Protein–RNA interactions for Protein: P0C0L5

C4B, Complement C4-B, humanhuman

Predictions only

Length 1,744 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C4BP0C0L5 CROT-201ENST00000331536 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
C4BP0C0L5 GPR84-201ENST00000267015 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
C4BP0C0L5 MAGEA12-202ENST00000393869 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
C4BP0C0L5 KCTD6-202ENST00000404589 1533 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
C4BP0C0L5 SSBP1-201ENST00000265304 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
C4BP0C0L5 LCE2C-201ENST00000368783 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
C4BP0C0L5 AL355803.1-201ENST00000455524 188 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
C4BP0C0L5 RPL18AP8-201ENST00000486071 528 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
C4BP0C0L5 ROPN1B-203ENST00000505382 713 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
C4BP0C0L5 AC105219.2-201ENST00000527908 299 ntTSL 4 BASIC18.51■□□□□ 0.55
C4BP0C0L5 TUBB3-208ENST00000555576 572 ntTSL 4 BASIC18.51■□□□□ 0.55
C4BP0C0L5 TXNDC17-208ENST00000574838 746 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
C4BP0C0L5 AC079325.2-201ENST00000641710 606 ntAPPRIS P5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
C4BP0C0L5 AC008741.2-201ENST00000612792 3115 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
C4BP0C0L5 TRMT11-201ENST00000334379 1565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
C4BP0C0L5 ING4-207ENST00000446105 1348 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
C4BP0C0L5 FYN-205ENST00000368682 3234 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
C4BP0C0L5 CDC42EP4-201ENST00000335793 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
C4BP0C0L5 FAM90A21P-201ENST00000510875 1396 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
C4BP0C0L5 FAM90A15P-201ENST00000514465 1395 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
C4BP0C0L5 FAM90A6P-201ENST00000515148 1394 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
C4BP0C0L5 FAM90A16P-201ENST00000526662 1395 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
C4BP0C0L5 FAM90A9P-201ENST00000527940 1395 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
C4BP0C0L5 FAM90A5P-201ENST00000528738 1395 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
C4BP0C0L5 FAM90A14P-201ENST00000530386 1395 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
C4BP0C0L5 FAM90A13P-201ENST00000534703 1395 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
C4BP0C0L5 AL513315.1-201ENST00000640756 1370 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
C4BP0C0L5 CDH15-201ENST00000289746 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
C4BP0C0L5 MBP-204ENST00000382582 2281 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
C4BP0C0L5 DPP6-202ENST00000377770 3710 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
C4BP0C0L5 ARHGEF3-212ENST00000495373 2024 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
C4BP0C0L5 FOLH1-201ENST00000256999 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
C4BP0C0L5 KHSRPP1-201ENST00000427983 1768 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
C4BP0C0L5 B3GNTL1-211ENST00000576599 1787 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
C4BP0C0L5 YWHAE-208ENST00000571732 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
C4BP0C0L5 KIR3DL2-201ENST00000270442 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
C4BP0C0L5 AC138761.4-201ENST00000578881 1514 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
C4BP0C0L5 GFOD1-206ENST00000612338 2481 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
C4BP0C0L5 TBXAS1-201ENST00000336425 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
C4BP0C0L5 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
C4BP0C0L5 PSMC3-213ENST00000619920 1580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
C4BP0C0L5 MLF1-201ENST00000355893 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
C4BP0C0L5 FMC1-201ENST00000297534 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
C4BP0C0L5 COX14-201ENST00000317943 708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
C4BP0C0L5 IGF2-201ENST00000381389 1023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
C4BP0C0L5 CTHRC1-202ENST00000415886 571 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
C4BP0C0L5 ACTBP7-201ENST00000418351 1124 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
C4BP0C0L5 LINC00686-201ENST00000435412 332 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
C4BP0C0L5 ZSCAN2-208ENST00000485222 910 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
C4BP0C0L5 AC022858.1-202ENST00000521084 393 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
C4BP0C0L5 ZSCAN2-210ENST00000538076 1109 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
C4BP0C0L5 ZNF268-210ENST00000541211 781 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
C4BP0C0L5 SNHG21-204ENST00000559366 674 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
C4BP0C0L5 SNHG25-202ENST00000582965 278 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
C4BP0C0L5 FBXO16-202ENST00000380254 1343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
C4BP0C0L5 DUS2-207ENST00000565263 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
C4BP0C0L5 AC007495.1-201ENST00000501259 2678 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
C4BP0C0L5 NKIRAS1-208ENST00000443659 2391 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
C4BP0C0L5 THUMPD3-210ENST00000515662 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
C4BP0C0L5 ACOT7-210ENST00000608083 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
C4BP0C0L5 CD5L-201ENST00000368174 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
C4BP0C0L5 PXYLP1-201ENST00000286353 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
C4BP0C0L5 ERCC1-208ENST00000589165 1453 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
C4BP0C0L5 ECSIT-201ENST00000252440 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
C4BP0C0L5 LINC00339-208ENST00000634934 1518 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
C4BP0C0L5 ZNF32-AS3-201ENST00000458063 1932 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
C4BP0C0L5 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
C4BP0C0L5 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
C4BP0C0L5 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
C4BP0C0L5 PCDHGC5-202ENST00000610789 2763 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
C4BP0C0L5 PBX1-219ENST00000560641 3225 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
C4BP0C0L5 HHEX-202ENST00000472590 1605 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
C4BP0C0L5 STK17A-201ENST00000319357 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
C4BP0C0L5 MBD3L3-201ENST00000333843 775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
C4BP0C0L5 MAPK13-202ENST00000373759 1036 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
C4BP0C0L5 AL935212.1-201ENST00000377548 906 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
C4BP0C0L5 MBD3L4-201ENST00000381394 775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
C4BP0C0L5 GAS5-209ENST00000430245 723 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
C4BP0C0L5 ATP1A4-205ENST00000470705 886 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
C4BP0C0L5 ANAPC15-204ENST00000535234 848 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
C4BP0C0L5 NACA-221ENST00000552540 1074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
C4BP0C0L5 SNHG15-205ENST00000580458 710 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
C4BP0C0L5 FXYD3-204ENST00000603181 758 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
C4BP0C0L5 WDR45B-201ENST00000392325 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
C4BP0C0L5 ABHD18-202ENST00000398965 2177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
C4BP0C0L5 MC1R-202ENST00000555147 3099 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
C4BP0C0L5 ARMCX6-207ENST00000538627 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
C4BP0C0L5 LRIT1-201ENST00000372105 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
C4BP0C0L5 CD19-201ENST00000324662 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
C4BP0C0L5 PXK-204ENST00000383716 3035 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
C4BP0C0L5 LTF-202ENST00000417439 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
C4BP0C0L5 BMP2K-201ENST00000335016 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
C4BP0C0L5 ACTG1P17-202ENST00000560958 1662 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
C4BP0C0L5 SSR4P1-203ENST00000599569 2260 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
C4BP0C0L5 AC010424.3-201ENST00000635510 1745 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
C4BP0C0L5 CD8A-201ENST00000283635 2873 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
C4BP0C0L5 AC004834.1-201ENST00000640784 2412 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
C4BP0C0L5 FLAD1-205ENST00000368431 1803 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
C4BP0C0L5 RNF157-AS1-204ENST00000590137 1812 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
C4BP0C0L5 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
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