Protein–RNA interactions for Protein: O43889

CREB3, Cyclic AMP-responsive element-binding protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 395 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CREB3O43889 PTPA-220ENST00000436883 532 ntTSL 4 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CREB3O43889 LINC01336-201ENST00000503568 534 ntTSL 4 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CREB3O43889 AC013451.1-201ENST00000554552 518 ntTSL 4 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CREB3O43889 AP001063.1-201ENST00000568332 529 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
CREB3O43889 ANAPC11-216ENST00000579133 563 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CREB3O43889 AC111170.2-201ENST00000585369 768 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CREB3O43889 ATF5-205ENST00000600336 682 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CREB3O43889 AC015819.2-201ENST00000618730 555 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CREB3O43889 FP236240.1-202ENST00000624019 601 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CREB3O43889 NDUFV1-202ENST00000415352 1512 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CREB3O43889 CNOT9-208ENST00000542068 3259 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CREB3O43889 ATP2B3-202ENST00000349466 4280 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CREB3O43889 ST7L-202ENST00000358039 4528 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CREB3O43889 PCDHB8-201ENST00000239444 2740 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CREB3O43889 CICP24-201ENST00000605464 2705 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
CREB3O43889 KIF1C-201ENST00000320785 7919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CREB3O43889 KIRREL3-202ENST00000525704 2474 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CREB3O43889 CAMLG-201ENST00000297156 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CREB3O43889 AC026688.2-201ENST00000518984 1734 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CREB3O43889 GPR84-201ENST00000267015 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CREB3O43889 DTX3-202ENST00000548198 3199 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CREB3O43889 C11orf16-202ENST00000525780 1685 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CREB3O43889 LINC00094-204ENST00000599836 1689 ntAPPRIS P5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CREB3O43889 MYCN-202ENST00000638417 1693 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CREB3O43889 TJP3-207ENST00000589378 3068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CREB3O43889 CPSF7-205ENST00000439958 3524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CREB3O43889 COG8-206ENST00000306875 4247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CREB3O43889 PERM1-201ENST00000341290 3035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CREB3O43889 DUS2-207ENST00000565263 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CREB3O43889 RSPH6A-202ENST00000597055 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CREB3O43889 ZNF777-201ENST00000247930 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CREB3O43889 GOLGA5-201ENST00000163416 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CREB3O43889 GOLGA2-212ENST00000609374 2973 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CREB3O43889 HDHD3-201ENST00000238379 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CREB3O43889 AMT-202ENST00000395338 1831 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CREB3O43889 TM4SF19-AS1-203ENST00000452051 1829 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CREB3O43889 STEAP2-202ENST00000394621 7033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CREB3O43889 NOX3-201ENST00000159060 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CREB3O43889 RAB2A-201ENST00000262646 3848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CREB3O43889 ATP6V1H-202ENST00000359530 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CREB3O43889 TOR2A-202ENST00000373281 2477 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CREB3O43889 BRF1-211ENST00000547530 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CREB3O43889 KRT32-201ENST00000225899 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CREB3O43889 MAP3K4-201ENST00000348824 5295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CREB3O43889 TPM1-206ENST00000358278 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CREB3O43889 ANKLE1-201ENST00000394458 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CREB3O43889 PXN-221ENST00000637617 3246 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CREB3O43889 FYN-202ENST00000354650 3628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CREB3O43889 VCX2-201ENST00000317103 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CREB3O43889 LINC01116-202ENST00000339037 838 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CREB3O43889 MGST3-203ENST00000367885 680 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CREB3O43889 ADAMTSL1-208ENST00000380570 931 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CREB3O43889 HOPX-203ENST00000381255 1164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CREB3O43889 SZT2-AS1-201ENST00000396885 699 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CREB3O43889 AL139094.1-201ENST00000405549 1188 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
CREB3O43889 DGCR6-202ENST00000413981 1039 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CREB3O43889 KLF2P2-201ENST00000416807 1039 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
CREB3O43889 AC021188.1-201ENST00000421534 740 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CREB3O43889 SPATA3-204ENST00000433428 856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CREB3O43889 AC093433.1-201ENST00000458048 571 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
CREB3O43889 TAF8-206ENST00000472818 719 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CREB3O43889 KRBOX4-206ENST00000478600 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CREB3O43889 AC011495.1-201ENST00000498085 584 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
CREB3O43889 AC008378.1-201ENST00000521251 496 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CREB3O43889 LINC00824-206ENST00000523173 920 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CREB3O43889 HOPX-210ENST00000553379 1001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CREB3O43889 POLE2-203ENST00000553805 496 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CREB3O43889 HOPX-212ENST00000555760 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CREB3O43889 BX927359.1-201ENST00000556073 543 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CREB3O43889 HOPX-213ENST00000556376 1064 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CREB3O43889 AL596325.1-201ENST00000563991 1082 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
CREB3O43889 AC010319.3-201ENST00000597028 470 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
CREB3O43889 AP005019.2-201ENST00000615104 511 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
CREB3O43889 VCX-203ENST00000620630 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CREB3O43889 SRRD-201ENST00000215917 4020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CREB3O43889 SRSF8-201ENST00000587424 4028 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CREB3O43889 TNFRSF11A-206ENST00000617039 3756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CREB3O43889 HSD17B4-206ENST00000504811 2740 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CREB3O43889 CKM-201ENST00000221476 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CREB3O43889 MBD4-204ENST00000503197 2099 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CREB3O43889 GSN-203ENST00000373808 2664 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CREB3O43889 APOLD1-201ENST00000326765 4724 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CREB3O43889 KCNT1-208ENST00000488444 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CREB3O43889 GRIN2C-201ENST00000293190 4261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CREB3O43889 LHFPL4-201ENST00000287585 4880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CREB3O43889 IL9R-202ENST00000369423 2032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CREB3O43889 RTP1-201ENST00000312295 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CREB3O43889 SHTN1-204ENST00000392903 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CREB3O43889 MARS-201ENST00000262027 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CREB3O43889 CLPTM1-202ENST00000541297 2732 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CREB3O43889 RGS3-201ENST00000317613 2542 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CREB3O43889 RBM46-204ENST00000514866 2315 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CREB3O43889 LINC02212-201ENST00000515243 2130 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CREB3O43889 CTTN-202ENST00000346329 3272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CREB3O43889 RPRD1A-202ENST00000399022 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CREB3O43889 FGF7P3-202ENST00000640245 1707 ntTSL 4 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CREB3O43889 BRCC3-201ENST00000330045 2496 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CREB3O43889 ZNF607-201ENST00000355202 4364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CREB3O43889 CHST5-201ENST00000336257 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CREB3O43889 CLCN1-201ENST00000343257 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.9 ms