Protein–RNA interactions for Protein: O95273

CCNDBP1, Cyclin-D1-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 360 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNDBP1O95273 E2F6-211ENST00000542100 3450 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
CCNDBP1O95273 ENO3-206ENST00000519584 1322 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
CCNDBP1O95273 C5orf38-207ENST00000515640 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
CCNDBP1O95273 OXTR-201ENST00000316793 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CCNDBP1O95273 PES1-204ENST00000402284 2144 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
CCNDBP1O95273 HTR3E-202ENST00000415389 2139 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CCNDBP1O95273 LINC00691-201ENST00000432505 2232 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CCNDBP1O95273 AQP6-204ENST00000615425 2245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
CCNDBP1O95273 DMTN-205ENST00000432128 2508 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
CCNDBP1O95273 PKN2-201ENST00000316005 2632 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
CCNDBP1O95273 MTRF1L-201ENST00000367230 3431 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CCNDBP1O95273 NWD2-201ENST00000309447 8325 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
CCNDBP1O95273 GPAT4-201ENST00000396987 6298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CCNDBP1O95273 PDZD3-212ENST00000531114 2996 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
CCNDBP1O95273 SLCO6A1-205ENST00000506729 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CCNDBP1O95273 AC009053.1-204ENST00000429810 2355 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
CCNDBP1O95273 CHEK2-204ENST00000382580 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CCNDBP1O95273 CAMSAP1-203ENST00000409386 5730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
CCNDBP1O95273 ABCC9-203ENST00000326684 1693 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CCNDBP1O95273 LINC00094-204ENST00000599836 1689 ntAPPRIS P5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
CCNDBP1O95273 ARFIP1-204ENST00000429148 1599 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
CCNDBP1O95273 KRTAP10-7-201ENST00000609664 1578 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
CCNDBP1O95273 ZNRD1-201ENST00000332435 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CCNDBP1O95273 VHLL-201ENST00000339922 676 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
CCNDBP1O95273 S100A16-201ENST00000368703 946 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
CCNDBP1O95273 C1orf68-201ENST00000368775 949 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
CCNDBP1O95273 C10orf35-201ENST00000373279 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CCNDBP1O95273 AC005229.1-201ENST00000392885 409 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
CCNDBP1O95273 TPM1-207ENST00000403994 1049 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CCNDBP1O95273 AC243836.1-201ENST00000416696 438 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
CCNDBP1O95273 AC005034.1-201ENST00000426657 489 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
CCNDBP1O95273 PNKD-204ENST00000436005 978 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
CCNDBP1O95273 AC093879.1-201ENST00000508959 1176 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
CCNDBP1O95273 AC090735.1-201ENST00000523881 488 ntTSL 4 BASIC14.66□□□□□ -0.06
CCNDBP1O95273 AC100818.1-201ENST00000524167 563 ntTSL 4 BASIC14.66□□□□□ -0.06
CCNDBP1O95273 CD4-210ENST00000541982 1187 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CCNDBP1O95273 AC008735.3-201ENST00000596646 500 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
CCNDBP1O95273 AC233724.13-201ENST00000598383 410 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
CCNDBP1O95273 FP565260.6-205ENST00000624120 898 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CCNDBP1O95273 SLC35A2-204ENST00000376521 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CCNDBP1O95273 C16orf52-202ENST00000542527 4360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
CCNDBP1O95273 PLEKHN1-203ENST00000379410 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CCNDBP1O95273 SYMPK-213ENST00000599460 5449 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CCNDBP1O95273 UHRF1BP1-202ENST00000452449 4706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
CCNDBP1O95273 PITX2-205ENST00000394598 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CCNDBP1O95273 HDAC11-201ENST00000295757 2960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CCNDBP1O95273 TEAD3-201ENST00000338863 2983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CCNDBP1O95273 TPGS2-201ENST00000334295 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CCNDBP1O95273 POU5F1-204ENST00000471529 1723 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CCNDBP1O95273 CSDC2-201ENST00000306149 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CCNDBP1O95273 ZFR2-201ENST00000262961 4756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
CCNDBP1O95273 SLC22A7-202ENST00000372585 2555 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
CCNDBP1O95273 CHRDL1-205ENST00000482160 1537 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
CCNDBP1O95273 ATP11B-201ENST00000323116 7325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
CCNDBP1O95273 PDPK1-202ENST00000342085 7241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CCNDBP1O95273 CYB561D1-204ENST00000420578 3326 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CCNDBP1O95273 EYA4-205ENST00000430974 2364 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
CCNDBP1O95273 AC063926.2-201ENST00000623766 1308 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
CCNDBP1O95273 SEPT9-208ENST00000541152 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CCNDBP1O95273 PBX3-203ENST00000373487 2902 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CCNDBP1O95273 SLC38A10-202ENST00000374759 4300 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CCNDBP1O95273 RCOR2-201ENST00000301459 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CCNDBP1O95273 PRSS8-201ENST00000317508 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CCNDBP1O95273 CASQ1-201ENST00000368078 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CCNDBP1O95273 TTC13-201ENST00000366661 3253 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CCNDBP1O95273 ZNF384-202ENST00000355772 2514 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CCNDBP1O95273 NAA60-229ENST00000575076 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CCNDBP1O95273 AC009961.1-203ENST00000607836 2520 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CCNDBP1O95273 PPM1F-202ENST00000397495 1778 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CCNDBP1O95273 GPRASP1-205ENST00000537097 5980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CCNDBP1O95273 GSG1L-203ENST00000447459 4916 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CCNDBP1O95273 AKNA-206ENST00000374088 5464 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CCNDBP1O95273 CAMLG-201ENST00000297156 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CCNDBP1O95273 RIOX2-202ENST00000360258 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CCNDBP1O95273 RAI2-204ENST00000451717 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CCNDBP1O95273 ZFYVE28-210ENST00000515169 1590 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CCNDBP1O95273 CTSD-211ENST00000637387 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CCNDBP1O95273 C3-201ENST00000245907 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CCNDBP1O95273 MAP3K4-201ENST00000348824 5295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CCNDBP1O95273 AC067750.1-201ENST00000608826 6545 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
CCNDBP1O95273 PDZD4-201ENST00000164640 3689 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CCNDBP1O95273 TEAD4-203ENST00000397122 1396 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CCNDBP1O95273 ARC-201ENST00000356613 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CCNDBP1O95273 AGAP4-208ENST00000618171 2387 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CCNDBP1O95273 APOA1-204ENST00000375323 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CCNDBP1O95273 EIF1AX-201ENST00000379593 765 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CCNDBP1O95273 RPL28-203ENST00000428193 573 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CCNDBP1O95273 RPL28-204ENST00000431533 590 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CCNDBP1O95273 C19orf24-202ENST00000469144 668 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CCNDBP1O95273 LEPROTL1-204ENST00000518192 847 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CCNDBP1O95273 SLC25A47P1-201ENST00000531577 414 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
CCNDBP1O95273 CCKBR-204ENST00000531712 463 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CCNDBP1O95273 IL32-222ENST00000533097 814 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CCNDBP1O95273 RPL28-207ENST00000558815 616 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CCNDBP1O95273 APRT-204ENST00000563655 709 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CCNDBP1O95273 AC007611.1-201ENST00000568150 826 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CCNDBP1O95273 MALAT1-211ENST00000617791 394 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CCNDBP1O95273 RPSAP52-203ENST00000622976 1023 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
CCNDBP1O95273 IL32-201ENST00000008180 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CCNDBP1O95273 CICP14-201ENST00000629111 2732 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 82.1 ms