Protein–RNA interactions for Protein: O60488

ACSL4, Long-chain-fatty-acid--CoA ligase 4, humanhuman

Predictions only

Length 711 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACSL4O60488 FURIN-207ENST00000618099 4345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ACSL4O60488 ADAMTS13-201ENST00000355699 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ACSL4O60488 KCTD7-206ENST00000639828 5951 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ACSL4O60488 RCOR3-203ENST00000419091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ACSL4O60488 FBXO5-202ENST00000367241 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ACSL4O60488 PAK4-208ENST00000599386 5735 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ACSL4O60488 EPB41L3-203ENST00000400111 4259 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ACSL4O60488 KCNK4-TEX40-201ENST00000539086 2733 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ACSL4O60488 OCEL1-201ENST00000215061 1133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ACSL4O60488 LAMTOR4-201ENST00000341942 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ACSL4O60488 RUFY2-202ENST00000342616 983 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ACSL4O60488 PSTK-202ENST00000405485 1047 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ACSL4O60488 LINC01840-201ENST00000421870 571 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ACSL4O60488 AC006487.1-201ENST00000514506 1221 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ACSL4O60488 AC011365.2-201ENST00000520041 810 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ACSL4O60488 RNF41-210ENST00000552244 716 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ACSL4O60488 AC012568.1-201ENST00000558463 472 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ACSL4O60488 AC008403.1-201ENST00000595676 443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ACSL4O60488 CR381653.1-201ENST00000622961 812 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ACSL4O60488 AP001002.3-201ENST00000623482 206 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
ACSL4O60488 LINC01205-202ENST00000497996 1493 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ACSL4O60488 HORMAD1-201ENST00000322343 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ACSL4O60488 GHDC-207ENST00000587427 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ACSL4O60488 MPP6-201ENST00000222644 8452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ACSL4O60488 PARD3B-204ENST00000406610 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ACSL4O60488 AC009961.1-203ENST00000607836 2520 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ACSL4O60488 ZMYND15-204ENST00000573751 2409 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ACSL4O60488 AK4-202ENST00000395334 6998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ACSL4O60488 F2-201ENST00000311907 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ACSL4O60488 TNFSF13-202ENST00000349228 2036 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ACSL4O60488 SLC36A1-207ENST00000520701 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ACSL4O60488 MAEL-202ENST00000367872 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ACSL4O60488 SMYD1-203ENST00000444564 1816 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ACSL4O60488 YWHAE-208ENST00000571732 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ACSL4O60488 MAGEA2B-202ENST00000370293 1714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ACSL4O60488 SNX14-215ENST00000513865 2259 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ACSL4O60488 ADPRHL1-201ENST00000356501 1877 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ACSL4O60488 MBD1-217ENST00000588937 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ACSL4O60488 PTK6-202ENST00000542869 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ACSL4O60488 GTF3C4-201ENST00000372146 9043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ACSL4O60488 CYP1A1-203ENST00000395049 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ACSL4O60488 AHDC1-201ENST00000247087 6334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ACSL4O60488 RSPO1-202ENST00000401068 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ACSL4O60488 FIS1-201ENST00000223136 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ACSL4O60488 TREM2-203ENST00000373122 1012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ACSL4O60488 HIST1H2AH-201ENST00000377459 387 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ACSL4O60488 AF274855.1-203ENST00000424126 800 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ACSL4O60488 LINC01248-201ENST00000458264 468 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ACSL4O60488 SNHG12-210ENST00000483436 682 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ACSL4O60488 LILRA5-204ENST00000486742 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ACSL4O60488 AC092944.1-202ENST00000487238 483 ntTSL 4 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ACSL4O60488 PRSS30P-204ENST00000489864 650 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ACSL4O60488 AC108725.1-201ENST00000495472 409 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
ACSL4O60488 AC100850.1-201ENST00000506768 649 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
ACSL4O60488 AC009908.1-201ENST00000523030 412 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ACSL4O60488 AP003096.1-203ENST00000564469 563 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ACSL4O60488 AC007342.4-201ENST00000566383 584 ntTSL 4 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ACSL4O60488 TXNDC17-202ENST00000570330 459 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ACSL4O60488 AC108134.4-201ENST00000570700 302 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ACSL4O60488 AL358472.3-201ENST00000608147 415 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
ACSL4O60488 CERS3-202ENST00000394113 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ACSL4O60488 C4orf19-201ENST00000284437 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ACSL4O60488 GTF2IRD1-203ENST00000455841 3315 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ACSL4O60488 CCAR2-202ENST00000389279 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ACSL4O60488 FNDC1-201ENST00000297267 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ACSL4O60488 GBA2-202ENST00000378094 3757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ACSL4O60488 AC004805.1-201ENST00000577662 1616 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ACSL4O60488 GRAMD4-203ENST00000408031 2834 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ACSL4O60488 P2RX5-208ENST00000552050 1536 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ACSL4O60488 PARP16-201ENST00000261888 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ACSL4O60488 TUBB-206ENST00000330914 2632 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ACSL4O60488 CREB3L3-201ENST00000078445 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ACSL4O60488 SPAG6-201ENST00000313311 2421 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ACSL4O60488 LBHD1-201ENST00000354588 1320 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ACSL4O60488 REC8-209ENST00000611366 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ACSL4O60488 PDE4C-207ENST00000594617 4655 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ACSL4O60488 PXN-207ENST00000536957 4112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ACSL4O60488 FARS2-202ENST00000324331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ACSL4O60488 ALPL-207ENST00000540617 2131 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ACSL4O60488 CTNNBIP1-203ENST00000377263 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ACSL4O60488 TMCO5B-204ENST00000529696 1568 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ACSL4O60488 CIAPIN1-213ENST00000569370 1559 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ACSL4O60488 SEMA3G-201ENST00000231721 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ACSL4O60488 SHROOM1-201ENST00000319854 3190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ACSL4O60488 PLTP-201ENST00000354050 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ACSL4O60488 NF2-210ENST00000413209 4733 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ACSL4O60488 MRPL34-201ENST00000252602 968 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ACSL4O60488 CLRN1-203ENST00000328863 738 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ACSL4O60488 MAPK15-203ENST00000395108 765 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ACSL4O60488 MRPL23-204ENST00000397297 613 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ACSL4O60488 LIMS4-201ENST00000413601 1215 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ACSL4O60488 LINC01694-201ENST00000424569 821 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ACSL4O60488 ALG1L2-201ENST00000425059 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ACSL4O60488 HSPB1P2-201ENST00000448722 546 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
ACSL4O60488 AL591846.1-201ENST00000451736 433 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
ACSL4O60488 CHIA-209ENST00000483391 1188 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ACSL4O60488 GDNF-AS1-201ENST00000503382 604 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ACSL4O60488 AC020659.2-202ENST00000512295 513 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ACSL4O60488 TPD52L1-208ENST00000528193 789 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ACSL4O60488 USB1-203ENST00000539737 1212 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.1 ms