13164 EIF4E1B-203ENST00000504597 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
IFITM1P13164 CFAP65-208ENST00000453220 5877 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
IFITM1P13164 CACNA2D4-220ENST00000585732 2566 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
IFITM1P13164 SLC22A5-203ENST00000435065 1746 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
IFITM1P13164 ADAMTSL4-203ENST00000369039 4319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
IFITM1P13164 PRKAR1A-203ENST00000392711 4327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
IFITM1P13164 KCNS2-202ENST00000521839 4340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
IFITM1P13164 PDE7B-203ENST00000615259 5234 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
IFITM1P13164 SPOCK2-201ENST00000317376 5328 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
IFITM1P13164 B3GNTL1-211ENST00000576599 1787 ntTSL 2 BASIC10.21□□□□□ -0.77
IFITM1P13164 AKAP13-202ENST00000394510 9128 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
IFITM1P13164 CPT1C-204ENST00000405931 2785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
IFITM1P13164 CACNA1C-214ENST00000399634 7590 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
IFITM1P13164 CACNA1C-222ENST00000406454 7590 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
IFITM1P13164 PDGFRL-201ENST00000251630 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
IFITM1P13164 AC007603.1-201ENST00000563124 2085 ntTSL 2 BASIC10.21□□□□□ -0.77
IFITM1P13164 MLXIPL-205ENST00000429400 3173 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
IFITM1P13164 SRRM4-201ENST00000267260 8477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
IFITM1P13164 UCK1-203ENST00000372211 2114 ntTSL 3 BASIC10.21□□□□□ -0.77
IFITM1P13164 AL365181.3-201ENST00000605886 3222 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
IFITM1P13164 CDKL3-206ENST00000521118 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
IFITM1P13164 PRKD1-209ENST00000616995 3498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
IFITM1P13164 STXBP5L-201ENST00000273666 9496 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
IFITM1P13164 FRMD4B-201ENST00000398540 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
IFITM1P13164 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
IFITM1P13164 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
IFITM1P13164 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
IFITM1P13164 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
IFITM1P13164 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
IFITM1P13164 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC10.21□□□□□ -0.77
IFITM1P13164 STOML1-203ENST00000359750 984 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
IFITM1P13164 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
IFITM1P13164 AL354836.1-201ENST00000414042 681 ntTSL 2 BASIC10.21□□□□□ -0.77
IFITM1P13164 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
IFITM1P13164 ARPC4-203ENST00000433034 926 ntTSL 3 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.2 ms